Nous avons développé une approche computationnelle mêlant statistiques et modélisation pour caractériser une fonction écosystémique d’un écosystème microbien à partir de données de métagénomique shotgun. Nous avons appliqué cette approche à l’étude de la dégradation des fibres par le microbiote intestinal humain. Nous trouvons qu’elle est caractérisée par 4 combinaisons de traits fonctionnels agrégés, qui semblent différentiellement abondantes chez les malades de Crohn.

Béatrice Laroche, MaIAGE UR1404, Centre Ile-de-France-Jouy-en-Josas