Des chercheurs d’INRAE (MaIAGE, Biogeco, MIAT, MGP, Micalis) ont développé une nouvelle méthode d'analyse métagénomique, combinant modélisation du métabolisme microbien et apprentissage statistique, pour étudier le microbiote intestinal humain. Ils ont utilisé 1153 échantillons fécaux humains pour identifier quatre profils fonctionnels universels impliqués dans la dégradation des fibres alimentaires et des mucines. Ces profils reflètent différents aspects du fonctionnement du microbiote. L'équilibre entre ces profils est essentiel pour un microbiote sain : chez les individus obèses, cet équilibre est perturbé, tandis qu'il est favorisé par un régime riche en fibres. Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin sont associées à un changement de prédominance de ces profils, indiquant des modifications dans le fonctionnement global du microbiote. Ces découvertes offrent des perspectives pour l'utilisation de ces profils comme marqueurs pour détecter les déséquilibres du microbiote. Elles pourraient aider au développement de nouveaux pré- et probiotiques pour restaurer les fonctions altérées du microbiote, offrant ainsi des pistes pour des traitements plus ciblés et efficaces pour maintenir ou rétablir un microbiote sain.

Contact : Béatrice Laroche
Unité : MaIAGE
Département : Mathnum
Centre INRAE : Ile de France Jouy-en-Josas
INRAE 2030 Orientations scientifiques (OS) et Orientations de politiques générales (OP) : OS 5.1, OS 2.5
Grands Objectifs Scientifiques (GOS) MathNum : GOS 2
Métaprogramme: HoloFlux
Mots-clés : Métagénomique, écologie fonctionnelle, microbiote digestif, factorisation positive, apprentissage
statistique