Le projet de thèse proposé s’inscrit dans une démarche interdisciplinaire et un contexte de sciences ouvertes et participatives. Il vise à concevoir et mettre en œuvre des approches bioinformatiques et numériques innovantes pour analyser, comparer, interpréter et diffuser des jeux de données de données (meta)génomiques d’écosystèmes alimentaires fermentaires.

Organiser et participer aux différents meetings rassemblant les responsables de collections microbiennes pour l'élaboration de la stratégie de recherche de  MIRRI , et  organiser  la contribution des collections microbiennes de  l’INRAE ( groupées au sein du CIRM) à MIRRI.