Prochains séminaires organisés par l'unité



  • Lundi 18 janvier 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    Bernard Cazelles
    (Ecole Normale Supérieure, Sorbonne Université)
    Accounting for non-stationarity in epidemiological models: It could prove very useful for dealing with a potential pandemic…

    The spread of disease through human populations is a complex phenomenon. The characteristics of disease propagation evolve with time, as a result of a multitude of environmental and anthropic factors. This non-stationarity is a key factor in this huge complexity. In the absence of appropriate external data sources, to correctly describe the disease propagation, we have proposed a flexible approach, based on stochastic models for the disease dynamics, and on diffusion processes for the parameter dynamics. Coupled with particle MCMC, this approach allows us to reconstruct the time evolution of some key parameters. Thus, by capturing the time-varying nature of the different mechanisms involved in disease propagation, the epidemic can be suitably described.

    This framework could be particularly useful for dealing with a potential pandemic which would have characteristics that do not allow effective understanding of its propagation, for instance: silent transmission and/or a major time variation in the reporting of cases. The latter could occur due to lack of timely or appropriate testing, Public Health interventions and/or modification of human behavior during the epidemic. This original framework would enable us to reconstruct the time evolution of the transmission rate of the pathogen based purely on the available data without specific hypothesis on its evolution. Then we would follow both the course of this epidemic and the time evolution of its effective reproduction number. The interest of our approach would be of critical importance when deciding on mitigation factors and balancing health, societal and economic consequences of any proposed mitigation measures.

  • Lundi 01 février 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    Axel Cournac
    (Institut Pasteur)
    TBA
  • Lundi 15 février 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    Vincent Brault
    (Université Grenoble Alpes - CNRS - Grenoble INP, Laboratoire Jean Kuntzmann)
    Utilisation du pooling pour les tests RT-qPCR

    L'une des problématiques de la pandémie actuelle de COVID-19 est la nécessité de pouvoir tester le plus largement possible les populations afin de mieux détecter la propagation et l'évolution. Toutefois, des problèmes techniques ont été mis en avant comme la tension sur la disponibilité des réactifs. Pour limiter ce problème, les méthodes de pooling (mélange de plusieurs échantillons avant de faire le test) sont régulièrement considérées en RT-qPCR (voir par exemple Gollier et Gossner (2020)).

     

    Dans cet exposé, nous commencerons par expliquer en quoi consiste un test RT-qPCR et ce que cela implique sur les faux positifs et négatifs. Nous verrons ensuite le principe du pooling et comment cette procédure influence les résultats sur le taux de faux négatifs~; nous verrons en particulier l'importance de connaître la distribution de la concentration en charge virale. Nous continuerons donc sur la difficulté d'estimer cette concentration et nous conclurons par quelques procédures qui pourraient être appliquées pour aider en cette période de crise.

  • Lundi 01 mars 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    Stefan Müller
    (University of Vienna)
    TBA
  • Lundi 15 mars 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA
  • Lundi 29 mars 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    Olivier le Maitre
    (École Polytechnique, CMAP)
    TBA
  • Lundi 12 avril 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA
  • Lundi 26 avril 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA
  • Lundi 10 mai 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA
  • Lundi 31 mai 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA
  • Lundi 14 juin 2021 - - Salle de réunion 142, bâtiment 210
    TBA
    TBA