Current projects

 


ABIM
- ANR- Jeunes chercheurs et jeunes chercheuses (2017-2021)
Title : Approximations and Behavior of stochastic Individual-based Models
Coordinator : V. Bansaye (CMAP, Ecole Polytechnique)
Partners : Ecole Polytechnique (CMAP, CPHT); Univ. Lille; IRMES
MaIAGE Participants : E. Vergu - Team(s) : Dynenvie

API-SMAL
- Labex- BASC- (2017-2020)
Title : Agroecology and policy instruments for sustainable multifunctional agricultural landscapes
Coordinator : V.Martinet (INRA, Economie Publique)MaIAGE Participants : S.Labarthe, K.Admaczyk, H. Monod - Team(s) : Dynenvie

Articulate
- France-Berkeley Fund- (2019-2020)
Title : Experimental and mathematical models articulation: a bifocal lens to study the ecology of the colonic microbiota
Coordinator : A.Bäumler (UC Davis) and S.Labarthe (MaIAGE)
Partners : UC Davis (Davis, USA)
MaIAGE Participants : B.Laroche, L.Darrigade, S. Labarthe - Team(s) : Dynenvie

BioBrickEvolver
- ANR- AAPG2018 - PRC
Challenge and/or Axis : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système
(01/2019-12/2022)
Title : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis.
Coordinator : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)
Partners : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Eq. C. Berthomieu), TWB (O. Galy)))
MaIAGE Participants : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Team(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics

CADENCE
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : Défi 5 "Sécurité alimentaire et défi démographique"
(2017-2021)
Title : Propagation de processus épidémiques sur des réseaux dynamiques de mouvements d’animaux avec application aux bovins en France / Spread of epidemic processes on dynamical networks of animal movements with application to cattle in France
Coordinator : E. Vergu (MaIAGE)
Partners : INRA-Oniris BioEpAR Nantes; ANSES LSAn Maisons Alforts; École Polytechnique CMAP Palaiseau
MaIAGE Participants : G. Beaunée, C. Bidot, P. Hoscheit, E. Kuhn, S. Labarthe, C. Larédo, B. Laroche, M. Olteanu - Team(s) : Dynenvie

CoNoCo
- ANR- ANR blanche
Challenge and/or Axis : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN
(2019-2023)
Title : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Coordinator : E. Bidnenko (INRA Micalis)
Partners : Micalis (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
MaIAGE Participants : C. Guérin, P. Nicolas - Team(s) : StatInfOmics

D2KAB
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : Défi : B.7 Axe : axe 4
(06/2019-05/2023)
Title : Data to Knowledge in Agriculture and Biodiversity
Coordinator : C. Jonquet (LIRMM, Montpellier)
Partners : UM-LIRMM, CNRS-I3S, INRA-DIST, INRA-URGI, INRA-IATE, INRA-URFM ,IRSTEA-TSCF, CNRS-CEFE, ACTA, STANFORD-BMIR
MaIAGE Participants : R. Bossy, C. Nédellec, L. Deléger - Team(s) : Bibliome

ECONET
- ANR- ANR blanche
Challenge and/or Axis : Sober management of resources and adaptation to climatic changes: towards an under- standing of global changes Axe : Fundamental knowledge on natural environments and biodiversity
(2018-2022)
Title : Advanced statistical modelling of ecological networks
Coordinator : C. Matias (CNRS - UPMC, LPSM)
Partners : LPSM (UPMC), MIA-Paris (INRA), LBBE (Univ. Lyon), ISEM (Univ. Montpellier), IEES (MNHN), EEP (Univ. Lille)
MaIAGE Participants : M. Mariadassou - Team(s) : StatInfOmics

