L’unité MaIAGE développe l’application Omnicrobe (Dérozier S et al. PlosOne, 2023) qui rassemble des informations sur les habitats, les phénotypes et les usages des micro-organismes, extraites automatiquement de sources textuelles (PubMed, GenBank, DSMZ, Centres de Ressources Biologiques pour les microorganismes - CIRM). Omnicrobe forme un graphe de connaissances sur la biodiversité microbienne contenant plus d’un million de relations. Les données sont accessibles via une interface web (https://omnicrobe.migale.inrae.fr/) et une interface programmatique (API ; https://omnicrobe.migale.inrae.fr/api). Les données d’Omnicrobe sont actuellement structurées et stockées dans une base de données relationnelles PostgreSQL. Sana a pour mission d’évaluer la solution Neo4J (https://neo4j.com/fr/) afin de représenter les données sous forme de graphe. Elle s’appuie sur un jeu de données constitué d’un sous-ensemble des données Omnicrobe afin d’alimenter une base Neo4J et d’évaluer les fonctionnalités et les performances de la suite logicielle (conception, requêtage).