Contrats et projets en cours



ABIM
- ANR- Jeunes chercheurs et jeunes chercheuses (2017-2021)
Titre : Approximations and Behavior of stochastic Individual-based Models
Coordinateur : V. Bansaye (CMAP, Ecole Polytechnique)
Partenaires : Ecole Polytechnique (CMAP, CPHT); Univ. Lille; IRMES
Participants MaIAGE : E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie

Alter-Ome
- INRAE- Appel à projet MICA 2019- (2019-2020)
Titre : Comprendre et maîtriser l'altération (microbiologique) des fromages par l'intégration de données multi-omiques.
Coordinateur : S. Helinck (GMPA Grignon)
Partenaires : GMPA
Participants MaIAGE : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie

API-SMAL
- Labex- BASC- (2017-2020)
Titre : Agroecology and policy instruments for sustainable multifunctional agricultural landscapes
Coordinateur : V.Martinet (INRA, Economie Publique)Participants MaIAGE : S.Labarthe, K.Admaczyk, H. Monod - Equipe(s) : Dynenvie

Articulate
- France-Berkeley Fund- (2019-2020)
Titre : Experimental and mathematical models articulation: a bifocal lens to study the ecology of the colonic microbiota
Coordinateur : A.Bäumler (UC Davis) and S.Labarthe (MaIAGE)
Partenaires : UC Davis (Davis, USA)
Participants MaIAGE : B.Laroche, L.Darrigade, S. Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie

BioBrickEvolver
- ANR- AAPG2018 - PRC
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système
(01/2019-12/2022)
Titre : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis.
Coordinateur : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)
Partenaires : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Eq. C. Berthomieu), TWB (O. Galy)))
Participants MaIAGE : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics

CADENCE
- ANR- ANR blanche-
Défi et/ou Axe : Défi 5 "Sécurité alimentaire et défi démographique"
(2017-2021)
Titre : Propagation de processus épidémiques sur des réseaux dynamiques de mouvements d’animaux avec application aux bovins en France / Spread of epidemic processes on dynamical networks of animal movements with application to cattle in France
Coordinateur : E. Vergu (MaIAGE)
Partenaires : INRA-Oniris BioEpAR Nantes; ANSES LSAn Maisons Alforts; École Polytechnique CMAP Palaiseau
Participants MaIAGE : G. Beaunée, C. Bidot, P. Hoscheit, E. Kuhn, S. Labarthe, C. Larédo, B. Laroche, M. Olteanu - Equipe(s) : Dynenvie

cAVIAR
- Appel à projets 2018 du plan Ecoantibio 2- (2019-2022)
Titre : cAVIAR : Enterococcus cecorum : Analyse de la VIrulence et de l’AntibioRésistance
Coordinateur : I. Kempf (Anses, Ploufragan)
Partenaires : Unité Mycoplasmologie Bactériologie et Antibiorésistance (Ploufragan), Micalis (Jouy en Josas)
Participants MaIAGE : V. Loux - Equipe(s) : Migale

CoNoCo
- ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN
(2019-2023)
Titre : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Coordinateur : E. Bidnenko (INRA Micalis)
Partenaires : Micalis (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
Participants MaIAGE : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics

D2KAB
- ANR- ANR blanche-
Défi et/ou Axe : Défi : B.7 Axe : axe 4
(06/2019-05/2023)
Titre : Data to Knowledge in Agriculture and Biodiversity
Coordinateur : C. Jonquet (LIRMM, Montpellier)
Partenaires : UM-LIRMM, CNRS-I3S, INRA-DIST, INRA-URGI, INRA-IATE, INRA-URFM ,IRSTEA-TSCF, CNRS-CEFE, ACTA, STANFORD-BMIR
Participants MaIAGE : R. Bossy, C. Nédellec, L. Deléger - Equipe(s) : Bibliome

ECONET
- ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Sober management of resources and adaptation to climatic changes: towards an under- standing of global changes Axe : Fundamental knowledge on natural environments and biodiversity
(2018-2022)
Titre : Advanced statistical modelling of ecological networks
Coordinateur : C. Matias (CNRS - UPMC, LPSM)
Partenaires : LPSM (UPMC), MIA-Paris (INRA), LBBE (Univ. Lyon), ISEM (Univ. Montpellier), IEES (MNHN), EEP (Univ. Lille)
Participants MaIAGE : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics

ECOS-SUD Mfd-Profiling
- ECOS-Sud (2020-2022)
Titre : In vitro/in silico/in cristallo Potentiation of the Inhibition of Mfd in presence of its Cognate Partner UvrA
Coordinateur : G. André-Leroux (MaIAGE)
Partenaires : IBR CONICET (Argentine), Micalis (Jouy)
Participants MaIAGE : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics

ESPACE
- INRAE Métaprogramme- SMaCH- (2018-2022)
Titre : Estimer les effets des variables paysagères sur les bioagresseurs et auxiliaires des cultures
Coordinateur : Florence Carpentier (Bioger, SPE), Olivier Martin (BioSP,MIA)
Partenaires : BioSP (MIA, Avignon), Bioger (Grignon), PSH (SPE, Avignon), UMR Agroécologie (Dijon), IGEPP (Rennes)
Participants MaIAGE : Katarzyna Adamczyk - Equipe(s) : Dynenvie

