En combinant notre expertise de piégeage in vitro de bactéries par les aptamères, de caractérisation in silico puis in vitro des
protéines bactériennes engagées dans ces interactions, nous visons la conception in silico et la validation in vitro d'aptamères affins
et spécifiques envers les protéines de surface bactérienne identifiées. Sur ces bases de connaissance et de haute fonctionnalisation
des aptamères, nous concevrons des ligands ARN ou ADN capables de fixer spécifiquement, et sans les détruire, des protéines
extracellulaires de bactéries du microbiote intestinal. À terme, après une étape d'apprentissage supervisé, cette stratégie sera élargie
aux autres organismes d'intérêt et renforcera la voie que nous traçons de culturomique ciblée, explorée et exploitée.