Stage Master M2 - Extraction d’Information sur les maladies transmises par vecteurs chez les plantes

Durée
5
Date de début
Date limite de candidature

Le projet porte sur l’extraction automatique de relations biologiques à partir de documents. Il ciblera en priorité trois espèces particulières de psylles (insectes piqueurs suceurs) vecteurs de bactéries responsables de maladies des arbres fruitiers. Les événements représentant les interactions biologiques entre microbe, insecte, plante et leurs lieux et dates d’observation sont dénotés dans les textes scientifiques par des formulations complexes variables qui portent fréquemment sur plusieurs phrases. L’enjeu sera d’extraire ces événements (relations n-aires) par des méthodes d’apprentissage profond (deep learning, language models) avec un nombre limité d’exemples produits manuellement et à l’aide de bases de connaissance externes. 

En savoir plus
Stage IEV.pdf (286.48 Ko)
Contact
Claire NĂ©dellec, claire.nedellec@inrae.fr
Vincent Guigue, vincent.guigue@agroparistech.fr
Nicolas Sauvion, nicolas.sauvion@inrae.fr