Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Stagiaires Dynenvie
GAVILANES Kathya Viviana : Métamodélisation pour la sélection de variables en grande dimension dans les modèles à effets mixtes complexes. Application en amélioration des plantes. - M2 - Université d'Evry Val d'Essonne - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre, Marion Naveau - Equipe(s) : Dynenvie
JOUANAUD Yanis : Predicting Microbial Community Interactions using Physics Informed Neural Networks. - M1 - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Lorenzo Sala (Dynenvie), Beatrice Laroche (Dynenvie), Hugo Gangloff (MIA Paris-Saclay), Nicolas Jouvin (MIA Paris-Saclay) - Equipe(s) : Dynenvie
POINTET Jeanne : Champs de Markov sur réseau pour modéliser la propagation des maladies des arbres forestiers - M2 - ENSAI - ( - )
Encadrant(s) : Katarzyna Adamczyk, Anne Gégout-Petit - Equipe(s) : Dynenvie
DECHAMPS Ambre : Modélisation de l’infection à la Salmonelle et inférence de paramètres. - M2 - ( - )
Encadrant(s) : Beatrice Laroche, Lorenzo Sala, Maud Delattre - Equipe(s) : Dynenvie
PROCOPE-MAMERT Sylvain : Modélisation dépendante de données omiques temporelles à l'aides de modèle de Markov Cachés - M2 - Université Paris-Dauphine / Ecole Normale Supérieure de Rennes - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre, Guillaume Kon Kam King - Equipe(s) : Dynenvie, Equipe(s) : StatInfOmics
Zhang Minghe : Analyse de sensibilité pour un modèle de propagation de phéromones d’insectes ravageurs - Master 2 - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Thibault Malou, Simon Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie
PIERRAT Paul : Processus de Hawkes : application en épidémiologie végétale - M2 - Université de Lorraine - ( - )
Encadrant(s) : Katarzyna Adamczy, Madalina Deaconu - Equipe(s) : Dynenvie
TRAORE Mamadou B : Effet des protiques et du paysage sur la co-occurence des maladies des cultures au sein des agro-écosystèmes céréaliers - 3ème année école ingénieur - Institut agro Dijon - ( - )
Encadrant(s) : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
GIRARD Nicolas : Modélisation et estimation statistique pour l'analyse de la variabilité de la réponse au virus de la sharka chez l'abricotier. - M1 - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre / Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
BAILLIE Nils : Etude comparative de lois a priori bayésiennes pour la sélection de variables dans les modèles non linéaires à effets mixtes - M1 - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre / Guillaume Kon-Kam-King - Equipe(s) : Dynenvie, Equipe(s) : StatInfOmics
MAATOUK Rita : Optimisation multi-critère et estimation en présence d'aléa. Application à la sélection de variétés multi-performantes en végétal en présence de variabilité environnementale - Master 1 - Université Paris Saclay Orsay - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Jean-Benoist Leger - Equipe(s) : Dynenvie
Lehembre Thomas : Modélisation multi-épidémique de la cooccurrence des maladies des blés - ( - )
Encadrant(s) : Florence Carpentier ; Elisabeta Vergu; Suzanne Touzeau (ISA) - Equipe(s) : Dynenvie
Nguyen Thanh-Julie : Effect des insecticides sur les abeilles sauvages - 3A - Agroparistech - ( - )
Encadrant(s) : Florence Carpentier ; Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
VATI Inès : Utilisation de réseaux de neurones pour l’étude phylodynamique de modèles épidémiologiques. - M1 - École des Ponts Paristech - ( - )
Encadrant(s) : Patrick Hoscheit - Equipe(s) : Dynenvie
LE GUERN FIALLO Pablo : Modélisation et analyse de spectre pour la prédiction de phénotypes chez les plantes - Master 2 - Université Paris Saclay Evry - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Tristan Mary-Huard, Renaud Rincent - Equipe(s) : Dynenvie
CARTIER Julie : Inférence de réseaux multi-omiques - M2 - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Gildas Mazo, Florence Jaffrézic - Equipe(s) : Dynenvie
LE-GUERN FIALLO Pablo : Modélisation et analyse de spectres proche infra-rouge via des modèles déformables pour la prédiction de phénotypes chez les plantes - master 2 - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Tristan Mary-Huard, Renaud Rincent - Equipe(s) : Dynenvie
