Evénements scientifiques organisés par l'unité



Les membres de l'unité MaIAGE sont régulièrement impliqués dans l'organisation de conférences/workshops/écoles-chercheurs. En voici un aperçu :

2020


Workshop Articulate :
Workshop Articulate : articuler données, modèles et expérimentation en écologie microbienne 17-03-2020 MaIAGE 210
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Simon Labarthe

Site web : https://maiage.inrae.fr/fr/node/1199

Une matinée de présentations scientifiques sur l'articulation de données omiques, de modèles et d'expérimentations en écologie microbienne

2019


StatMathAppli 2019 :
Mathematical Statistics and Applications 2-6 septembre 2019 Fréjus, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Estelle Kuhn

Site web : http://statmathappli.mia.inra.fr/statmathappli/fr

L'objectif du séminaire est d'offrir une opportunité aux jeunes statisticiens de divers pays de se rencontrer et de présenter leurs travaux lors d'un meeting international. Son programme s'articule autour de deux cours dispensés par des chercheurs de renommée mondiale, présentant des méthodes de statistiques mathématiques ou plus généralement de mathématiques appliquées, en relation avec des applications. En 2019 les conférenciers invités sont Sébastien Bubeck et Peter Bühlmann


SMPGD 2019 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data 31 janvier - 01 février 2019 Barcelone, Espagne
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : https://smpgd2019.sciencesconf.org

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein


RCAM'19 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 2019 30 septembre - 1er octobre 2019 Paris, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2019

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.

2018


SMPGD 2018 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data 11-12 janvier 2018 Montpellier, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : https://smpgd2018.sciencesconf.org

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein


RCAM'18 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 2018 9 septembre 2018 Athènes, Grèce
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2018

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.

2017


Workshop in computational modeling :
Workshop "Recent​ ​ progress​ ​ in​ ​ computational​ ​ modeling: cells​ ​ and​ ​ cell​ ​ communities" 13-15 novembre 2017 Jouy-en-Josas
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : (s) par l'animation :

This workshop on modeling cells and cell communities addresses technical challenges characteristic of complex and modular cell models. The presentations will describe whole-cell models encompassing metabolism, protein expression, and other cellular subsystems, as well as multi-cell models describing tissues or microbial communities. In the practical part of the workshop, we explored automated model construction, submodel coupling, and possible uses of SBML in setting up heterogeneous cell models. In particular, we discussed the usage of the SBML “comp” package to couple dynamic and stoichiometric models, and novel XML and SBML file formats for Resource Balance Analysis models.


Mascot-Num 2017 :
Journées 2017 du GdR Mascot-Num 22 au 24 mars 2017 Paris, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : H. Monod

GCC 2017 :
Galaxy Community Conference 26-30 juin 2017 Montpellier, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : O. Inizan

Site web : https://gcc2017.sciencesconf.org/

Galaxy Community Conferences are an opportunity to participate in presentations, discussions, demos, poster sessions, lightning talks and birds-of-a-feather gatherings, all about high-throughput biology and the tools that support it.  GCC2017 will include keynote talks and exhibitors, and plenty of networking opportunities. There are also three days of pre-conference activities, including hackathons and training. If you work in data-intensive biomedical research, there is no better place than GCC2017 to present your work and to learn from others.


StatMathAppli 2017 :
Mathematical Statistics and Applications 4-8 septembre 2017 Fréjus, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : https://colloque.inra.fr/statmathappli

L'objectif du séminaire est d'offrir une opportunité aux jeunes statisticiens de divers pays de se rencontrer et de présenter leurs travaux lors d'un meeting international. Son programme s'articule autour de deux cours dispensés par des chercheurs de renommée mondiale, présentant des méthodes de statistiques mathématiques ou plus généralement de mathématiques appliquées, en relation avec des applications. En 2017 les conérenciers invités sont Franis Bach pour un cours intitulé "Large-scale machine learning and convex optimization" et Andréa Montanari pour un cours intitulé "Statistics with matrices, graphs, and tensors".


SMPGD 2017 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data 12-13 janvier 2017 London,UK
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : https://www.smpgd.fr

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein


RCAM'17 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 2017 9-10 octobre 2017 Paris, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2017

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.

2016


Écologie Microbienne :
École Chercheurs Écologie Microbienne 14-17 juin 2016 Pont-à-Mousson
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Béatrice Laroche, Mahendra Mariadassou

Les objectifs de l'École-Chercheurs sont de (1) s’approprier les concepts d’écologie et plus particulièrement d’écologie microbienne et les partager grâce à un vocabulaire commun, (2) d'optimiser l’exploitation des données massives hétérogènes et proposer des approches d’analyse génériques et enfin (3) stimuler l’émergence de nouveaux projets transdisciplinaires.


