Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 

 
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Stages


ADAMOV David : Déploiement et évaluation d’un outil d'annotation textuelle immersif - master 2 - université de Lille : du au
Encadrant(s) : Arnaud Ferré - Equipe(s) : Bibliome

BRETON Hugo : Development of Machine Learning Methods for Detecting Genomic Context Modules from Pangenome Multigraphs - M2 - Université Paris-Cité : du au
Encadrant(s) : Christophe Ambroise ; Marie Szafranski ; Guillaume Gautreau - Equipe(s) : StatInfOmics

BROVEDANI Eva : Analyses métagénomiques et biochimiques en vue de concevoir un jumeau numérique de la fermentation du jus de carottes - M1 - Université de Versailles – Saint-Quentin-en-Yvelines : du au
Encadrant(s) : Guillaume Gautreau; Alice Lima - Equipe(s) : StatInfOmics

DIALLO Mamadou Aliou : Exploration du pangénome pour délimiter automatiquement les éléments mobiles ICE et IME - Master 2 - Université de Bordeaux : du au
Encadrant(s) : Thomas Lacroix, Guillaume Gautreau, Hélène Chiapello - Equipe(s) : StatInfOmics

HOBLOS Yazid : Development of workflows for pangenome graph functional annotation at large scale - M2 - Université d'Evry Val d'Essone : du au
Encadrant(s) : Alexandra Calteau, David Vallenet, Guillaume Gautreau, Meriem Youssef - Equipe(s) : StatInfOmics

LOEB Ambroise : Comparaison d’outils pour l’analyse d’associations pangénomiques bactériennes (bGWAS) et application à l’étude de deux stress chez la bactérie Campylobacter jejuni - Master 2 - Toulouse-INP - Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse. : du au
Encadrant(s) : C. Hennequet-Antier et S. Schbath - Equipe(s) : Migale

PREHAUD Benjamin : Développement d’une méthode bioinformatique pour l’identification du méthylome bactérien dans les données métagénomiques issues du séquençage Nanopore et analyse de ses liens avec l’abondance microbienne - Master bioinfo AMI2B - Université Paris-Saclay : du au
Encadrant(s) : Guillaume Gautreau - Equipe(s) : StatInfOmics

REN Niya : Développement d’un outil de décontamination in silico pour les données métagénomiques - M2 - Université Paris Cité : du au
Encadrant(s) : Lindsay Goulet ; Florian Plaza Onate ; Guillaume Gautreau ; Emmanuelle Le Chatelier - Equipe(s) : StatInfOmics

SEKKOURI Etienne : Vers la métagénomique pilotée par l'IA - Master 2 - Université de Lille : du au
Encadrant(s) : Guillaume Gautreau - Equipe(s) : StatInfOmics

Victor Michel : Développement d’un workflow d’identification et d’annotation de génomes de bactériophages - M2 - Université Paris-Saclay : du au
Encadrant(s) : Cédric Midoux, Valentin Loux, Eric Duga-Bony (SayFood) - Equipe(s) : Migale

VOIRY Clara : Analyse de la trajectoire évolutive de gène bacA/bcA dans différentes espèces de rhizobium exposés ou non à la différenciation terminale des bactéroides. - Master 2 INTERACTIONS PLANTE-MICROORGANISMES - Université de Montpellier : du au
Encadrant(s) : Hélène Chiapello et Benoit Alunni - Equipe(s) : StatInfOmics