Dans le cadre d’un projet visant à contrer l’antibiorésistance, Flora Lefebvre, ingénieur chimiste va être en charge de la synthèse chimique de molécules dirigées contre Mfd, cible inédite chez les bactéries.

Organiser et participer aux différents meetings rassemblant les responsables de collections microbiennes pour l'élaboration de la stratégie de recherche de  MIRRI , et  organiser  la contribution des collections microbiennes de  l’INRAE ( groupées au sein du CIRM) à MIRRI.

• La tâche s'inscrit dans le scénario "blé tendre" du projet ANR D2KAB.
• Les données extraites de documents et les données d'observations sur les phénotypes du blé sont gérées/annotées par des concepts de deux ontologies distinctes (WTO et CO_321).

Ce projet a pour objectif l’étude des transmissions verticales et horizontales de gènes de résistance aux antibiotiques du microbiote intestinal, par le suivi de 12 familles sur trois générations successives de poulets de chair issus du même lot parental et élevés dans deux environnements expérimentaux différents (dits « reproduction » ou « testage ») calqués sur la structuration de la filière avicole.

La mission consiste à mettre en place un service de courtage de données (“data brokering”) à l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) en partenariat avec les infrastructures nationales productrices de données (France Génomique, France Bio Imaging, MetaboHub, PROFI, ...) et les ressources internationales d’archivage de données, en particulier, l’European Nucleotide Archive (ENA) de l’European Bioinformatics Institute (EBI).