Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Projets et contrats Dynenvie
ModLSys - ANR- ANR PRC
Défi et/ou Axe : CE45 - Interfaces : mathématiques, sciences du numérique - biologie, santé (2023-2028)
Titre : A multi-scale modeling framework for living systems (2nd submission)
Participants : A. Goelzer, O. Inizan, E. Kuhn - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie
Partenaires : IJPB (INRAE, AgroParisTech), MICS (CentraleSupelec), IPSIM (INRAE, CNRS)Coordinateur : V. Fromion (MaIAGE)
Homo.symbiosus - H2020- EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)- (2019-2024)
Titre : Assessing, preserving and restoring man-microbes symbiosis.
Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : Micalis, MGP, CRESS, APHPCoordinateur : Joël Doré
ESCAPE - ANR- ANR aapg 2021
Défi et/ou Axe : CE21 - Alimentation et systèmes alimentaires (2022-2025)
Titre : Caractérisation de l'interaction ayant lieu entre le pathogène Campylobacter et le microbiote de la viande de volaille en vue d'améliorer la sécurité sanitaire du produit
Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : ONIRISCoordinateur : N. Haddad (ONIRIS, SECALIM, Nantes)
CO-BREEDING - ANR- PEPR AGROECOLOGIE ET NUMERIQUE (2023-2027)
Titre : Co_conception de schémas de sélection animale et végétale pour améliorer la multi-performance (économique, sociale et environnementale) et développer des productions agroécologiques
Participants : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : INRAE GQE Le Moulon, GABI, AGIR, GENPHYSE, ...Coordinateur : Alain Charcosset, Christine Dillmann, Florence Phocas
COCODIV - INRAE Métaprogramme- MP Sumcrop- (2022-2024)
Titre : CO-occurrence des maladies en systèmes Céréaliers : déterminants, rÔle et
gestion de la DIVersité cultivée et sauvage de la parcelle au paysage
Participants : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : Resilience (Chizey), BIOGER (Grignon), BioSP (Avignon), ISA (Sophia-Antipolis), MIAT( Toulouse)Coordinateur : Anne-Lise Boixel (BIOGER, Grignon)
SESRisks - INRAE Métaprogramme- MP XRISQUES- (2023-2026)
Titre : Comprendre les sources et les impacts des risques multiples associés à la
transformation agroécologique sur le fonctionnement d’un socio-écosystème agricole
Participants : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : bioger, MIAT, CEBCCoordinateur : Gaba Sabrina
MOSSAIC - ANR- ANR blanche
Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des microorganismes (2022-2024)
Titre : Deciphering the Mechanisms Of the heterogeneous Shedding of Salmonella in Chicken, and modelling the interactions between the host, the pathogen and the gut microbiota
Participants : B. Laroche (WP leader), F. Deslandes - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : ISP, TOXALIM, PFIE, PRCCoordinateur : P. Velge (ISP, INRAE Tours)
DYNAMO - INRAE- AAP SPE- (2022-2025)
Titre : Déterminants des dynamiques épidémiques des rouilles brune et jaune du blé à l’échelle du paysage de la Zone Atelier Plaine & Val de Sèvre
Participants : K. Adamczyk, F. Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : Resilience (Chizey), BIOGER (Grignon), BioSP (Avignon), ISA (Sophia-Antipolis), Plant Pathology (Avignon)Coordinateur : Tiphaine Vidal
PheroSensor - ANR- Investissement d'Avenir "Cultiver et protéger autrement" (2021-2025)
Titre : Early detection of pest insects using pheromone receptor-based olfactory sensors
Participants : K. Adamczyk, F. Deslandes, S. Labarthe (resp. WP), B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : INRA - UMR 1392 iEES ; INRA - UR 1404 MaiAGE ; CEA - LIST ; CNRS - LORIA ; ESIEE - ESYCOM ; EGCE – IRDCoordinateur : P. Lucas (INRAE - UMR 1392, iEES Paris Sorbonne Université)
FermenTwin - INRAE Métaprogramme- AMI DIGITBIO- (2024)
Titre : FermenTwin
Participants : G. GAUTREAU, C. GUERIN, B. LAROCHE, L. SALA - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : MICALIS, Biogeco, SyBERCoordinateur : Guillaume GAUTREAU
IMAGO - INRAE Métaprogramme- DIGIT-BIO- (2022-2024)
Titre : Imagerie et modélisation des dynamiques spatio-temporelles de la signalisation et du trafic des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG).
Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : PRC (Tours), MUSCA (INRIA Saclay), SERPICO (INRIA Rennes)Coordinateur : Frédéric JEAN-ALPHONSE (CNRS, Tours)
INCUBIO’BREEDING - INRAE Métaprogramme- METABIO AMI 2023 Consortia et projets exploratoires- (2023-2024)
Titre : Incubation for Organic, Open, Transdisciplinary and Participatory Plant Breeding Projects
Participants : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : Tous les départements INRAECoordinateur : Dominique DESCLAUX INRAE
GenA(t)ACC - INRAE Métaprogramme- CLIMAE AMI 2023 Consortia et projets exploratoires- (2023-2024)
Titre : La Génétique, levier pour l’Atténuation et l’Adaptation au Changement Climatique
Participants : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : tous les départements INRAECoordinateur : Hélène GILBERT, Jean Philippe BARRE (INRAE)
Stat4Plant - ANR- PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé (2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPBCoordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
MIDIIVEC - INRAE Métaprogramme- DIGIT-BIO (2022-2024)
Titre : Modélisation et inférence de la dynamique d’infection intravecteur à partir de données expérimentales
Participants : Françosi Deslandes, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : UMR1300 Oniris-INRAE BIOEPAR, Nantes; UMR754 INRAE-Univ Lyon- EPHE IVPCCoordinateur : Gaël Beaunée
MOTHERS - INRAE Métaprogramme- AMI HOLOFLUX- (2023-2024)
Titre : MONITORING THE GUT MICROBIOTA, RESISTANCE AGAINST SALMONELLA, ANIMAL PERFORMANCE AND IMMUNE RESPONSE THROUGH AN ADULT, PATHOGEN-FREE MICROBIOTA
Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : ISP, PFIE, Univ. Munich, univ AachenCoordinateur : F. Kempf (ISP INRAE Tours)
PolliHealth - Plan Ecophyto II+ – Appel à projets national 2021 – 2022-
Défi et/ou Axe : Axe 2 – Améliorer les connaissances et les outils pour demain et encourager la recherche et l’innovation. Thème « impact sur les pollinisateurs » (2022-2025)
Titre : PolliHealth – Renforcer les connaissances sur les risques associés aux pesticides sur les pollinisateurs dans différents contextes paysagers pour concevoir des paysages de santé
Participants : Florence Carpentier - Equipe(s) : DynenvieCoordinateur : Sabrina Gaba (Resilience, Chizey)
PROMETHEUS - ANR- France 2030 IHU (2023-2032)
Titre : PRecisiOn MedicinE for healTHcare associatEd and commUnity acquired Sepsis
Participants : B. Laroche, L. Sala, G. Andrée-Leroux, S. Marthey - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
Partenaires : APHA,CEA, INSERM, Univ Paris-Saclay (UVSQ, Pasteur, etc..)Coordinateur : Djalili Annane-Coordinateur INRAE (WP1) Pascale Serror
PARTHAGE - ANR- AAPG 2022 (2023-2026)
Titre : Predicting antibiotic resistance transmission within and between humans by combining mathematical modelling, genomics and epidemiology
Participants : B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : UMR1018 CESP (UVSQ, Inserm, Institut Pasteur), 2I Unit (INSERM/UVSQ), EERA Unit (Institut Pasteur), GRAM 2.0 EA265 (UniCaen-UniRouen)Coordinateur : L. Opatowski (Institut Pasteur/UVSQ)
papeete - Appel à projets Ecophyto - "Epidémiosurveillance étendue"- (2024-2026)
Titre : Promouvoir l’Agroécologie par la prédiction intégrative du risque sanitaire à partir
de données Participatives d’Epidémiosurveillance à l’Echelle du TErritoire
Participants : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
Partenaires : UR BIOGER (INRAE), USC CEBC (INRAE-CNRS), UR BIOSP (INRAE), UR MIAT (INRAE) Coordinateur : Florence Carpentier