FlavoPatho
- ANR- Jeunes chercheurs, jeunes chercheuses
Défi et/ou Axe : Défi : 5 - "Sécurité alimentaire et défi démographique"
(2018-2022)
Titre : Investigation of salmonid fish infection by Flavobacterium psychrophilum: from genes to the ecology of the disease.
Coordinateur : T. Rochat (INRA VIM)
Partenaires : INRA VIM (Jouy-en-Josas)
Participants MaIAGE : C. Guérin, P. Nicolas - - Equipe(s) : StatInfOmics

INITIATE
- INRAE Métaprogramme- SumCrop- (2020-2022)
Titre : INITIATE
Coordinateur : S. Gaba (INRAE) et F. Carpentier (MaIAGE)
Partenaires : Bioger (Grignon), BioSP (Avignon)
Participants MaIAGE : F. Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie

IRONMANOMICS
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2018-2020)
Titre : Exploring omics data for evaluating microbial interactions for iron
Coordinateur : MC Champomier-Verges (Micalis, Jouy)
Partenaires : MICALIS, MGP, MaIAGE, UMRF (Aurillac), ETH Zurich
Participants MaIAGE : S Labarthe, B Laroche, V Loux - Equipe(s) : Dynenvie / Migale

IS-MIRRI21
- H2020- H2020-INFRADEV-2018-2020- (janvier 2020)
Titre : Implementation and Sustainability of Microbial Resource Research Infrastructure for 21st Century
Coordinateur : Nelson LIMA
Partenaires : University of Minho, University of Valencia, Institut Pasteur, Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, University of Torino, INSTITUT OF THE RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES , CIRM (INRAE), University of Latvia ...
Participants MaIAGE : M-Y Mistou, M Zaarour - Equipe(s) : StatInfOmics

KINETICS
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2018-2020)
Titre : Network and modelling analyses to describe the dynamics of the Ixodes ricinus microbiome and its influence in pathogen dynamics
Coordinateur : T Pollet (INRA UMR BIPAR, Maisons Alfort)
Partenaires : BIPAR (Maisons Alfort), EPIA (Theix), MIA Paris
Participants MaIAGE : B Laroche, S Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie

LIAISON-V
- AMI IA (2020-2022)
Titre : L’Intelligence Artificielle Innove pour la Surveillance Officielle Nationale des Végétaux
Coordinateur : STRUGAREK M. (DGAL/SASPP/SDQSPV/BSV)
Partenaires : DGAL/SASPP/SDQSPV/BSV, BioSP
Participants MaIAGE : C. Nédellec, R. Bossy, L. Deléger - Equipe(s) : Bibliome

Meta PDO cheeses
- France Génomique- (2017-2021)
Titre : Nature et rôle des moteurs biotiques dans la construction des communautés microbiennes des fromages traditionnels
Coordinateur : F. Irlinger (INRA, Grignon) ; C. Delbès (INRA, Aurillac)
Partenaires : INRA GMPA, INRA URF, INRA MICALIS, Genoscope, RMT Fromages de Terroir, CNAOL , CNIEL
Participants MaIAGE : A.-L. Abraham, V. Loux, M. Mariadassou, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics

Mfd Profiling
- TWB 2019- (2019-2021)
Titre : Mfd profiling
Coordinateur : Gwenaëlle andré-Leroux (INRA, MaIAGE) et Nalini Rama Rao (INRA, Micalis)
Partenaires : Micalis
Participants MaIAGE : Gwenaëlle andré-Leroux - Equipe(s) : StatInfOmics

MoMIR-PPC
- H2020- EJP MedVet - (2018-2020)
Titre : Monitoring the gut microbiota and immune response to predict, prevent and control zoonoses in humans and livestock in order to minimize the use of antimicrobials
Coordinateur : P. Velge (ISP, Tours)
Partenaires : 41 partenaires européens dont ISP (INRA Tours), ANSES
Participants MaIAGE : C. Bidot, S. Labarthe, B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie

PhyloVir
- INRAE Métaprogramme- Appel à propositions SumCrop 2020- (2020-2021)
Titre : Mieux comprendre les émergences virales : analyse phylodynamique de deux virus de plantes
Coordinateur : P. Hoscheit (MaIAGE)
Partenaires : Pathologie Végétale (INRAE Avignon)
Participants MaIAGE : P. Hoscheit - Equipe(s) : Dynenvie

REDLOSSES
- ANR- ANR blanche-
Défi et/ou Axe : Sécurité alimentaire et défi démographique
(2016-2020)
Titre : Réduction des pertes alimentaires par la prédiction des altérations microbiologiques
Coordinateur : Monique Zagorec (INRA-SECALIM)
Partenaires : INRA-SECALIM, IFIP, INRA-MICALIS, Lubem, AERIAL, ITAVI, Cooperl Innovation, LDC, ULg-DDA
Participants MaIAGE : V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale

REMOVE
- INRAE- Département MICA- (2018-2020)
Titre : Improving the colonization REsistance of the gut MicrobiOta against Vancomycin-resistant Enterococci
Coordinateur : L Rigottier (Micalis, Jouy)
Partenaires : MICALIS (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
Participants MaIAGE : B Laroche, S Labarthe - Equipe(s) : Dynenvie

Stat4Plant
- ANR- PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé
(2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Coordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPB
Participants MaIAGE : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics

µFlyAdapt
- INRAE Métaprogramme- AMI 2019 Holoflux - lettre d'intention- (2020-2021)
Titre : Rôle des interactions plantes-microbiotes dans l’adaptation d’un insecte ravageur à son hôte
Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)
Partenaires : IGEPP (Rennes), GenoSol (Dijon)
Participants MaIAGE : V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale