Florilege

Florilege is a database gathering microbial habitats, phenotypes and uses. The Florilege application completes knowledge described in other databases with knowledge from the literature on microbial biodiversity, as well as their comparison for further analysis. A key knowledge in microbiology is the microbial biotope and the phenotypes of the microorganism.

FERRE_Arnaud

Développement d'une méthode semi-supervisée pour étiqueter des termes de textes par les concepts d'une ontologie. La méthode génère par word embeddings des représentations vectorielles continues des termes complexes dans un espace sémantiquement structuré par l'ontologie du domaine. Ces vecteurs sont plongés dans l'espace vectoriel construit à partir de la structure de l’ontologie. Le plongement est obtenu par entraînement d’un modèle. Le calcul de distance entre vecteurs de termes et vecteurs de concepts détermine ensuite l'étiquetage ontologique des termes. 

 

FENG Yajing

Analyse des erreurs et extension de la méthode CONTES pour la normalisation des entités nommées par des ontologies. Applications aux données des habitats microbiens et des phénotypes microbiens et végétaux.