Liste contrats et projets en cours StatInfOmics


TANDEM
- INRAE Métaprogramme- projets-phares HOLOFLUX- (2021-2023)
Titre : TrAnfers iN Dairy systEM
Participants : M. Mariadassou, A-L. Abraham, H. Chiapello, P. Nicolas, G. Kon-Kam-King - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : UR OPAALE, UMR Agroécologie, UREP, UMRH, UMR MEDIS, UMRF, UR LBE, UE Herbipôle, UMR Territoires, UMR Innovation
Coordinateur : C. Delbès, UMR Fromage, Aurillac

Holobionte
- ANR- PEPR AgroEcologie Numérique- (2023-2028)
Titre : Animal holobionts: a new biological scale to explore genetic diversity and refine breeding strategies for agroecology
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : GABI (Jouy-en-Josas), GenPhyse (Toulouse), IRISA (Rennes), MIAT (Toulouse), MetaGenoPolis (Jouy-en-Josas), UMRH (Clermont-Ferrand)
Coordinateur : S. Combes (GenPhyse, INRAE Toulouse), J. Estellé Fabrellas (GABI, INRAE Jouy-en-Josas)

CoNoCo
- ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN
(2019-2023)
Titre : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : Micalis (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
Coordinateur : E. Bidnenko (INRA Micalis)

DeepImpact
- ANR- PPR-
Défi et/ou Axe : Cultiver et Produire Autrement
(2020 - 2025)
Titre : Deciphering plant-microbiota interactions to enhance crop defenses to pests

Participants : M.Mariadassou, S. Schbath - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : INRA IGEPP (Rennes), INRA Agroécologie (Dijon), INRA BFP, INRA BIOGER, INRA ECOBIO, INRA GDEC, IRISA (Rennes), CNRS - LBBE LEM (Lyon), INRA LIPM (Toulouse)
Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)

DeMuSi
- ITMO Cancer - PCSI 2022-
Défi et/ou Axe : Appel à projets : Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques et perspectives thérapeutiques : Apports à l’oncologie de la physique, de la chimie et des sciences de l’ingénieur
(2022-2025)
Titre : Deciphering the mutational signature of transcription and DNA repair processes combined with exogenous DNA damages (DeMuSi)

Participants : P. Nicolas, G. Kon Kam King, C. Guérin - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : CEA I2BC (J. Soutourina), CEA Saclay (F. Mallogi), INSERM Gustave-Roussy (S. Nikolaev)
Coordinateur : J. Soutourina (CEA I2BC)

HoloE2Plant
- H2020- ERC Starting Grant- (2022-2026)
Titre : Exploring the Holobiont concept through a Plant Evolutionary Experiment study
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : IRISA (Rennes), Department of Systematic and Evolutionary biology (Univ. Zurich)
Coordinateur : Claudia Bartoli

HARMONI
- Appel d'offres Ibisa (Infrastructure en BIologie, Santé et Agronomie) 2021 pour les centres de ressources biologiques- (2022-2024)
Titre : Harmonizing microbiota characterization procedures within the national infrastructure RARe
Participants : MY Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : Michèle Tixier (GABI, @bridge, Jouy), Mathieu Almeida et Christian Morabito (MGP, Jouy), Samuel Mondy (GenoSol), Emmanuelle Helloin (CIRM-BP, Tours), Florence Valence (CIRM-BIA, Rennes)
Coordinateur : Michel-Yves Mistou (INRAE, MaIAGE, Jouy)

DOMINO
- H2020- HORIZON-CL6-2021-FARM2FORK-01- (2022-2027)
Titre : Harnessing the microbial potential of fermented foods for healthy and sustainable food systems
Participants : V. Loux, M. Mariadassou, H. Chiapello - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : 21 partenaires, 10 pays
Coordinateur : S. Chaillou (INRAE, Jouy-en-Josas)

EggToMeat
- INRAE Métaprogramme- HOLOFLUX (2021-2023)
Titre : Impact de l’environnement d’élevage sur les flux bactériens en lien avec la santé, la robustesse des animaux et la qualité des produits chez le poulet de chair
Participants : B. Laroche, M. Mariadassou, V. Loux, C. Hennequet-Antier - Equipe(s) : Dynenvie / Migale / StatInfOmics
Partenaires : MICALIS, GABI, BOA, PEAT, EASM, ITAVI, ISP, SECALIM
Coordinateur : M. Zagorec (SECALIM, Nantes)

MetaSimFood
- ANR- ANR Blanche
Défi et/ou Axe : Axe 1.5 Alimentation et Systèmes Alimentaires
(2021 - 2025)
Titre : Improving the quality, safety and sustainability of fermented vegetable food and fruit beverage using a knowledge-driven synthetic ecology and modelling approach

Participants : M. Mariadassou, V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : Micalis (INRAE Jouy-en-Josas), SayFood (INRAE Versailles), Aérial (ITAI, Illkirch), UR Oenologie (Univ. Bordeaux), STLO-CIRM (INRAE, Rennes)
Coordinateur : S. Chaillou (Micalis, INRAE)

Agro-Serv
- H2020- HORIZON-INFRA-2021-SERV-01-02- (2022-2027)
Titre : Integrated SERVices supporting a sustainable AGROecological transition
Participants : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : 42 partenaires - Infrastructures de recherche: Anaee/Emphasis/Elixir/EMBRC/EURo Bioimaging/EU OpenScreen/MetroFood/SmartCow/IBISBA/LifeWatch/MIRRI
Coordinateur : Michel Boer Anaee CNRS

MutaToR
- ANR- AAPG2022-
Défi et/ou Axe : CE12 Génétique, génomique et ARN
(2023-2026)
Titre : Mechanisms of mutational processes involving transcription and nucleotide-excision DNA repair
Participants : C. Guérin, G. Kon Kam King, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : J. Soutourina (CEA-CNRS-I2BC), F. Malloggi (LIONS-CEA)
Coordinateur : J. Soutourina

Stat4Plant
- ANR- PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé
(2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPB
Coordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)

MICROBE
- H2020- HORIZON-INFRA-2022-TECH-01-01 RIA- (2023-2026)
Titre : MICRObiome Biobanking (RI) Enabler
Participants : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : AIT (AUS) - DSMZ (GER) - EMBL (UK) - CABI (UK) - HMGU (GER) - MUG (AUS) - SU (FR)
Coordinateur : Tanja KOSTIC - Austrian Institute of Technology (AIT)

noacronym
- INCA-AAP-PLBIO2022 (2022-2026)
Titre : Mutational mechanisms behind signatures caused by endogenous processes and exogenous DNA damage:
role of DNA repair and transcription

Participants : Guillaume Kon Kam King, Cyprien Guérin, Pierre Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : I2BC-CEA (Julie Soutourina), CEA (Florent Malloggi), INSERM (Sergey Nikolaev)
Coordinateur : Julie Soutourina

PHHASt
- ANR- AAPG2022-
Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des micro-organismes
(2022-2026)
Titre : Phenotypic heterogeneity and host adaptation during late infection in sporulating Firmicutes
Participants : S. Dérozier, C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : L. Slamti (MICALIS), F. Neulat-Ripoll (IRBA)
Coordinateur : L. Slamti