BioNLP ST :
BioNLP Shared Task 13 août 2016 Berlin (Germany)
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : R. Bossy, C. Nédellec

Site web : http://2016.bionlp-st.org/

BioNLP Shared Task is a series of Shared Task in Information Extraction from text in Biology. We contribute to the general organisation and to the organization of specific tasks on gene regulation in bacteria (LLL, BI, GRN) and plant (GRNA) and bacteria habitats (Bacteria Biotope tasks). 


SMPGD 2016 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data 11-12 février 2016 Lille, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : http://math.univ-lille1.fr/~celisse/SMPGD/

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein


RCAM'16 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 2016 4 septembre 2016 The hague, Netherlands
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2016

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.

2015


Galaxy4Bioinformatics :
Développement et intégration d’applications sous Galaxy 3 au 5 mars 2015 La Chapelle sur Erdre
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Sandra Derozier, Valentin Loux, Franck Samson

Site web : http://galaxy4bioinformatics.sb-roscoff.fr

L'objectif de cette école est de former des ingénieurs en bioinformatique à l'installation, la configuration du portail Galaxy ainsi qu'à la construction d'interfaces. La dernière journée sera consacrée à des aspects plus avancés comme l'automatisation des traitements et l'installation facilitée d'outils. 


StatMathAppli 2015 :
Mathematical Statistics and Applications 31 août - 5 septembre 2015 Fréjus, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : https://colloque.inra.fr/statmathappli

L'objectif du séminaire est d'offrir une opportunité aux jeunes statisticiens de divers pays de se rencontrer et de présenter leurs travaux lors d'un meeting international. Son programme s'articule autour de deux cours dispensés par des chercheurs de renommée mondiale, présentant des méthodes de statistiques mathématiques ou plus généralement de mathématiques appliquées, en relation avec des applications. Two short courses given by Ery Arias-Castro (San Diego) and Emmanuel Candes (Stanford University)


SMPGD 2015 :
Statistical Methods for Post-Genomic Data 12-13 février 2015 Munich, Germany
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Huet

Site web : http://gagneurweb.genzentrum.lmu.de/smpgd15/#/smpgd2015

This workshop aims at gathering statisticians, computer scientists, and biologists to discuss new statistical methodologies for the analysis of high throughput biological data and the challenge arising herein


RCAM'15 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 20195 6 octobre 2015 Paris, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://maiage.jouy.inra.fr/?q=fr/rcam2015

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.


Module de formation INRA-FPN : RNASeq-2015 :
Analyses bio-informatiques & bio-statistiques de données RNAseq 1 au 4 décembre 2015 Jouy en Josas
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Julie Aubert, Sandra Dérozier, Cyprien Guérin, Valentin Loux, Sophie Schbath

Les objectifs de cette action de formation sont de permettre aux participants de :

  • Se familiariser avec les concepts et outils de bio-informatique et de bio-statistique dédiés au traitement des données RNAseq.
  •  Savoir enchaîner de façon pertinente un ensemble d’outils bio-informatiques et bio- statistiques.
  • Maîtriser des environnements de mise en œuvre de ces outils (Galaxy, R-Studio). 

2014


ECCB'14 :
European Conference on Computational Biology 6-10 septembre 2014 Strasbourg, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : S. Schbath

Site web : http://www.eccb14.org/home

13ème édition de la conférence annuelle européenne de bioinformatique


RCAM'14 :
Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)" 2014 7 septembre 2014 Strasbourg, France
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : V. Loux, M. Mariadassou, S. Schbath

Site web : http://www.eccb14.org/program/workshops/rcam

This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers), computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis.


Module de formation INRA-FPN : RNASeq-2014 :
Analyses bio-informatiques & bio-statistiques de données RNAseq 25 au 28 novembre 2014 Jouy en Josas
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Julie Aubert, Sandra Derozier, Cyprien Guérin, Valentin Loux, Sophie Schbath

Les objectifs de cette action de formation sont de permettre aux participants de :

  • Se familiariser avec les concepts et outils de bio-informatique et de bio-statistique dédiés au traitement des données RNAseq.
  •  Savoir enchaîner de façon pertinente un ensemble d’outils bio-informatiques et bio- statistiques.
  • Maîtriser des environnements de mise en œuvre de ces outils (Galaxy, R-Studio). 

École - Chercheurs ASPEN :
Analyse de sensibilité, propagation d'incertitudes et exploration numérique de modèles en sciences de l'environnement. 4-9 mai 2014 Les Houches, France.
Membre(s) de l'unité concerné(s) par l'animation : Hervé Monod

Site web : http://aspen.forge.imag.fr/

Dans les sciences de l'environnement, mais également dans divers domaines de l'ingénierie, de nombreux codes de calcul dépendent d'un grand nombre de paramètres et de variables d'entrées. L'école ASPEN a pour objectif d'exposer les méthodes les plus récentes pour la propagation d'incertitudes, l'analyse de sensibilité et l'exploration numérique de ces codes et des modèles asssociés.