Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement
Mathématiques et Informatique Appliquées
Internship
GAVILANES Kathya Viviana
Ce stage fait suite au travail récent de Marion Naveau dans lequel la sélection de covariables dans les modèles non linéaires à effets mixtes est réalisée en couplant l’algorithme SAEM et un prior bayésien de type spike and slab. Cette procédure est itérative et nécessite plusieurs évaluations de la fonction de régression non linéaire à chacune de ses itérations. Lorsque la fonction de régression est coûteuse à évaluer, le temps d’exécution de la méthodologie complète devient prohibitif.
DULOR Myriam
L’objectif général est de qualifier par des approches automatiques la vraisemblance et l’originalité des informations publiées dans la littérature scientifique sur les insectes vecteurs de maladies de plantes. Pour cela il faudra définir des critères de nature bibliographiques, linguistiques et biologiques et en caractériser la prédictibilité.
SADAT Sofiane
Les activités et responsabilités de ce stage sont :
DECHAMPS Ambre
L'infection à salmonelle est la cause la plus courant d'intoxication alimentaire collective dans les pays développés. On trouve la salmonelle sous la forme de différentes souches bactériennes qui colonisent et infectent le tube digestif des animaux d’élevage ou des humains. Chez l’homme, ces pathogènes provoquent des troubles allant d’intoxications alimentaires à la fièvre typhoïde.
BONNERY Daniel
Antibiotic-resistance genes in various bacteria are the focus of intense attention given the global concern around the rise of multi-resistant pathogens. These genes come in several variants, and the precise identification of variants in samples is very useful to track antibiotic-resistance gene propagation. We identify the variants of antibiotic resistance genes and their relative abundances using shotgun metagenomic data collected on multiple samples.