Type
Stagiaire
Sujet
Utilisation de réseaux de neurones pour l’étude phylodynamique de modèles épidémiologiques.
Date de début
Date de fin
Encadrant(s)
Patrick Hoscheit
Equipe(s)
Dynenvie
Année de soutenance (pour les thèses ou les stages)
2023
Date de soutenance (pour les thèses)
Ecole/université (pour les thèses et les stages)
École des Ponts Paristech
Niveau/diplôme (pour les stages)
M1
Description/résumé
Inès réalisera un travail de recherche à partir d’un article récent (Voznica et al. Deep learning from phylogenies to uncover the transmission dynamics of epidemics, 2021). Elle mettra en œuvre les méthodes développées dans cet article, d’abord sur données simulées, ensuite à partir de séquences génétiques de dengue provenant de Tahiti et du Cambodge.