Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 


liste thèses soutenues StatInfOmics


EPAIN Victor
: Développement de méthodes efficaces, précises et conviviales pour corriger, assembler et aligner des lectures issues des technologies de séquençage 3e génération. - ED601 MathSTIC - Soutenue le : - Directeur.trice : R. Andonov INRIA - J-F Gibrat INRAE - Encadrant(s) : D Lavenier (INRIA) - Equipes : StatInfOmics


BEREUX Stéphane
: Modéliser et prédire les modifications microbiennes associées à l’émergence de maladies - ED 574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : Mahendra Mariadassou - Encadrant(s) : Magali Berland, Sébastien Fromentin - Equipes : StatInfOmics


DE SOUSA VIOLANTE Madeleine
: Genomics of Salmonella sevovars Mbandaka, Typhimurium and its monophasic variant in milk and pork food sectors - ABIES - Soutenue le : - Directeur.trice : Michel-Yves Mistou - Encadrant(s) : Nicolas Radomski, Ludovic Mallet, Valérie Michel - Equipes : StatInfOmics


TANNEUR Irène
: Modélisation et mise en oeuvre d'un système d'évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilisée - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : P. Nicolas - Encadrant(s) : M. Jules (Micalis) - Equipes : StatInfOmics


GOUTORBE Benoit
: Développement et application d'une méthode précise et efficace pour l'analyse du microbiote humain à visée clinique - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : Sophie Schbath - Encadrant(s) : P. Halfo (Alphabio), G. Bidaut (INSERM Marseille) - Equipes : StatInfOmics


BICHAT Antoine
: Prise en compte de l’organisation hiérarchique des espèces pour la découverte de signatures métagénomiques multi-échelles - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Ambroise (Univ. Very, LaMME) - Encadrant(s) : M. Mariadassou (MaIAGE), J. Plassais (Enterome) - Equipes : StatInfOmics


LAO Julie
: Création d'un outil de recherche et d'analyse des éléments mobiles conjugatifs dans les génomes de Firmicutes - ED607 SIRENA - Soutenue le : - Directeur.trice : N. Leblond-Bourget (INRA, DynAMic), H. Chiapello (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics


BASSIGNANI Ariane
: Intégration et analyse de données de métaprotéomique quantitative en shotgun pour explorer les fonctionnalités du microbiote intestinal humain dans le cadre des maladies cardiométaboliques - ED394 Physiologie Physiopathologie et Thérapeutique - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Juste (INRA-Micalis) - Encadrant(s) : S. Plancade (MaIAGE), M. Berland (INRA-MGP) - Equipes : StatInfOmics


VILA NOVA Meryl
: Détection et identification des mutations et des voies métaboliques associées à l’adaptation à l’hôte dans le pangénome de Salmonella - ED581 ABIES - Soutenue le : - Directeur.trice : M.-Y. Mistou (ANSES) - Encadrant(s) : N. Radomski (Anses), M. Mariadassou (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics


SULTAN Ibrahim
: Statistical modeling of bacterial promoter sequences for regulatory motif discovery - ED577 SDSV - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Schbath (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Encadrant(s) : P. Nicolas (MaIAGE, INRA Jouy en Josas) - Equipes : StatInfOmics


BASTIDE Paul
: Processus stochastiques avec sauts sur arbres : application à l'évolution adaptative sur des phylogénies - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Robin (INRA, MIA-PAris) - Encadrant(s) : M. Mariadassou (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics


GIGUELAY Jade
: Estimation d'une densité discrète sous contrainte de k-monotonie. Application à l'estimation du nombre d'espèces dans une population - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : C. Giraud (LMO) - Encadrant(s) : S. Huet (MaIAGE) - Equipes : StatInfOmics


AUBERT Julie
: Analyse statistique de données biologiques à haut débit - ED574 EDMH - Soutenue le : - Directeur.trice : S. Schbath (MaIAGE) - Encadrant(s) : S. Robin (INRA, MIA-Paris) - Equipes : StatInfOmics