Network and group activities


ModStatSAP :
Modélisation et statistique en santé des animaux et des plantes (depuis 2010)
Member(s) of the unit concerned by the animation: E. Vergu

Website: http://ciam.inra.fr/reseau-modstatsap/

L’objectif principal du rĂ©seau est de fĂ©dĂ©rer les modĂ©lisateurs et statisticiens des dĂ©partements SPE, SA et MIA, d’autres dĂ©partements de l'INRA (notamment EA et EFPA) et d'autres structures de recherche, afin d’accroĂ®tre la portĂ©e des recherches en modĂ©lisation, mathĂ©matiques et statistique appliquĂ©es Ă  l’étude des systèmes plantes / bioagresseurs et hĂ´tes / pathogènes. Le rĂ©seau doit permettre d'accĂ©lĂ©rer la percolation des idĂ©es, des approches, des mĂ©thodes et des rĂ©sultats dans le cercle des modĂ©lisateurs et statisticiens, dans un cercle Ă©largi au sein duquel figurent les Ă©pidĂ©miologistes, les dynamiciens et les gĂ©nĂ©ticiens des populations, entre santĂ© animale et santĂ© des plantes.


PEPI IBIS :
Réseau de Partage d'Expériences et de Pratiques Informatiques "Ingénierie Bio Informatique et Statistique pour les données haut-débit" (IBIS) (depuis 2011)
Member(s) of the unit concerned by the animation: Anne-Laure Abraham, Sandra DĂ©rozier, V. Loux

Website: http://pepi-ibis.inra.fr/

Le PEPI bioinformatique et statistique pour les données haut-débit s’adresse aux personnes en charge du traitement et des analyses informatiques et statistiques des très gros volumes de données produits par les technologies à haut-débit (séquençage, métagénomique, trancriptomique, protéomique, métabolomique, ...). Il s'agit d'échanger sur des outils, des méthodes et plus généralement des pratiques issus des disciplines bioinformatiques et statistiques, pour mieux faire face aux nouveaux défis posés par ces nouvelles approches.


Mexico :
Réseau sur les Méthodes pour l'EXploration Informatique des modèles COmplexes
Member(s) of the unit concerned by the animation: Hervé Monod, Jean-Pierre Gauchi, Juhui Wang

Website: http://www.reseau-mexico.fr

Ce réseau regroupe des scientifiques de divers organismes tels que l'INRA, le CEMAGREF (LISC), l'IFREMER (EMH), l'Université de Toulouse (IRIT), l'université du Littoral (LIL), etc. Ses objectifs sont d'identifier, développer et diffuser des méthodes d'analyse de sensibilité, d'analyse d'incertitude, ou plus généralement d'exploration numérique des modèles utilisés dans les domaines agronomique, halieutique, écologique et environnemental.


Bioinfo-Jouy :
RĂ©seau des bioinformaticiens du centre de Jouy-en-Josas (depuis 2012) Jouy-en-Josas
Member(s) of the unit concerned by the animation: Sandra Dérozier, Cyprien Guérin

Ces réunions permettent un regroupement des bioinformaticiens du centre de Jouy-en-Josas afin de discuter autour des thématiques de chacun. Ces réunions permettent de partager autour de ses activités, de faire de la veille technologique et scientifique. Des réunions ouvertes sur le centre à destination de l'ensemble du personnel ont organisées chaque année.


SFBI :
Société Française de BioInformatique (depuis 2010)
Member(s) of the unit concerned by the animation: H. Chiapello, S. Schbath

Website: http://www.sfbi.fr

La SFBI a été créée en 2005 pour promouvoir la recherche pluri- et inter-disciplinaire en Bioinformatique, à l'interface entre la Biologie moléculaire, l'Informatique, les Mathématiques et la Physique. La SFBI a vocation à rassembler les chercheurs, enseignants et ingénieurs francophones qui travaillent sur des questions relevant de la bioinformatique, pour des rencontres et des échanges scientifiques. Elle participe et assure la pérénité de l'organisation de JOBIM, conférence nationale annuelle de bioinformatique qui réunit de 300 à 500 personnes.


SaMMBA :
Statistical and Mathematical Modeling in Biological Applications (depuis 2011) Institut Pasteur, Paris
Member(s) of the unit concerned by the animation: Elisabeta Vergu

Website: https://research.pasteur.fr/fr/project/sammba-seminars/

DĂ©marrĂ©e en octobre 2011, la sĂ©rie de sĂ©minaires mensuels «Statistique et modĂ©lisation mathĂ©matique pour les applications en biologie Â» (SaMMBA), propose des confĂ©rences et des discussions avec des scientifiques de premiers plan de ces disciplines. L'organisation est assurĂ©e par un comitĂ© composĂ© de neufs chercheurs modĂ©lisateurs d’Ile de France de six laboratoires rattachĂ©s Ă  diffĂ©rents organismes (Inserm/UPMC, Institut Pasteur/UVSQ, CNAM, UPS, INRA), visant Ă  regrouper cette communautĂ©. La manifestation a lieu Ă  l’Institut Pasteur Ă  Paris, pour permettre un accès facile de tous les participants.


Mascot Num :
Groupement de recherche sur les méthodes d'exploration de codes numériques
Member(s) of the unit concerned by the animation: Jean-Pierre Gauchi, Hervé Monod

Groupement de recherche (GDR) regroupant des chercheurs universitaires, des organismes de recherche, et des industriels. L'objectif principal est de coordonner les efforts de recherche sur les méthodes de planification, modélisation et analyse d'expérimentations numériques.


Applibugs :
Club de rencontre d'utilisateurs concernés par les applications bayésiennes utilisant le Gibbs sampling
Member(s) of the unit concerned by the animation: Olivier David

Website: http://genome.jouy.inra.fr/applibugs/applibugs.welcome.html

Structure d'échanges et d'informations sur les connaissances, les techniques et les applications de ces méthodes dans tous les secteurs de la statistique. Ce club vise tout particulièrement le monde de la statistique appliquée et celui des outils logiciels développés autour de la plateforme winbugs (mais sans exclusive). Un bureau de sept personnes organise environ deux réunions publiques d'une journée par an, en région parisienne.