Ce projet a pour objectif l’étude des transmissions verticales et horizontales de gènes de résistance aux antibiotiques du microbiote intestinal, par le suivi de 12 familles sur trois générations successives de poulets de chair issus du même lot parental et élevés dans deux environnements expérimentaux différents (dits « reproduction » ou « testage ») calqués sur la structuration de la filière avicole.

Le microbiote intestinal est l’ensemble des micro-organismes hébergés dans le tractus digestif de l’hôte tout au long de la vie. L’étude de cet écosystème microbien et de son incidence sur la santé est devenue un domaine de recherche majeur. Cette vaste communauté microbienne, hébergée dans l’intestin, exerce de nombreuses fonctions biologiques et métaboliques et confère de nombreux avantages à l’hôte [1].