Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
List of StatInfOmics internships
LEGRAS Mia : Identification of strain fluxes in a dairy food chain - Master 2 - Université Paris-cité - ( - )
Supervisor(s) : Anne-Laure Abraham, Guillaume Kon Kam King - Team(s) : StatInfOmics
TANNEUR Irène : Contrôle du taux de mutation spontanée dans la bactérie Bacillus subtilis - 5e année - INSA Lyon - ( - )
Supervisor(s) : Pierre Nicolas (MaIAGE), Matthieu Jules (MICALIS) - Team(s) : StatInfOmics
BENOIST Joffrey : Développement d'un pipeline pour la détection de pseudogènes - Master 1 - Master Bio-informatique/Bio-statistiques et Magistère de biologie, Université Paris Sud Orsay - ( - )
Supervisor(s) : C. Coluzzi, V. Loux et H. Chiapello - Team(s) : Migale, Team(s) : StatInfOmics
EL DJOUDI Yassin : Etude des polymorphismes intraspécifiques des espèces majoritaires du microbiote intestinal à partir de génomes séquencés - L3 sciences de la vie parcours bio-informatique - Université de Poitiers - ( - )
Supervisor(s) : Anne-Laure Abraham, Hélène Chiapello, Pierre Nicolas - Team(s) : StatInfOmics
NGUYEN-PHAM Khanh-Chi : La caractérisation moléculaire de l’interaction Mfd -Mutation frequency decline et facteur de virulence- avec sa partenaire UvrA, deux protéines bactériennes. - M1 bioinformatique - Université Paris-Diderot - ( - )
Supervisor(s) : Gwenaelle Andre-Leroux - Team(s) : StatInfOmics
GHOUL Amina : Etude de la distribution de longueurs des lectures produites par les technologies de séquençage de 3ème génération - Master 1 Mathématiques et interactions - Université d'Evry Val d'Essonne - ( - )
Supervisor(s) : Jean-François Gibrat - Team(s) : StatInfOmics
HARDY Clément : Exploration des Méthodes d'analyse de données compositionnelles pour l'étude du lien entre microbiote instestinal et santé - Master 1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Sud - ( - )
Supervisor(s) : Mahendra Mariadassou, Magali Berland - Team(s) : StatInfOmics
DE MURAT Daniel : Etude comparative d’outils d’analyses de données de séquençage métagénomiques - Master 1 de bioinformatique - Université Paris 7 - ( - )
Supervisor(s) : Anne-Laure Abraham, Olivier Rué - Team(s) : Migale, Team(s) : StatInfOmics
SAMSON Samantha : Identification des homologues structuraux de PknB chez S. thermophilus. Validation in vitro. - Master 1 - Université des Sciences et Techniques de Paris Diderot - ( - )
Supervisor(s) : Véronqiue Monnet (MICALIS) et Gwenaëlle André-Leroux - Team(s) : StatInfOmics
BANKOLE Alexia : Programmation d’un outil de construction de matrices d’occurrences de gènes dans des populations de génomes microbiens - L3 en double licence Sciences de la vie et informatique - Université Paris Saclay - Université Evry - ( - )
Supervisor(s) : Hélène Chiapello, Olivier Inizan - Team(s) : StatInfOmics
ALBERT Solène : Caractérisation in silico de la structure/fonction/pathogénie de Mfd -Mutation frequency decline- chez diverses souches de B. cereus. Validation in vitro. - Master 2 - Université des Sciences et Techniques de Paris Diderot - ( - )
Supervisor(s) : Nalini RamaRao (MICALIS) ; Gwenaëlle André-Leroux - Team(s) : StatInfOmics
DENOEUD Alexis : Caractérisation structurale in silico de FstA de Streptococcus thermophilus - Licence L3 - Faculté des Sciences d'Orsay - Université Paris Sud - ( - )
Supervisor(s) : Gwenaëlle André-LerouxGwenaëlle André-Leroux - Team(s) : StatInfOmics
DAOUDA OUMOU SALAMA Abdourahim : Modélisation et estimation du phyllochrone du maïs. Etude des effets du génotype et de l'environnement - Master 1 - Institut de Statistique de l'Université Pierre et Marie Curie (ISUP) - ( - )
Supervisor(s) : Sylvie Huet, Sandra Plancade - Team(s) : StatInfOmics
XIE Hengjia : Analyse statistique des changements métaboliques suite à une perturbation chez la chèvre - M2 - Université Paris-Descartes - ( - )
Supervisor(s) : Masoomeh Taghipoor, Sandra Plancade, Céline Domange - Team(s) : StatInfOmics
FROUIN Arthur : Modèle de recombinaison dépendente de la distance phylogénétique - M2 Ingéniérie Statistique et Génome - UPSay - ( - )
Supervisor(s) : Pierre NICOLAS - Team(s) : StatInfOmics
CHAPUIS Emile : Etude d'un jeu de données méta-protéomiques - M1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Sud - ( - )
Supervisor(s) : Sandra Plancade, Sylvie Huet - Team(s) : StatInfOmics
PATERNINA Janio : Caractérisation in silico du récepteur olfactif PSGR - M1 BSSM - Génie Physiologique, Biotechnologique Informatique - Université de Poitiers - ( - )
Supervisor(s) : Gwenaëlle André-Leroux - Team(s) : StatInfOmics
SHI Xiaohan : Modélisation et estimation de l'abondance d'hippocampes sur le bassin d'Arcachon et l'étang de Thau en fonction de l'habitat - Master 2 Mathématiques appliquées - Ecole Polytechnique - ( - )
Supervisor(s) : Sylvie Huet - Team(s) : StatInfOmics
PEILLET Stéphane : Intégration d'outils et de workflows dans Galaxy : contrôle qualité et amélioration de la reproductibilité - Master 2 CI - ESME SUDRIA - ( - )
Supervisor(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux, Franck Samson - Team(s) : Migale, Team(s) : StatInfOmics
PRIVAT Martin : Logiques cis-régulatrices dans le développement du cerveau moyen - Licence 3 - ENS - Lyon - ( - )
Supervisor(s) : Pierre Nicolas, Sophie Schbath - Team(s) : StatInfOmics
GUARRACINO Yann : Implémentation de workflows ngs dans un environnement galaxy - Master 1 : Biologie - Informatique - Université Paris Diderot - Paris7 - ( - )
Supervisor(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux - Team(s) : Migale, Team(s) : StatInfOmics
PAIN Adrien : Typage Bactérien basé sur le pan-génome - Master 2 - Université Paris Diderot - ( - )
Supervisor(s) : Mahendra Mariadassou, Philippe Bessières - Team(s) : StatInfOmics
BLIN Camille : Étude de la diversité génétique de souches de Lactobacillus delbrueckii et Propionibacterium Freudenreichii et lien avec leurs propriétés probiotiques - Master Biosciences - ENS Lyon - ( - )
Supervisor(s) : Mahendra Mariadassou, Philippe Bessières - Team(s) : StatInfOmics