UR 1404 Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE)

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L'unité de recherche MaIAGE regroupe des mathématiciens, des informaticiens, des bioinformaticiens et des biologistes autour de questions de biologie et agro-écologie, allant de l'échelle moléculaire à l'échelle du paysage en passant par l'étude de l'individu, de populations ou d'écosystèmes. Elle est structurée en cinq équipes :

  • Dynenvie : modélisation dynamique et statistique pour les écosystèmes, l'épidémiologie et l'agronomie
  • Bibliome : acquisition et formalisation de connaissances à partir de textes
  • BioSys : biologie des systèmes
  • StatInfOmics : bioinformatique et statistique des données "omiques"
  • Migale : plateforme bioinformatique

L'unité développe des méthodes mathématiques et informatiques originales de portée générique ou motivées par des problèmes biologiques précis. Elle s'implique aussi dans la mise à disposition de bases de données et de logiciels permettant aux biologistes d'utiliser les outils dans de bonnes conditions ou d'exploiter automatiquement la littérature scientifique.

L'inférence statistique et la modélisation dynamique sont des compétences fortes de l'unité, auxquelles s'ajoutent la bioinformatique, l'automatique et l'algorithmique. Les activités de recherche et d'ingénierie s'appuient également sur une forte implication dans les disciplines destinatrices : écologie, environnement, biologie moléculaire et biologie des systèmes.

MaIAGE est rattachée à deux départements de l'Inra :

Faits Marquants

Florilège: un service d'agrégation de connaissance en microbiologie des aliments.
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10 ans d’études de la diversité génétique de la bactérie pathogène des poissons Flavobacterium psychrophilum : une collaboration de longue durée entre mathématiciens et biologistes.
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BiPON: une preuve de concept sur la manière de combiner formellement la biologie systémique et les bio-ontologies.
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Modélisation de dynamiques démographiques et épidémiologiques sur un graphe de grande taille avec une application sur les transmissions de maladies infectieuses chez les bovins.
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