Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Tous les faits marquants
- sur l'intranet du département MathNum (Retrouvez sur cette page les faits marquants du département )
- sur l'intranet du département MICA (Retrouvez sur cette page les faits marquants du département)
2023
- StatInfOmics - Genoscapist, un outil d’exploration de profils quantitatifs le long des génomes
- Dynenvie - Un nouvel algorithme de machine learning pour l’inférence de modèles à variables latentes généraux : un levier pour la sélection variétale via des modèles de prédiction de phénotypes
- Dynenvie - Une approche d’apprentissage automatique met en évidence l’organisation des fonctions de dégradation des fibres et des mucines à l’échelle du microbiote intestinal.
- Dynenvie - Tester les composantes de la variance dans des modèles mixtes, du résultat théorique au package informatique : identifier des leviers d’action en amélioration des plantes
- StatInfOmics - Le programme de mentorat pour les doctorantes de Paris-Saclay : un franc succès depuis 5 ans !
- Dynenvie - Modèle de géométrie stochastique pour simuler des paysages agricoles
- Bibliome, Migale, StatInfOmics - Omnicrobe : un service d'agrégation de connaissance en microbiologie
- StatInfOmics - La protéine Rho contrôle l'entrée en phase stationnaire chez Bacillus subtilis
- Dynenvie - Challenge de modélisation en épidémiologie animale : comment se propage la peste porcine africaine ?
2022
2021
- StatInfOmics - Les bases moléculaires de l’adaptation d’une flavobactérie pathogène des poissons
- Migale - Former les biologistes et les bioinformaticiens : contribution INRAE à de nouvelles réponses de l’Institut Français de Bioinformatique
- BioSys - BiPSim: un simulateur stochastique flexible et générique des processus cellulaires
2020
2019
- StatInfOmics - Recommandations pour la préparation, le stockage et la gestion de transplants destinés au transfert de microbiote fécal (TMF)
- BioSys - Des modèles prédictifs à l’échelle du génome accessibles pour les bactéries
- Dynenvie - L’utilisation régionale des fongicides structure les dynamiques de résistance aux fongicides chez Zymoseptoria tritici, agent de la septoriose du blé
2018
- Bibliome - Colloques internationaux sur la modélisation multi-échelle des organismes vivants : des cellules, aux communautés de cellules jusqu’à la plante entière
- Bibliome - BiPON : Ontologie systémique pour décrire les processus biologiques
- Dynenvie - Modélisation de dynamiques démographiques et épidémiologiques sur un graphe de grande taille
- StatInfOmics - 10 ans d’études de la diversité génétique de la bactérie pathogène des poissons Flavobacterium psychrophilum
- Bibliome, Migale - Florilège, un service d'agrégation de connaissance en microbiologie des aliments
2017
- Bibliome - OpenMinTeD, une plateforme européenne pour des services de fouille de textes
- BioSys - L’allocation parcimonieuse des ressources au cœur de la définition des réseaux de régulation des cellules
- Dynenvie - Métamodélisation et analyse de sensibilité globale pour des modèles numériques avec des entrées corrélées : Approche pratique testée sur le modèle d'interception de la lumière par les plantes cultivées
- StatInfOmics - Détection de ruptures dans l’histoire évolutive à partir de données phénotypiques
2016
- Dynenvie - Une méthode d’inférence de Combinaison de Traits Fonctionnel Agrégés pour caractériser le potentiel fonctionnel d’un écosystème microbien à partir de données de métagénomique. Application à la dégradation des fibres par le microbiote intestinal humain.
- Bibliome - OntoBiotope, une révolution numérique en marche pour l'étude des habitats microbiens
2015
- Dynenvie - MTK - un package R pour unifier les démarches d'exploration numérique de modèles
- Dynenvie - Preuve de concept d'une approche de modélisation pour la gestion de la coexistence entre cultures OGM et non-OGM
- BioSys - Validation biologique de la méthode RBA – ou la mise à jour d’un principe général permet-tant la prédiction quantitative des composantes infra des cellules bactériennes à sa valida-tion biologique