Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 

 

 

ATIA Safiya

Type
Stagiaire
Sujet
Genoscapist - Ajout de fonctionnalités de personnalisation des éléments graphiques via l'interface utilisateur
Date de début
Date de fin
Encadrant(s)
Sandra Dérozier, Cyprien Guérin
Equipe(s)
StatInfOmics
Contrat de recherche
ANR CoNoCo
Année de soutenance (pour les thèses ou les stages)
2022
Ecole/université (pour les thèses et les stages)
Université Paris Saclay
Niveau/diplôme (pour les stages)
Master 1
Description/résumé

L’unité MaIAGE développe l’application Genoscapist qui permet la visualisation de profils quantitatifs et de données d’annotation le long d’un génome de référence via une interface web. La représentation graphique est constituée d’éléments SVG (Scalable Vector Graphics) permettant ainsi de générer des images de haute définition. Le type de représentation des éléments graphiques (forme et couleur) est défini dans l’outil et la base de données relationnelle. Le ou la stagiaire aura pour mission de modifier l’interface web afin de permettre aux utilisateurs de personnaliser les éléments graphiques utilisés pour représenter les données (modification des couleurs et des formes simples mais également utilisation de formes composées permettant de représenter des annotations structurales complexes).