CAILLEBOTTE Antoine : Modélisation jointe de données longitudinales et de survie en grande dimension. Application à la pyrale du maïs. - master 2 - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Sarah Lemler, Judith Legrand, Elodie Marchadier - Equipe(s) : Dynenvie
CAILLEBOTTE Antoine : Modélisation jointe de données longitudinales et de survie en grande dimension - Master 2 - Université Paris Saclay Orsay - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Sarah Lemler (CentraleSupelec MICS), Judith Legrand, Elodie Marchadier (INRAE GQE Le Moulon) - Equipe(s) : Dynenvie
GUEDON Tom : Procédures de test des composantes de la variance dans un modèle mixte pour des échantillons de taille finie - master 2 - ENSAE - ( - )
Encadrant(s) : Kuhn Estelle ; Baey Charlotte (Université de Lille) - Equipe(s) : Dynenvie
MOLODIJ Victor : Analyse de données pour la compréhension des Interactions dans des écosystèmes microbiens complexes - M2 Mathématiques Appliquées aux Sciences du Vivant - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Christine Kéribin, Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
Imane Boualaoui : Analyse phylodynamique de virus recombinants - Sorbonne Université - ( - )
Encadrant(s) : Patrick Hoscheit - Equipe(s) : Dynenvie
HATON Romain : Analyse de données de composition de flores fromagères - Master1 de Mathématiques Appliquées - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Christine Kéribin, Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
MURARO Anthony : Grands graphes aléatoires spatialisés sous-jacents à la propagation d’épidémies : estimation des paramètres et analyse de données - Master 2 Mathématiques pour les Sciences du Vivant - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Patrick Hoscheit, Estelle Kuhn, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
KUBASCH Madeleine : Évaluation de la vulnérabilité épidémiologique au sein d’un réseau d’échanges - Master 2 Mathématiques et Applications - Sorbonne Université - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu, Vincent Bansaye (CMAP, Ecole Polytechnique) - Equipe(s) : Dynenvie
Marion Naveau : Sélection de variables en grande dimension dans les modèles non linéaires à effets mixtes. Application en amélioration des plantes. - M2 Mathématiques pour les Sciences du Vivant - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre, Laure Sansonnet - Equipe(s) : Dynenvie
DOEHLER Marianne : Effet des pratiques et du paysage sur la concurrence des maladies des cultures au sein des agroécosystèmes céréaliers. - M2 Amélioration, production, valorisation du végétal - AgroCampus Ouest De Rennes - ( - )
Encadrant(s) : Florence Carpentier, Anne-Lise Boixel - Equipe(s) : Dynenvie
Onfroy Audrey : Modélisation mécaniste de réseaux commerciaux d’animaux - Master 2 MathSV - UPS - ( - )
Encadrant(s) : Patrick Hoscheit, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
Lecomte Maxime : Modeling a microbial community to improve organoleptic cheese quality - M2 - Université de Bordeaux (UB) - ( - )
Encadrant(s) : Simon Labarthe, Clémence Frioux - Equipe(s) : Dynenvie
CAYATTE Mayeul : Construction et analyse de sensibilité d’un modèle structuré pour la propagation et le contrôle de Covid-19 - Fin d'étude d'ingénieur - Ecole Polytechnique - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu; Co-encadrants : Vincent Bansaye, Olivier Le Maître (Ecole Polytechnique) - Equipe(s) : Dynenvie
ECOTIERE Claire : Estimation des paramètres pour un modèle de dynamique de croissance du maïs - Master 2 mathématiques et applications - mathématiques pour les Sciences du vivant - Ecole polytechnique- Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche, B. Andieu - Equipe(s) : Dynenvie
KOUYE Henri Mermoz : Analyse de sensibilité pour modeles stochastiques - M2 MathSV - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Gildas Mazo, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
TORELINO Krystel : Modélisation du comportement du virus de la sharka chez l’abricotier sauvage dans le cadre d’études de génétique d’association génotype/phénotype - Master 2 Mathématiques et Applications - Spécialité Ingénierie Mathématique et Biostatistique - Université Paris Descartes - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn, Véronique Decroocq (UMR BFR INRA, Bordeaux) - Equipe(s) : Dynenvie
