DeMuSi- ITMO Cancer - PCSI 2022- Défi et/ou Axe : Appel à projets : Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques et perspectives thérapeutiques : Apports à l’oncologie de la physique, de la chimie et des sciences de l’ingénieur (2022-2025) Titre : Deciphering the mutational signature of transcription and DNA repair processes combined with exogenous DNA damages (DeMuSi)
Participants : P. Nicolas, G. Kon Kam King, C. Guérin - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : CEA I2BC (J. Soutourina), CEA Saclay (F. Mallogi), INSERM Gustave-Roussy (S. Nikolaev)Coordinateur : J. Soutourina (CEA I2BC)
SIDURI- ANR- Grand Défi (2023-2032) Titre : Développement de l'entrepôt de données autour des ferments du futur Participants : V. Loux, M. Wan, A. Millan, T. Lacroix, S. Schbath - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics Partenaires : SPO (INRAE Montpellier)Coordinateur : V. Loux
HoloE2Plant- ERC Starting Grant- (2022-2026) Titre : Exploring the Holobiont concept through a Plant Evolutionary Experiment study Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : IRISA (Rennes), Department of Systematic and Evolutionary biology (Univ. Zurich)Coordinateur : Claudia Bartoli
FAIROmics- HORIZON-MSCA-2022-DN-01-01- (2023) Titre : FAIRification of multiOmics data to link databases and create knowledge graphs for fermented foods Participants : R. Bossy, H. Chiapello, S. Dérozier, C.Nédellec - Equipe(s) : Bibliome / StatInfOmics Partenaires : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, NIZO food research BV, National and Kapodistrian University of Athens, University of Reading, Chr. Hansen A/S, Vrije Universiteit Amsterdam, Agencia ...Coordinateur : Dominique Swennen (INRAE SayFood)
FermenTwin- INRAE Métaprogramme- AMI DIGITBIO- (2024) Titre : FermenTwin Participants : G. GAUTREAU, C. GUERIN, B. LAROCHE, L. SALA - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics Partenaires : MICALIS, Biogeco, SyBERCoordinateur : Guillaume GAUTREAU
DOMINO- HORIZON-CL6-2021-FARM2FORK-01- (2022-2027) Titre : Harnessing the microbial potential of fermented foods for healthy and sustainable food systems Participants : V. Loux, M. Mariadassou, H. Chiapello - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics Partenaires : 21 partenaires, 10 paysCoordinateur : S. Chaillou (INRAE, Jouy-en-Josas)
DMB4ALE- APPC TWB- (01/2024-12/2025) Titre : Implementation of dual mini-bioreactors for adaptive laboratory evolution without biofilm Participants : C. Guérin, P. Nicolas, S. Dérozier - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : Micalis, TWBCoordinateur : C. Guérin, MaIAGE, INRAE
MetaSimFood- ANR- ANR Blanche Défi et/ou Axe : Axe 1.5 Alimentation et Systèmes Alimentaires (2021 - 2025) Titre : Improving the quality, safety and sustainability of fermented vegetable food and fruit beverage using a knowledge-driven synthetic ecology and modelling approach Participants : M. Mariadassou, V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics Partenaires : Micalis (INRAE Jouy-en-Josas), SayFood (INRAE Versailles), Aérial (ITAI, Illkirch), UR Oenologie (Univ. Bordeaux), STLO-CIRM (INRAE, Rennes)Coordinateur : S. Chaillou (Micalis, INRAE)
Agro-Serv- HORIZON-INFRA-2021-SERV-01-02- (2022-2027) Titre : Integrated SERVices supporting a sustainable AGROecological transition Participants : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : 42 partenaires - Infrastructures de recherche: Anaee/Emphasis/Elixir/EMBRC/EURo Bioimaging/EU OpenScreen/MetroFood/SmartCow/IBISBA/LifeWatch/MIRRICoordinateur : Michel Boer Anaee CNRS
MutaToR- ANR- AAPG2022- Défi et/ou Axe : CE12 Génétique, génomique et ARN (2023-2026) Titre : Mechanisms of mutational processes involving transcription and nucleotide-excision DNA repair Participants : C. Guérin, G. Kon Kam King, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : J. Soutourina (CEA-CNRS-I2BC), F. Malloggi (LIONS-CEA)Coordinateur : J. Soutourina