ESPACE
- INRAE Métaprogramme- SMaCH- (2018-2022)
Title : Estimer les effets des variables paysagères sur les bioagresseurs et auxiliaires des cultures
Coordinator : Florence Carpentier (Bioger, SPE), Olivier Martin (BioSP,MIA)
Partners : BioSP (MIA, Avignon), Bioger (Grignon), PSH (SPE, Avignon), UMR Agroécologie (Dijon), IGEPP (Rennes)
MaIAGE Participants : Katarzyna Adamczyk - Team(s) : Dynenvie

FlavoPatho
- ANR- Jeunes chercheurs, jeunes chercheuses
Challenge and/or Axis : Défi : 5 - "Sécurité alimentaire et défi démographique"
(2018-2022-2022)
Title : Investigation of salmonid fish infection by Flavobacterium psychrophilum: from genes to the ecology of the disease.
Coordinator : T. Rochat (INRA VIM)
Partners : INRA VIM (Jouy-en-Josas)
MaIAGE Participants : C. Guérin, P. Nicolas - - Team(s) : StatInfOmics

IRONMANOMICS
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2018-2020)
Title : Exploring omics data for evaluating microbial interactions for iron
Coordinator : MC Champomier-Verges (Micalis, Jouy)
Partners : MICALIS, MGP, MaIAGE, UMRF (Aurillac), ETH Zurich
MaIAGE Participants : S Labarthe, B Laroche, V Loux - Team(s) : Dynenvie / Migale

KINETICS
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2018-2020)
Title : Network and modelling analyses to describe the dynamics of the Ixodes ricinus microbiome and its influence in pathogen dynamics
Coordinator : T Pollet (INRA UMR BIPAR, Maisons Alfort)
Partners : BIPAR (Maisons Alfort), EPIA (Theix), MIA Paris
MaIAGE Participants : B Laroche, S Labarthe - Team(s) : Dynenvie

Meta PDO cheeses
- France Génomique- (2017-2021)
Title : Nature et rôle des moteurs biotiques dans la construction des communautés microbiennes des fromages traditionnels
Coordinator : F. Irlinger (INRA, Grignon) ; C. Delbès (INRA, Aurillac)
Partners : INRA GMPA, INRA URF, INRA MICALIS, Genoscope, RMT Fromages de Terroir, CNAOL , CNIEL
MaIAGE Participants : A.-L. Abraham, V. Loux, M. Mariadassou, O. Rué - Team(s) : Migale / StatInfOmics

Mfd Profiling
- TWB 2019- (2019-2021)
Title : Mfd profiling
Coordinator : Gwenaëlle andré-Leroux (INRA, MaIAGE) et Nalini Rama Rao (INRA, Micalis)
Partners : Micalis
MaIAGE Participants : Gwenaëlle andré-Leroux - Team(s) : StatInfOmics

MoMIR-PPC
- H2020- EJP MedVet - (2018-2020)
Title : Monitoring the gut microbiota and immune response to predict, prevent and control zoonoses in humans and livestock in order to minimize the use of antimicrobials
Coordinator : P. Velge (ISP, Tours)
Partners : 41 partenaires européens dont ISP (INRA Tours), ANSES
MaIAGE Participants : C. Bidot, S. Labarthe, B. Laroche, E. Vergu - Team(s) : Dynenvie

REDLOSSES
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : Sécurité alimentaire et défi démographique
(2016-2020)
Title : Réduction des pertes alimentaires par la prédiction des altérations microbiologiques
Coordinator : Monique Zagorec (INRA-SECALIM)
Partners : INRA-SECALIM, IFIP, INRA-MICALIS, Lubem, AERIAL, ITAVI, Cooperl Innovation, LDC, ULg-DDA
MaIAGE Participants : V. Loux, O. Rué - Team(s) : Migale

REMOVE
- INRAE- Département MICA- (2018-2020)
Title : Improving the colonization REsistance of the gut MicrobiOta against Vancomycin-resistant Enterococci
Coordinator : L Rigottier (Micalis, Jouy)
Partners : MICALIS (Jouy); IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).
MaIAGE Participants : B Laroche, S Labarthe - Team(s) : Dynenvie