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Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Accueil
Tous les faits marquants
sur l'
intranet du département MathNum
(Retrouvez sur cette page les faits marquants du département )
sur l'
intranet du département MICA
(Retrouvez sur cette page les faits marquants du département)
2023
StatInfOmics -
Genoscapist, un outil d’exploration de profils quantitatifs le long des génomes
Dynenvie -
Un nouvel algorithme de machine learning pour l’inférence de modèles à variables latentes généraux : un levier pour la sélection variétale via des modèles de prédiction de phénotypes
Dynenvie -
Une approche d’apprentissage automatique met en évidence l’organisation des fonctions de dégradation des fibres et des mucines à l’échelle du microbiote intestinal.
Dynenvie -
Tester les composantes de la variance dans des modèles mixtes, du résultat théorique au package informatique : identifier des leviers d’action en amélioration des plantes
StatInfOmics -
Le programme de mentorat pour les doctorantes de Paris-Saclay : un franc succès depuis 5 ans !
Dynenvie -
Modèle de géométrie stochastique pour simuler des paysages agricoles
Bibliome, Migale, StatInfOmics -
Omnicrobe : un service d'agrégation de connaissance en microbiologie
StatInfOmics -
La protéine Rho contrôle l'entrée en phase stationnaire chez Bacillus subtilis
Dynenvie -
Challenge de modélisation en épidémiologie animale : comment se propage la peste porcine africaine ?
2022
Migale -
ICEscreen : un nouvel outil pour détecter les éléments mobiles conjugatifs dans les gé- nomes bactériens et aider à comprendre la dissémination de gènes d’antibiorésistance
2021
StatInfOmics -
Les bases moléculaires de l’adaptation d’une flavobactérie pathogène des poissons
Migale -
Former les biologistes et les bioinformaticiens : contribution INRAE à de nouvelles réponses de l’Institut Français de Bioinformatique
BioSys -
BiPSim: un simulateur stochastique flexible et générique des processus cellulaires
2020
StatInfOmics -
Une nouvelle méthode pour la recherche de motifs de régulation chez les bactéries en intégrant des données transcriptomiques
2019
StatInfOmics -
Recommandations pour la préparation, le stockage et la gestion de transplants destinés au transfert de microbiote fécal (TMF)
Bibliome -
Des modèles prédictifs à l’échelle du génome accessibles pour les bactéries
Dynenvie -
L’utilisation régionale des fongicides structure les dynamiques de résistance aux fongicides chez Zymoseptoria tritici, agent de la septoriose du blé
2018
Bibliome -
Colloques internationaux sur la modélisation multi-échelle des organismes vivants : des cellules, aux communautés de cellules jusqu’à la plante entière
Bibliome -
BiPON : Ontologie systémique pour décrire les processus biologiques
Dynenvie -
Modélisation de dynamiques démographiques et épidémiologiques sur un graphe de grande taille
StatInfOmics -
10 ans d’études de la diversité génétique de la bactérie pathogène des poissons Flavobacterium psychrophilum
Bibliome, Migale -
Florilège, un service d'agrégation de connaissance en microbiologie des aliments
2017
Bibliome -
OpenMinTeD, une plateforme européenne pour des services de fouille de textes
BioSys -
L’allocation parcimonieuse des ressources au cœur de la définition des réseaux de régulation des cellules
Dynenvie -
Métamodélisation et analyse de sensibilité globale pour des modèles numériques avec des entrées corrélées : Approche pratique testée sur le modèle d'interception de la lumière par les plantes cultivées
StatInfOmics -
Détection de ruptures dans l’histoire évolutive à partir de données phénotypiques
2016
Dynenvie -
Une méthode d’inférence de Combinaison de Traits Fonctionnel Agrégés pour caractériser le potentiel fonctionnel d’un écosystème microbien à partir de données de métagénomique. Application à la dégradation des fibres par le microbiote intestinal humain.
Bibliome -
OntoBiotope, une révolution numérique en marche pour l'étude des habitats microbiens
2015
Dynenvie -
MTK - un package R pour unifier les démarches d'exploration numérique de modèles
Dynenvie -
Preuve de concept d'une approche de modélisation pour la gestion de la coexistence entre cultures OGM et non-OGM
BioSys -
Validation biologique de la méthode RBA – ou la mise à jour d’un principe général permet-tant la prédiction quantitative des composantes infra des cellules bactériennes à sa valida-tion biologique