Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 


Dynenvie

JOUANAUD Yanis

The gut microbiota comprises a vast array of hundreds of microorganisms crucial for functions such as digestion, metabolism, immune response, and neurological processes. Disruptions in this complex system have been linked to autoimmune and inflammatory conditions. Moreover, the gut microbiota acts as a defense mechanism against the invasion of pathogens introduced through ingested food. Recent advances in sequencing technologies allow for the precise identification of bacterial species and their quantities in fecal samples.

GAVILANES Kathya Viviana

Ce stage fait suite au travail récent de Marion Naveau dans lequel la sélection de covariables dans les modèles non linéaires à effets mixtes est réalisée en couplant l’algorithme SAEM et un prior bayésien de type spike and slab. Cette procédure est itérative et nécessite plusieurs évaluations de la fonction de régression non linéaire à chacune de ses itérations. Lorsque la fonction de régression est coûteuse à évaluer, le temps d’exécution de la méthodologie complète devient prohibitif.