IS-MIRRI21
- H2020- H2020-INFRADEV-2018-2020- (janvier 2020)
Titre : Implementation and Sustainability of Microbial Resource Research Infrastructure for 21st Century
Participants : M-Y Mistou, M Zaarour - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : University of Minho, University of Valencia, Institut Pasteur, Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, University of Torino, INSTITUT OF THE RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES , CIRM (INRAE), University of Latvia ...
Coordinateur : Nelson LIMA

TANDEM
- INRAE Métaprogramme- projets-phares HOLOFLUX- (2021-2023)
Titre : TrAnfers iN Dairy systEM
Participants : M. Mariadassou, A-L. Abraham, H. Chiapello, P. Nicolas, G. Kon-Kam-King - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : UR OPAALE, UMR Agroécologie, UREP, UMRH, UMR MEDIS, UMRF, UR LBE, UE Herbipôle, UMR Territoires, UMR Innovation
Coordinateur : C. Delbès, UMR Fromage, Aurillac

ECONET
- ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Sober management of resources and adaptation to climatic changes: towards an under- standing of global changes Axe : Fundamental knowledge on natural environments and biodiversity
(2018-2022)
Titre : Advanced statistical modelling of ecological networks
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : LPSM (UPMC), MIA-Paris (INRA), LBBE (Univ. Lyon), ISEM (Univ. Montpellier), IEES (MNHN), EEP (Univ. Lille)
Coordinateur : C. Matias (CNRS - UPMC, LPSM)

CoNoCo
- ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN
(2019-2023)
Titre : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : Micalis (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
Coordinateur : E. Bidnenko (INRA Micalis)

CARE
- H2020- European Joint project One Health- (2020-2022)
Titre : Cross-sectoral framework for quality Assurance Resources for countries in the European Union
Participants : Michel-Yves Mistou, Forum Shah - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : DTU (Copenhage), Institut Pasteur (Pasteur), ANSES (Maisons-Alfort), PIWET (Varsaw),
Coordinateur : Rene Hendriksen

DeepImpact
- ANR- PPR-
Défi et/ou Axe : Cultiver et Produire Autrement
(2020 - 2025)
Titre : Deciphering plant-microbiota interactions to enhance crop defenses to pests

Participants : M.Mariadassou, S. Schbath - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : INRA IGEPP (Rennes), INRA Agroécologie (Dijon), INRA BFP, INRA BIOGER, INRA ECOBIO, INRA GDEC, IRISA (Rennes), CNRS - LBBE LEM (Lyon), INRA LIPM (Toulouse)
Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)

BioBrickEvolver
- ANR- AAPG2018 - PRC
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système
(01/2019-12/2022)
Titre : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis.
Participants : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Eq. C. Berthomieu), TWB (O. Galy)))
Coordinateur : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)

EggToMeat
- INRAE Métaprogramme- HOLOFLUX (2021-2023)
Titre : Impact de l’environnement d’élevage sur les flux bactériens en lien avec la santé, la robustesse des animaux et la qualité des produits chez le poulet de chair
Participants : B. Laroche, M. Mariadassou, V. Loux - Equipe(s) : Dynenvie / Migale / StatInfOmics
Partenaires : MICALIS, GABI, BOA, PEAT, EASM, ITAVI, ISP, SECALIM
Coordinateur : M. Zagorec (SECALIM, Nantes)

MetaSimFood
- ANR- ANR Blanche
Défi et/ou Axe : Axe 1.5 Alimentation et Systèmes Alimentaires
(2021 - 2025)
Titre : Improving the quality, safety and sustainability of fermented vegetable food and fruit beverage using a knowledge-driven synthetic ecology and modelling approach

Participants : M. Mariadassou, V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : Micalis (INRAE Jouy-en-Josas), SayFood (INRAE Versailles), Aérial (ITAI, Illkirch), UR Oenologie (Univ. Bordeaux), STLO-CIRM (INRAE, Rennes)
Coordinateur : S. Chaillou (Micalis, INRAE)

ECOS-SUD Mfd-Profiling
- ECOS-Sud (2020-2022)
Titre : In vitro/in silico/in cristallo Potentiation of the Inhibition of Mfd in presence of its Cognate Partner UvrA
Participants : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : IBR CONICET (Argentine), Micalis (Jouy)
Coordinateur : G. André-Leroux (MaIAGE)

FlavoPatho
- ANR- Jeunes chercheurs, jeunes chercheuses
Défi et/ou Axe : Défi : 5 - "Sécurité alimentaire et défi démographique"
(2018-2022)
Titre : Investigation of salmonid fish infection by Flavobacterium psychrophilum: from genes to the ecology of the disease.
Participants : C. Guérin, P. Nicolas - - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : INRA VIM (Jouy-en-Josas)
Coordinateur : T. Rochat (INRA VIM)

Metachick-2
- Partenaires industriels- (01/2021-12/2021)
Titre : MetaChick phase 2
Participants : AL. Abraham, H. Chiapello, P. Nicolas, G. Kon-Kam-King - Equipe(s) : StatInfOmics
Partenaires : GABI (Jouy-en-Josas), MetaGenoPolis (Jouy-en-Josas), UMR ISP (Nouzilly)
Coordinateur : F. Calenge (GABI, Jouy-en-Josas)

Stat4Plant
- ANR- PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé
(2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPB
Coordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)

Meta PDO cheeses
- France Génomique- (2017-2021)
Titre : Nature et rôle des moteurs biotiques dans la construction des communautés microbiennes des fromages traditionnels
Participants : A.-L. Abraham, V. Loux, M. Mariadassou, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : INRA GMPA, INRA URF, INRA MICALIS, Genoscope, RMT Fromages de Terroir, CNAOL , CNIEL
Coordinateur : F. Irlinger (INRA, Grignon) ; C. Delbès (INRA, Aurillac)