La phase 1 du projet a permis d’établir un catalogue du métagénome caecal de poulet très riche. Nous proposons d’utiliser ce catalogue dans une deuxième phase, pour répondre à différentes questions biologiques d’intérêt adressées dans trois sous-projets différents menés en parallèle, grâce à l’exploitation d’échantillons de microbiote caecal déjà collectés au cours de projets indépendants menés par des chercheurs INRAE.