Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 

 

Evtimova Mariya

Sujet
Alignement d'ontologie
Date de début
Date de fin
Encadrant(s)
Liliana Ibanescu, Claire Nédellec
Equipe(s)
Contrat de recherche
D2KAB
Description/résumé
  • La tâche s'inscrit dans le scénario "blé tendre" du projet ANR D2KAB.
  • Les données extraites de documents et les données d'observations sur les phénotypes du blé sont gérées/annotées par des concepts de deux ontologies distinctes (WTO et CO_321). Leur alignement permettra une interrogation transparente et conjointe des deux ensembles de données. Les alignements seront intégrés dans le système d'information GnpIS développé par l’URGI. 
  • La tâche porte sur une analyse approfondie de l’alignement des classes. Un outil d'alignement pourra être mis en place pour optimiser le travail. L'ensemble des ressources (ontologie, guide) et des résultats (guide mis à jour, outil d'alignement, correspondances et alignement) sont partagés en ligne entre les participants du projet : les équipes Bibliome-MaIAGE (INRAE Jouy-en-Josas), URGI (INRAE Versailles)) et DiPSO (INRAE Versailles).