Stat4Plant- ANR- PRC- Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé (2021-2025) Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPBCoordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
Microbe-4-Climate- HORIZON-INFRA-2023-SERV-01-02- (2024-2029) Titre : Microbial services addressing climate change risks for biodiversity and for agricultural and forestry ecosystems: enabling curiosity-driven research and advancing frontier knowledge Participants : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : 30 partenaires, Universités de Turin, Gent, Valencia, Notthingam, Wageningen; CNRS, CNR, AIT ...Coordinateur : MIRRI-ERIC Ana Portugal
MICROBE- HORIZON-INFRA-2022-TECH-01-01 RIA- (2023-2026) Titre : MICRObiome Biobanking (RI) Enabler Participants : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : AIT (AUS) - DSMZ (GER) - EMBL (UK) - CABI (UK) - HMGU (GER) - MUG (AUS) - SU (FR)Coordinateur : Tanja KOSTIC - Austrian Institute of Technology (AIT)
HOLOVINI- INRAE Métaprogramme- Metaprogramme Holoflux- (2023-2026) Titre : Microbiomes at the interface of the vineyard and the cellar
at the time of the agroecological transition Participants : A-L. Abraham, G. Kon Kam King - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : UMR Oenologie (Bordeaux), UMR SPO (Montpellier), UMR SAVE (Bordeaux), UMR Biogeco (Bordeaux), UMR CBGP (Montpellier), UMR EGFV (Bordeaux), UMR Agroecologie (Dijon), UMR ISPA (Boredeaux), UE Pech Rouge (Montpellier)Coordinateur : I. Masneuf-Pomarede (INRAE, Bordeaux)
MALDIBANK- INFRA-2024-TECH-01-01- (2025-2029) Titre : Multi-domain Open MALDI Spectra BANK for Identification of Microorganisms Participants : MY Mistou, S. Marthey, S. Schbath, V. Loux - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : INSTRUCT, EMBRC, EMBL,Sciensano, Institut Pasteur,Uni. of Latvia, Sorbonne U., Uni. Torino, ..., Coordinateur : Ana Portugal (MIRRI-ERIC) - MY Mistou (INRAE MaIAGE, co-coordinateur)
NO-ESKAPE- ANR- CE18 Innovation Biomédicale- Défi et/ou Axe : CE18 Innovation Biomédicale (2024-2027) Titre : New antimicrobials against ESKAPE pathogens to fight nitric oxide stress resistance Participants : Sylvain Marthey, Gwenaëlle André - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : Nalini Rama Rao (Micalis) Jean-Christophe Cintrat (CEA), Eric doris (CEA), Julien Nicolas (Institut Galien), Simona Mura (Institut Galien)Coordinateur : Nalini Rama Rao (Micalis)
PHHASt- ANR- AAPG2022- Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des micro-organismes (2022-2026) Titre : Phenotypic heterogeneity and host adaptation during late infection in sporulating Firmicutes Participants : S. Dérozier, C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : L. Slamti (MICALIS), F. Neulat-Ripoll (IRBA)Coordinateur : L. Slamti
PROMETHEUS- ANR- France 2030 IHU (2023-2032) Titre : PRecisiOn MedicinE for healTHcare associatEd and commUnity acquired Sepsis Participants : B. Laroche, L. Sala, G. Andrée-Leroux, S. Marthey - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics Partenaires : APHA,CEA, INSERM, Univ Paris-Saclay (UVSQ, Pasteur, etc..)Coordinateur : Djalili Annane-Coordinateur INRAE (WP1) Pascale Serror
Open16S- (2022-2024) Titre : Projet pilote transversal pour la mise en oeuvre de la politique Open Science du département MICA Participants : Hélène Chiapello, Robert Bossy, Mouhamadou Ba, Olivier Rué, Cédric Midoux - Equipe(s) : Bibliome / Migale / StatInfOmics Partenaires : CATI BOOMCoordinateur : Stéphane Chaillou, Marie Champomier Vergès, Hélène Chiapello, Marion Leclerc, François Marras
TEPOM- INRAE Métaprogramme- AMI 2024- (2025) Titre : Towards Epigenetics Piloting Of Microbiomes Participants : Guillaume Gautreau, Iacopo Passeri - Equipe(s) : StatInfOmics Partenaires : MetaGenoPolis, Université de FlorenceCoordinateur : Guillaume Gautreau