IS-MIRRI21 - H2020- H2020-INFRADEV-2018-2020- (janvier 2020)
Titre : Implementation and Sustainability of Microbial Resource Research Infrastructure for 21st Century
Participants : M-Y Mistou, M Zaarour - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : University of Minho, University of Valencia, Institut Pasteur, Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, University of Torino, INSTITUT OF THE RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES , CIRM (INRAE), University of Latvia ...Coordinateur : Nelson LIMA
TANDEM - INRAE Métaprogramme- projets-phares HOLOFLUX- (2021-2023)
Titre : TrAnfers iN Dairy systEM
Participants : M. Mariadassou, A-L. Abraham, H. Chiapello, P. Nicolas, G. Kon-Kam-King - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : UR OPAALE, UMR Agroécologie, UREP, UMRH, UMR MEDIS, UMRF, UR LBE, UE Herbipôle, UMR Territoires, UMR InnovationCoordinateur : C. Delbès, UMR Fromage, Aurillac
ECONET - ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Sober management of resources and adaptation to climatic changes: towards an under- standing of global changes Axe : Fundamental knowledge on natural environments and biodiversity (2018-2022)
Titre : Advanced statistical modelling of ecological networks
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : LPSM (UPMC), MIA-Paris (INRA), LBBE (Univ. Lyon), ISEM (Univ. Montpellier), IEES (MNHN), EEP (Univ. Lille) Coordinateur : C. Matias (CNRS - UPMC, LPSM)
CoNoCo - ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN (2019-2023)
Titre : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : Micalis (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).Coordinateur : E. Bidnenko (INRA Micalis)
DeepImpact - ANR- PPR-
Défi et/ou Axe : Cultiver et Produire Autrement (2020 - 2025)
Titre : Deciphering plant-microbiota interactions to enhance crop defenses to pests
Participants : M.Mariadassou, S. Schbath - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : INRA IGEPP (Rennes), INRA Agroécologie (Dijon), INRA BFP, INRA BIOGER, INRA ECOBIO, INRA GDEC, IRISA (Rennes), CNRS - LBBE LEM (Lyon), INRA LIPM (Toulouse)Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)
DeMuSi - PCSI-
Défi et/ou Axe : Appel à projets : Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques et perspectives thérapeutiques : Apports à l’oncologie de la physique, de la chimie et des sciences de l’ingénieur (2022-2025)
Titre : Deciphering the mutational signature of transcription and DNA repair processes combined with exogenous DNA damages (DeMuSi)
Participants : P. Nicolas, G. Kon Kam King, C. Guérin - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : CEA I2BC (J. Soutourina), CEA Saclay (F. Mallogi), INSERM Gustave-Roussy (S. Nikolaev)Coordinateur : J. Soutourina (CEA I2BC)
BioBrickEvolver - ANR- AAPG2018 - PRC
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système (01/2019-12/2022)
Titre : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis.
Participants : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Eq. C. Berthomieu), TWB (O. Galy)))Coordinateur : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)
MassMut - DIM Elicit - Région IdF - Appel à projets 2021 : Allocation postdoc/ingénieur- (2022-2023)
Titre : Développement d’un dispositif microfluidique pour l’analyse de l’accumulation massive de mutations dans des conditions normales et mutagènes
Participants : P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : F. Malloggi (LIONS-CEA), J. Soutourina (I2BC-CEA)Coordinateur : F. Malloggi
HoloE2Plant - H2020- ERC Starting Grant- (2022-2026)
Titre : Exploring the Holobiont concept through a Plant Evolutionary Experiment study
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : IRISA (Rennes), Department of Systematic and Evolutionary biology (Univ. Zurich)Coordinateur : Claudia Bartoli
HARMONI - Appel d'offres Ibisa (Infrastructure en BIologie, Santé et Agronomie) 2021 pour les centres de ressources biologiques- (2022-2024)
Titre : Harmonizing microbiota characterization procedures within the national infrastructure RARe
Participants : MY Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : Michèle Tixier (GABI, @bridge, Jouy), Mathieu Almeida et Christian Morabito (MGP, Jouy), Samuel Mondy (GenoSol), Emmanuelle Helloin (CIRM-BP, Tours), Florence Valence (CIRM-BIA, Rennes)Coordinateur : Michel-Yves Mistou (INRAE, MaIAGE, Jouy)
EggToMeat - INRAE Métaprogramme- HOLOFLUX (2021-2023)
Titre : Impact de l’environnement d’élevage sur les flux bactériens en lien avec la santé, la robustesse des animaux et la qualité des produits chez le poulet de chair
Participants : B. Laroche, M. Mariadassou, V. Loux, C. Hennequet-Antier - Equipe(s) : Dynenvie / Migale / StatInfOmics
Partenaires : MICALIS, GABI, BOA, PEAT, EASM, ITAVI, ISP, SECALIMCoordinateur : M. Zagorec (SECALIM, Nantes)
MetaSimFood - ANR- ANR Blanche
Défi et/ou Axe : Axe 1.5 Alimentation et Systèmes Alimentaires (2021 - 2025)
Titre : Improving the quality, safety and sustainability of fermented vegetable food and fruit beverage using a knowledge-driven synthetic ecology and modelling approach
Participants : M. Mariadassou, V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : Micalis (INRAE Jouy-en-Josas), SayFood (INRAE Versailles), Aérial (ITAI, Illkirch), UR Oenologie (Univ. Bordeaux), STLO-CIRM (INRAE, Rennes)Coordinateur : S. Chaillou (Micalis, INRAE)
ECOS-SUD Mfd-Profiling - ECOS-Sud (2020-2022)
Titre : In vitro/in silico/in cristallo Potentiation of the Inhibition of Mfd in presence of its Cognate Partner UvrA
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : IBR CONICET (Argentine), Micalis (Jouy)Coordinateur : G. André-Leroux (MaIAGE)
FlavoPatho - ANR- Jeunes chercheurs, jeunes chercheuses
Défi et/ou Axe : Défi : 5 - "Sécurité alimentaire et défi démographique" (2018-2022)
Titre : Investigation of salmonid fish infection by Flavobacterium psychrophilum: from genes to the ecology of the disease.
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : INRA VIM (Jouy-en-Josas)Coordinateur : T. Rochat (INRA VIM)
MutaToR - ANR- AAPG2022-
Défi et/ou Axe : CE12 Génétique, génomique et ARN (2022-2026)
Titre : Mechanisms of mutational processes involving transcription and nucleotide-excision DNA repair
Participants : C. Guérin, G. Kon Kam King, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : J. Soutourina (CEA-CNRS-I2BC), F. Malloggi (LIONS-CEA)Coordinateur : J. Soutourina
Stat4Plant - ANR- PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé (2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPBCoordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
noacronym - INCA-AAP-PLBIO2022 (2022-2026)
Titre : Mutational mechanisms behind signatures caused by endogenous processes and exogenous DNA damage:
role of DNA repair and transcription
Participants : Guillaume Kon Kam King, Cyprien Guérin, Pierre Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : I2BC-CEA (Julie Soutourina), CEA (Florent Malloggi), INSERM (Sergey Nikolaev)Coordinateur : Julie Soutourina
PHHASt - ANR- AAPG2022
Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des micro-organismes (2022-2026)
Titre : Phenotypic heterogeneity and host adaptation during late infection in sporulating Firmicutes
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : L. Slamti (MICALIS), F. Neulat-Ripoll (IRBA)Coordinateur : L. Slamti