La détection précise des variants de gènes de résistance aux antibiotiques (ARG) est d’importance cruciale pour mieux comprendre leur propagation. Le séquençage métagénomique permet d’analyser l’ensemble des ARG présents, mais les variants sont fragmentés et mélangés. Ce projet vise à améliorer l’inférence bayésienne des variants de gènes d’antibiorésistance en métagénomique multi-échantillons en travaillant directement sur les reads complets (données brutes de séquençage) plutôt que sur des tables de comptages (abondance des nucléotides à chaque position du gène).