Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Stagiaires Migale
POUPELIN Clément : Meta-analyse exploratoire de jeux de données publics de différents écosystèmes microbiens de la chaîne alimentaire - Master 2 - Nantes Université - ( - )
Encadrant(s) : Christelle Hennequet-Antier, Cédric Midoux, Hélène Chiapello - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
Bekai Lynn : Extraction et visualisation d'informations à partir de banques de données de métabarcoding - M2 - Université Aix-Marseille - ( - )
Encadrant(s) : Olivier Rué - Equipe(s) : Migale
HAK Fiona : Développement d’un pipeline d’analyse de données génomiques pour la reconstruction des potentialités métaboliques de bactéries pressenties pour jouer un rôle dans la fermentation - Master 1 - Université Paris-Saclay - ( - )
Encadrant(s) : V. Loux, S. Schbath - Equipe(s) : Migale
CHANUT Max-Henri : Développement d'une application shiny pour comparer l'empreinte environnemental de l'usage du verre et du plastique dans un laboratoire - L2 - Université canadienne - ( - )
Encadrant(s) : S. Schbath, C. Midoux, M. de Paepe - Equipe(s) : Migale
REVEILLAUD Julie : The Wolbachia mobilome in Culex mosquitoes - Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative (DUBii) - Université de Paris & IFB - ( - )
Encadrant(s) : H. Chiapello & V. Loux - Equipe(s) : Migale
AUGER Sandrine : Analyse multiomique de l’impact des peptides d’extraits de levure sur la bactérie Streptococcus thermophilus - Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative (DUBii) - Université de Paris & IFB - ( - )
Encadrant(s) : H. Chiapello & V. Loux - Equipe(s) : Migale
Vincent Claire : Mise au point d'une méthode d'analyse de données métagénomiques eucaryotes et application sur plusieurs écosystèmes alimentaires - M2 - Muséum d'Histoire Naturelle - ( - )
Encadrant(s) : Olivier Rué - Equipe(s) : Migale
BENOIST Joffrey : Développement d'un pipeline pour la détection de pseudogènes - Master 1 - Master Bio-informatique/Bio-statistiques et Magistère de biologie, Université Paris Sud Orsay - ( - )
Encadrant(s) : C. Coluzzi, V. Loux et H. Chiapello - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
AH-LONE Sam : Mise en place d'une application permettant l'alignement de génomes complets bactériens - Master Biosciences, Bio-Informatique 2ème année en apprentissage - Université de ROUEN Normandie - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Dérozier, Hélène Chiapello - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
BRANGER Maxime : Génomique évolutive des souches de Mycobacterium bovis en France depuis 1978. Séquençage et assemblage d'un génome de référence français de Mycobacterium bovis - Licence professionelle génomique - CNAM - ENCPB - ( - )
Encadrant(s) : Valentin Loux - Equipe(s) : Migale
DE MURAT Daniel : Etude comparative d’outils d’analyses de données de séquençage métagénomiques - Master 1 de bioinformatique - Université Paris 7 - ( - )
Encadrant(s) : Anne-Laure Abraham, Olivier Rué - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
AH-LONE Sam : Evaluation des outils d'alignement de génomes complets bactériens publiés et disponibles (avantages/limites) - Master Biosciences, Bio-Informatique 1ère année - Université de ROUEN Normandie - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Dérozier - Equipe(s) : Migale
EL-KHIARI Slim : Génomique comparée et reconstruction de voies métaboliques pour le développement d’un milieu de culture sélectif de Enterococcus cecorum - M2 Analyse des génomes - Université UPMC/Institut Pasteur - ( - )
Encadrant(s) : Valentin Loux (MaIAGE), Pascale Serror (Micalis) - Equipe(s) : Migale
PEILLET Stéphane : Intégration d'outils et de workflows dans Galaxy : contrôle qualité et amélioration de la reproductibilité - Master 2 CI - ESME SUDRIA - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux, Franck Samson - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
GUARRACINO Yann : Implémentation de workflows ngs dans un environnement galaxy - Master 1 : Biologie - Informatique - Université Paris Diderot - Paris7 - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux - Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics
BEN HASSINE Najla : Etude de l'influence du microbiote intestinal sur l'axe hypothalamo-hypophyso-surrénalien dans le cas du stress aigu chez le rat par des approches : protéomique, transcriptomique et bioinformatique - Master 2 Génomique et Post Génomique Spécialité Génie Biologique et Informatique - Université d'Evry Val d'Essonne - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier, Franck Samson - Equipe(s) : Migale
REBOUL Guillaume : Implémentation et mise en place d'un Genome Browser pour la truite arc-en-ciel - DUT Génie biologique, option Bio-informatique - IUT Aurillac - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier - Equipe(s) : Migale