Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Thèses soutenues StatInfOmics
SAHO Mariyam : Analyse et modélisation de données d’accumulation de mutations chez la levure - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : Pierre NICOLAS, Julie SOUTOURINA - Encadrant(s) : Guillaume KON KAM KING - Equipes : StatInfOmics
ALAMICHEL Louise : Bayesian nonparametric methods for complex genomic data - - Soutenue le : - Directeur.trice : ARBEL Julyan, KON KAM KING Guillaume - Equipes : StatInfOmics
JUNKER Romane : Diversité génomique et fonctionnelle des communautés bactériennes associées aux produits végétaux fermentés : une approche interdisciplinaire incluant métagénomique et bioinformatique dans un contexte de recherche-action participative - SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : Hélène Chiapello, Stéphane Chaillou - Encadrant(s) : Hélène Chiapello, Stéphane Chaillou, Michel-Yves Mistou, Florence Valence-Bertel - Equipes : StatInfOmics
EPAIN Victor : Développement de méthodes efficaces, précises et conviviales pour corriger, assembler et aligner des lectures issues des technologies de séquençage 3e génération. - ED601 MathSTIC - Soutenue le : - Directeur.trice : R. Andonov INRIA - J-F Gibrat INRAE - Encadrant(s) : D Lavenier (INRIA) - Equipes : StatInfOmics
BEREUX Stéphane : Modéliser et prédire les modifications microbiennes associées à l’émergence de maladies - ED 574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : Mahendra Mariadassou - Encadrant(s) : Magali Berland, Sébastien Fromentin - Equipes : StatInfOmics
DE SOUSA VIOLANTE Madeleine : Genomics of Salmonella sevovars Mbandaka, Typhimurium and its monophasic variant in milk and pork food sectors - ABIES - Soutenue le : - Directeur.trice : Michel-Yves Mistou - Encadrant(s) : Nicolas Radomski, Ludovic Mallet, Valérie Michel - Equipes : StatInfOmics
TANNEUR Irène : Modélisation et mise en oeuvre d'un système d'évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilisée - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : P. Nicolas - Encadrant(s) : M. Jules (Micalis) - Equipes : StatInfOmics
GOUTORBE Benoit : Développement et application d'une méthode précise et efficace pour l'analyse du microbiote humain à visée clinique - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : Sophie Schbath - Encadrant(s) : P. Halfo (Alphabio), G. Bidaut (INSERM Marseille) - Equipes : StatInfOmics
BICHAT Antoine : Prise en compte de l’organisation hiérarchique des espèces pour la découverte de signatures métagénomiques multi-échelles - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Ambroise (Univ. Very, LaMME) - Encadrant(s) : M. Mariadassou (MaIAGE), J. Plassais (Enterome) - Equipes : StatInfOmics
LAO Julie : Création d'un outil de recherche et d'analyse des éléments mobiles conjugatifs dans les génomes de Firmicutes - ED607 SIRENA - Soutenue le : - Directeur.trice : N. Leblond-Bourget (INRA, DynAMic), H. Chiapello (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics
BASSIGNANI Ariane : Intégration et analyse de données de métaprotéomique quantitative en shotgun pour explorer les fonctionnalités du microbiote intestinal humain dans le cadre des maladies cardiométaboliques - ED394 Physiologie Physiopathologie et Thérapeutique - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Juste (INRA-Micalis) - Encadrant(s) : S. Plancade (MaIAGE), M. Berland (INRA-MGP) - Equipes : StatInfOmics
VILA NOVA Meryl : Détection et identification des mutations et des voies métaboliques associées à l’adaptation à l’hôte dans le pangénome de Salmonella - ED581 ABIES - Soutenue le : - Directeur.trice : M.-Y. Mistou (ANSES) - Encadrant(s) : N. Radomski (Anses), M. Mariadassou (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics
SULTAN Ibrahim : Statistical modeling of bacterial promoter sequences for regulatory motif discovery - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Schbath (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Encadrant(s) : P. Nicolas (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipes : StatInfOmics
BASTIDE Paul : Processus stochastiques avec sauts sur arbres : application à l'évolution adaptative sur des phylogénies - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Robin (INRA, MIA-PAris) - Encadrant(s) : M. Mariadassou (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics
GIGUELAY Jade : Estimation d'une densité discrète sous contrainte de k-monotonie. Application à l'estimation du nombre d'espèces dans une population - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Giraud (LMO) - Encadrant(s) : S. Huet (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics
AUBERT Julie : Analyse statistique de données biologiques à haut débit - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Schbath (MaIAGE) - Encadrant(s) : S. Robin (INRA, MIA-Paris) - Equipes : StatInfOmics