MOLODIJ Victor : Modélisation de l'hétérogénéité de transmission d'un pathogène dans une population due aux interactions entre le pathogène, l'hôte et son microbiote - M1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Sud - Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
PINSARD Etienne : Grands graphes aléatoires : simulation et analyse de données pour l'étude d'épidémies - Master 2 systèmes complexes - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
MENDOZA Chloe : Modélisation conjointe des différentes voies de transmission spatio-temporelle des maladies infectieuses chez les animaux d’élevages. - 2ème année - INSA - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu, Simon Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie
PAULAY Amandine : Modélisation de la dégradation des protéines par le microbiote intestinal humain - Master 2 Génomique et Environnement - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Beatrice Laroche, Marion Leclerc, Simon Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie
SOUILLOT Mathilde : Modélisation et estimation de l'effet du paysage sur la densité et la diversité d'espèces - M2 - AGROCAMPUS Ouest, Rennes - ( - )
Encadrant(s) : Florence Carpentier, Katarzyna Adamczyk - Equipe(s) : Dynenvie
ECOTIERE Claire : Estimation de paramètres pour un modèle de dynamique de croissance du maïs - Master 2 Mathématiques et Applications - Mathématiques pour les Sciences du Vivant - Ecole Polytechnique - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
PAME Kévin : Clustering auto-organisé dans un grand réseau dynamique - M2 Ingénierie Mathématique pour les Sciences du Vivant - Université Paris 5 - ( - )
Encadrant(s) : Madalina Olteanu, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
NAKHLA Rochd : Modélisation conjointe des différentes voies de transmission spatio- temporelle des maladies infectieuses chez les animaux d’élevages - M2 - Master Modélisation et Simulation, ENSTA Paristech - ( - )
Encadrant(s) : Simon Labarthe, Béatrice Laroche, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
NAKHLA Rochd : Modélisation conjointe des différentes voies de transmission spatio- temporelle des maladies infectieuses chez les animaux d’élevages - M2 - Master Modélisation et Simulation, ENSTA Paristech - ( - )
Encadrant(s) : Simon Labarthe, Béatrice Laroche, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
CHERAL Alann : Inférence par des modèles à effets mixtes d’un modèle de réponse fonctionnelle en écologie - M1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Saclay (Univ. Orsay) - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre ; Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
CHAPUT Maxime : Structure du microbiote intestinal relativement aux fonctions impactant la cholesterolémie de l’hôte - M2 - Master Bioinformatique Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Simon Labarthe, Moez Rhimi (Micalis) - Equipe(s) : Dynenvie
LAYAN Maylis : Induction and mitigation of durable dysbiosis in the gut ecosystem - M2 - ENS Cachan - ( - )
Encadrant(s) : Maarten Van de Guchte, Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
DUBUS Nuno : Etude de la transition florale du maïs - L2 Biologie - Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Sylvie Huet, Sandra Plancade - Equipe(s) : Dynenvie
SOLDATKINA Oleksandra : Inférence de modèles d'interactions en écologie microbienne: application aux bactéries du microbiote intestinal - Master 2 - Université Paris Saclay - Orsay - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
OODALLY Ajmal : Estimation dans un modèle de fragilité à partir d'une vraisemblance partielle - Master 2 - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Estelle Kuhn (MaIAGE) - Equipe(s) : Dynenvie
MATRAS Cassandre : Définition d'une typologie des échanges d'animaux en élevages bovins - Master 1 - AgroSup Dijon - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu (MaIAGE), Aurélie Courcoul (ANSES) - Equipe(s) : Dynenvie
YAGDJIAN Armen : Modélisation de dynamiques d’interactions spatiales en biologie cellulaire à partir de trajectoires 3D+temps mesurées en microscopie - M1 - Université Paris Saclay - Orsay - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche ; Simon Labarthe ; Alain Trubuil - Equipe(s) : BioSys, Equipe(s) : Dynenvie
