Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Les thèses
BARNIER Andrée : Modèles probabilistes spatialisés pour la propagation de pathogènes par les mouvements commerciaux d’animaux - ED574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Patrick Hoscheit et Elisabeta Vergu - Equipes : Dynenvie
BODEIT Oliver : Large-scale economic model of growing budding yeast - - Début de la thèse :
Directeur.trice : E. Klipp (Institut de Biophysique, Humboldt-Universität zu Berlin) - Encadrant(s) : W. Liebermeister (MaIAGE) - Equipes : BioSys
BOROVIKOVA Mariya : Information extraction from textual data for epidemiosurveillance for plant health - ED580 STIC - Début de la thèse :
Directeur.trice : Claire Nédellec - Encadrant(s) : Claire Nédellec, Mathieu Roche, Arnaud Ferré, Robert Bossy - Equipes : Bibliome
CAILLEBOTTE Antoine : Estimation et sélection de variables dans un modèle joint de données de survie et longitudinales à effets mixtes corrélés. Application à la prédiction des effets des attaques de pyrale sur la date de floraison du maïs. - ED 574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Estelle Kuhn - Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Sarah Lemler (CentraleSupelec MICS), Judith Legrand, Elodie Marchadier (INRAE GQE Le Moulon) - Equipes : Dynenvie
CARPENTIER Juliette : Le microbiote au cœur des interactions Brassica napus x Delia radicum - Écologie, Géosciences, Agronomie et Alimentation (EGAAL) - Début de la thèse :
Directeur.trice : C. Mougel - Encadrant(s) : S. Derocles, M. Mariadassou - Equipes : StatInfOmics
FOUSSAT Anne-Sophie : Cotation d'Information et Analyse de la Dynamique de Vie de la Connaissance. Application au Suivi Temporel de Fiabilité des Informations Bibliographiques sur des Insectes Vecteurs de Pathogènes des Plantes - ED STIC - Début de la thèse :
Directeur.trice : C. Nédellec, V. Guigue, N. Sauvion - Encadrant(s) : Robert Bossy - Equipes : Bibliome
GUEDON Tom : Tests des composantes de la variance dans les modèles à effets mixtes pour des petits échantillons. Application à l’étude de la variabilité génotypique chez Arabidopsis Thaliana. - EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Kuhn Estelle - Encadrant(s) : Kuhn Estelle et Baey Charlotte (Université de Lille) - Equipes : Dynenvie
GUÉRIN Cyprien : Conception et mise en œuvre d’un système modulaire de mini-bioréacteurs pour la culture continue de microorganismes - ED577 SDSV - Début de la thèse :
Directeur.trice : P. Nicolas - Encadrant(s) : M. Jules (Micalis) - Equipes : StatInfOmics
INIZAN Olivier : Structuration et liage des données biologiques guidés par les ontologies et les principes organisateurs de modèles mathématiques. - ED 580 STIC - Début de la thèse :
Directeur.trice : Fatiha Saïs - Encadrant(s) : Anne Goelzer, Danai Symeonidou - Equipes : BioSys
KUBASCH Madeleine : Modèles structurés multi-niveaux de dynamiques épidémiques - ED574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Vincent Bansaye (X), Elisabeta Vergu - Equipes : Dynenvie
LE ROUX Zoé : Characterisation of Knowledge Graph through network tools: application to the Omnicrobe knowledge graph - UNIBO / UPSaclay SDSV - Début de la thèse :
Directeur.trice : Hélène Chiapello - Encadrant(s) : Sandra Dérozier - Equipes : StatInfOmics
LEQUERTIER Arthur : Transmission d'information à travers les réseaux métaboliques - ABIES - Début de la thèse :
Directeur.trice : W. Liebermeister - Encadrant(s) : W. Liebermeister, A. Tonda (équipe Ekinocs) - Equipes : BioSys
MARECHAL Anastasia : Modélisation mathématique de l’horloge circadienne dans une population d’hépatocytes - ED574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Laurent Tournier - Encadrant(s) : Laurent Tournier, Mathieu Mezache - Equipes : BioSys
Nguyen Thanh-Julie : Renforcer les connaissances sur les risques associés aux pesticides sur les pollinisateurs dans différents contextes paysagers pour concevoir des paysages de santé - ED581 ABIES - Début de la thèse :
Directeur.trice : Ivan Sache - Encadrant(s) : Florence Carpentier - Equipes : Dynenvie
PASSERI Iacopo : Statistical analysis of methylation patterns from S. meliloti - University of Florence ComBo - Début de la thèse :
Directeur.trice : Alessio Mengoni - Encadrant(s) : G. Kon Kam King, G. Gautreau, H. Chiapelo - Equipes : StatInfOmics
Pastremoli Eleonora : Towards a digital twin of the gut microbiota: a multidisciplinary approach for an in-depth understanding of composition, function and interaction with the host. - ED574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Beatrice Laroche - Encadrant(s) : Lorenzo Sala - Equipes : Dynenvie
PETY Solène : Méthodes hologénomiques pour prendre en compte le microbiote de l’hôte dans les évaluations génétiques - ED581 ABIES - Début de la thèse :
Directeur.trice : Andrea Rau - Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Ingrid David - Equipes : StatInfOmics
Procope-Mamert Sylvain : Algorithmes d'inférence pour des modèles de Markov cachés hiérarchiques à observations non linéaires - applications à l'analyse de données omiques suivies au cours du temps. - ED574 EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Nicolas CHOPIN, Maud DELATTRE et Guillaume KON KAM KING - Equipes : Dynenvie, Equipes : StatInfOmics
SAMSON Samantha : "Potentiation in silico de molécules hits sur la M-target" - ED577 SDSV - Début de la thèse :
Directeur.trice : Gwenaëlle André - Encadrant(s) : Gwenaëlle André et Nalini Rama Rao - Equipes : StatInfOmics
TOMILINA Ekaterina : Copula models for network inference from mixed/heterogeneous data with applications to multi-omics analysis - EDMH - Début de la thèse :
Directeur.trice : Florence Jaffrézic - Encadrant(s) : Gildas Mazo - Equipes : Dynenvie
ZHU Xingyu : Design of Information Extraction tools to characterize molecules produced or degraded by microbes and applications to plant-fermented food ecosystems - STIC - Début de la thèse :
Directeur.trice : Claire Nédellec - Encadrant(s) : Robert Bossy - Equipes : Bibliome