Les éléments conjugatifs chromosomiques sont des éléments génétiques mobiles encore mal connus qui jouent un rôle clé dans ladynamique évolutive des génomes bactériens. Ce sont des vecteurs de transfert horizontal de fonctions d’intérêt. Ils contribuent notamment massivement à la dissémination des résistances aux antibiotiques, un problème majeur en santé publique. Parmi les éléments conjugatifs, ceux intégrés dans les génomes bactériens sont les plus abondants et les moins étudiés de par leur localisation chromosomique. Un travail récent des unités MaIAGE (INRAE IdF-Jouy-en-Josas-Antony) et DynAMic (INRAE Grand Est-Nancy ) a permis de développer l’outil ICEscreen qui permet de détecter une grande diversité d’éléments mobiles conjugatifs intégrés dans les génomes de Firmicutes. Cet outil est mis à disposition de la communauté et s’est révélé particulièrement performant pour détecterles structures composites complexes que forment ces éléments dans un jeu de données de 40 génomes de Firmicutes.

Unité : MaiAGE et Dynamic
Département : MICA
Centre : IdF-Jouy-en-Josas-Antony et Grand Est-Nancy
Contacts : Hélène Chiapello (MaIAGE) – Nathalie Leblond-Bourget (DynAMic)