ANTHONY Eric : Adaptation, mise en œuvre et comparaison d’algorithmes de recherche de centralité des nœuds dans des graphes temporellement dynamique - M2 Bioinformatique - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Patrick Hoscheit, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
NARCI Romain : Inférence par des processus de diffusion des paramètres clés des dynamiques épidémiques partiellement observées - M2 MathSV - Université Paris Saclay - ( - )
Encadrant(s) : Maud Delattre, Catherine Larédo, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
GIGUELAY Ambre : Analyse des données du réseau de mouvements commerciaux de bovins en France - M1 - AgroParisTech - ( - )
Encadrant(s) : Gaël Beaunée; Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
DARRIGADE Léo : Modélisation du microbiote intestinal - Master 2 - Universite Paris-Saclay (Paris Sud et AgroPariTech) - ( - )
Encadrant(s) : Béatrice Laroche, Simon Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie
JANICOT Stéphane : Modélisation statistique de l’évolution temporelle d’un réseau de commerce : application aux mouvements commerciaux de bovins - Master 2 - Université - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu, Benoît Durand (Laboratoire Santé Animale, ANSES Maisons-Alfort) - Equipe(s) : Dynenvie
RASENDRA Marie-Ange : Modélisation de la diffusion dans un biofilm - M1 - Ecole Centrale Marseille - ( - )
Encadrant(s) : Simon Labarthe, Béatrice Laroche, Alain Trubuil - Equipe(s) : Dynenvie
NARCI Romain : Analyse de sensibilité et méta-modélisation, par simulation, de modèles à sorties spatiales et dynamiques. Application en agronomie. - Master 1 - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Hervé Monod, Caroline Bidot - Equipe(s) : Dynenvie
GARNAULT Maxime : Durabilité des fongicides - Stage de Master 2 - AgroParitech - ( - )
Encadrant(s) : Olivier David, Florence Carpentier, Anne-Sophie Walker (INRA Grignon) - Equipe(s) : Dynenvie
MONTAGNON Pierre : Modèles de dynamiques de populations pour réseaux dynamiques - Master 2 probabilités et Modèles Aléatoires - Université Paris 6-7 - ( - )
Encadrant(s) : Elisabeta Vergu, Vincent Bansaye (CMAP Ecole Polytechnique) - Equipe(s) : Dynenvie
LADMIRAL Charles : Modélisation de l'évolution des populations d'un programme de sélection décentralisée et participative sur le blé - Master "Analyse numérique et équations aux dérivées partielles". - Ecole Nationale des Ponts et Chaussées - PariTech - ( - )
Encadrant(s) : Olivier David - Equipe(s) : Dynenvie
KAMARI Halaleh : Analyse de sensibilité, construction de méta-modèles basée sur les espaces RKHS et application à la modélisation du pH du lait cru - Master 2 - Université Paris Saclay et Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Sylvie Huet, Marie-Luce Taupin - Equipe(s) : Dynenvie
MERMER Feyza : Stage M1 : Analyse bayésienne des données d'un projet de sélection décentralisée et participative sur le blé tendre - M1 Ingénierie Mathématique - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : O. David (MaIAGE), I. Goldringer et P. Rivière (INRA Moulon) - Equipe(s) : Dynenvie
TOMASEVIC Milica : Analyse de sensibilité et méta-modélisation par simulation, de modèles à sorties spatiales et dynamiques - Application en Agronomie - Master 2 Mathématiques - Université de Nice - ( - )
Encadrant(s) : Sylvie Huet, Marie-Luce Taupin - Equipe(s) : Dynenvie
REZGUI Imane : Collaboration avec l'Université de Mentouri à Constantine en Algérie - Etudiante en thèse - Université de Constantine - ( - )
Encadrant(s) : Hervé Monod (MaIAGE) - Equipe(s) : Dynenvie
GEERAERT Sébastien : Construction et implémentation d’un modèle d’épidémiologie économique fondé sur des réseaux dynamiques et adaptatifs - 3ème année (M1) - Ecole Polytechnique - ( - )
Encadrant(s) : Mathieu Moslonka-Lefebvre, Patrick Hoscheit, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
GEERAERT Sébastien : Construction et implémentation d’un modèle d’épidémiologie économique fondé sur des réseaux dynamiques et adaptatifs - 3ème année (M1) - Ecole Polytechnique - ( - )
Encadrant(s) : Mathieu Moslonka-Lefebvre, Patrick Hoscheit, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie