 |
|
Contrats et projets en cours
INCUBIO’BREEDING - INRAE Métaprogramme - METABIO AMI 2023 Consortia et projets exploratoires- (2023-2024)
Titre : Incubation for Organic, Open, Transdisciplinary and Participatory Plant Breeding Projects
Coordinateur : Dominique DESCLAUX INRAE
Partenaires : Tous les départements INRAEParticipants MaIAGE : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
Agro-Serv - H2020 - HORIZON-INFRA-2021-SERV-01-02- (2022-2027)
Titre : Integrated SERVices supporting a sustainable AGROecological transition
Coordinateur : Michel Boer Anaee CNRS
Partenaires : 42 partenaires - Infrastructures de recherche: Anaee/Emphasis/Elixir/EMBRC/EURo Bioimaging/EU OpenScreen/MetroFood/SmartCow/IBISBA/LifeWatch/MIRRIParticipants MaIAGE : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
AMN - ANR - AAPG21-
Défi et/ou Axe : Axis 8.5 (CE45) (2022-2025)
Titre : Artifical Metabolic Networks
Coordinateur : Jean-Loup Faulon
Partenaires : Micalis, AgroParisTechParticipants MaIAGE : Wolfram Liebermeister - Equipe(s) : BioSys
BEYOND - ANR - Programme Prioritaire de Recherche Cultiver et protéger autrement- (2020-2024)
Titre : Building epidemiological surveillance and prophylaxis with observations both near and distant
Coordinateur : Cindy Morris, (Plant Pathology Research Unit 407 INRAE, Avignon)
Partenaires : INRAE BioSP, INRAE Ecodev, IRSTEA-Montpellier Tetis, IRSTEA-Clermont-Ferrand TSCF, CIRAD/SupAgro/INRAE: Biology and Genetics of Plant-Pathogen Interaction, INRAE-Bordeaux: Fruit Biology and Pathology, .......Participants MaIAGE : C. Nédellec, R. Bossy, L. Deléger, V. Loux, M. Ba - Equipe(s) : Bibliome / Migale
BioBrickEvolver - ANR - AAPG2018 - PRC
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système (01/2019-06/2024)
Titre : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis.
Coordinateur : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)
Partenaires : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Equipe C. Berthomieu), TWB (O. Galy)Participants MaIAGE : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics
CO-BREEDING - ANR - PEPR AGROECOLOGIE ET NUMERIQUE (2023-2027)
Titre : Co_conception de schémas de sélection animale et végétale pour améliorer la multi-performance (économique, sociale et environnementale) et développer des productions agroécologiques
Coordinateur : Alain Charcosset, Christine Dillmann, Florence Phocas
Partenaires : INRAE GQE Le Moulon, GABI, AGIR, GENPHYSE, ...Participants MaIAGE : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
COCODIV - INRAE Métaprogramme - MP Sumcrop- (2022-2024)
Titre : CO-occurrence des maladies en systèmes Céréaliers : déterminants, rÔle et
gestion de la DIVersité cultivée et sauvage de la parcelle au paysage
Coordinateur : Anne-Lise Boixel (BIOGER, Grignon)
Partenaires : Resilience (Chizey), BIOGER (Grignon), BioSP (Avignon), ISA (Sophia-Antipolis), MIAT( Toulouse)Participants MaIAGE : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
CoNoCo - ANR - ANR blanche
Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-étre Axe : CES – Génétique, génomique, ARN (2019-2024)
Titre : Controlling non-coding pervasive transcription to ensure fine-tuning of gene expression in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus.
Coordinateur : E. Bidnenko (INRA Micalis)
Partenaires : Micalis (Jouy), IBPC (Paris), IBMC (Strasbourg), CBM (Orléans).Participants MaIAGE : C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
DeepImpact - ANR - PPR-
Défi et/ou Axe : Cultiver et Produire Autrement (2020 - 2025)
Titre : Deciphering plant-microbiota interactions to enhance crop defenses to pests
Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)
Partenaires : INRA IGEPP (Rennes), INRA Agroécologie (Dijon), INRA BFP, INRA BIOGER, INRA ECOBIO, INRA GDEC, IRISA (Rennes), CNRS - LBBE LEM (Lyon), INRA LIPM (Toulouse)Participants MaIAGE : M.Mariadassou, S. Schbath - Equipe(s) : StatInfOmics
DeMuSi - ITMO Cancer - PCSI 2022-
Défi et/ou Axe : Appel à projets : Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques et perspectives thérapeutiques : Apports à l’oncologie de la physique, de la chimie et des sciences de l’ingénieur (2022-2025)
Titre : Deciphering the mutational signature of transcription and DNA repair processes combined with exogenous DNA damages (DeMuSi)
Coordinateur : J. Soutourina (CEA I2BC)
Partenaires : CEA I2BC (J. Soutourina), CEA Saclay (F. Mallogi), INSERM Gustave-Roussy (S. Nikolaev)Participants MaIAGE : P. Nicolas, G. Kon Kam King, C. Guérin - Equipe(s) : StatInfOmics
DOMINO - H2020 - HORIZON-CL6-2021-FARM2FORK-01- (2022-2027)
Titre : Harnessing the microbial potential of fermented foods for healthy and sustainable food systems
Coordinateur : S. Chaillou (INRAE, Jouy-en-Josas)
Partenaires : 21 partenaires, 10 paysParticipants MaIAGE : V. Loux, M. Mariadassou, H. Chiapello - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
DYNAMO - INRAE - AAP SPE- (2022-2025)
Titre : Déterminants des dynamiques épidémiques des rouilles brune et jaune du blé à l’échelle du paysage de la Zone Atelier Plaine & Val de Sèvre
Coordinateur : Tiphaine Vidal
Partenaires : Resilience (Chizey), BIOGER (Grignon), BioSP (Avignon), ISA (Sophia-Antipolis), Plant Pathology (Avignon)Participants MaIAGE : K. Adamczyk, F. Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
EggToMeat - INRAE Métaprogramme - HOLOFLUX (2021-2023)
Titre : Impact de l’environnement d’élevage sur les flux bactériens en lien avec la santé, la robustesse des animaux et la qualité des produits chez le poulet de chair
Coordinateur : M. Zagorec (SECALIM, Nantes)
Partenaires : MICALIS, GABI, BOA, PEAT, EASM, ITAVI, ISP, SECALIMParticipants MaIAGE : B. Laroche, M. Mariadassou, V. Loux, C. Hennequet-Antier - Equipe(s) : Dynenvie / Migale / StatInfOmics
ESCAPE - ANR - ANR aapg 2021
Défi et/ou Axe : CE21 - Alimentation et systèmes alimentaires (2022-2025)
Titre : Caractérisation de l'interaction ayant lieu entre le pathogène Campylobacter et le microbiote de la viande de volaille en vue d'améliorer la sécurité sanitaire du produit
Coordinateur : N. Haddad (ONIRIS, SECALIM, Nantes)
Partenaires : ONIRISParticipants MaIAGE : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
FAIROmics - H2020 - HORIZON-MSCA-2022-DN-01-01- (2023)
Titre : FAIRification of multiOmics data to link databases and create knowledge graphs for fermented foods
Coordinateur : Dominique Swennen (INRAE SayFood)
Partenaires : Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, NIZO food research BV, National and Kapodistrian University of Athens, University of Reading, Chr. Hansen A/S, Vrije Universiteit Amsterdam, Agencia ...Participants MaIAGE : R. Bossy, H. Chiapello, S. Dérozier, C.Nédellec - Equipe(s) : Bibliome / StatInfOmics
GenA(t)ACC - INRAE Métaprogramme - CLIMAE AMI 2023 Consortia et projets exploratoires- (2023-2024)
Titre : La Génétique, levier pour l’Atténuation et l’Adaptation au Changement Climatique
Coordinateur : Hélène GILBERT, Jean Philippe BARRE (INRAE)
Partenaires : tous les départements INRAEParticipants MaIAGE : Estelle Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie
HARMONI - Appel d'offres Ibisa (Infrastructure en BIologie, Santé et Agronomie) 2021 pour les centres de ressources biologiques- (2022-2024)
Titre : Harmonizing microbiota characterization procedures within the national infrastructure RARe
Coordinateur : Michel-Yves Mistou (INRAE, MaIAGE, Jouy)
Partenaires : Michèle Tixier (GABI, @bridge, Jouy), Mathieu Almeida et Christian Morabito (MGP, Jouy), Samuel Mondy (GenoSol), Emmanuelle Helloin (CIRM-BP, Tours), Florence Valence (CIRM-BIA, Rennes)Participants MaIAGE : MY Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
Holobionts - ANR - PEPR AgroEcologie Numérique- (2023-2028)
Titre : Animal holobionts: a new biological scale to explore genetic diversity and refine breeding strategies for agroecology
Coordinateur : S. Combes (GenPhyse, INRAE Toulouse), J. Estellé Fabrellas (GABI, INRAE Jouy-en-Josas)
Partenaires : GABI (Jouy-en-Josas), GenPhyse (Toulouse), IRISA (Rennes), MIAT (Toulouse), MetaGenoPolis (Jouy-en-Josas), UMRH (Clermont-Ferrand)Participants MaIAGE : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
HoloE2Plant - H2020 - ERC Starting Grant- (2022-2026)
Titre : Exploring the Holobiont concept through a Plant Evolutionary Experiment study
Coordinateur : Claudia Bartoli
Partenaires : IRISA (Rennes), Department of Systematic and Evolutionary biology (Univ. Zurich)Participants MaIAGE : M. Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics
HoloOligo - ANR - Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des microorganismes(2021-2024)
Défi et/ou Axe : CE20 (2022-2025)
Titre : Structure diversity, functionality and modulation of milk oligosaccharides in monogastric livestock species: towards optimal development of rabbit and pig holobionts
Coordinateur : Sylvie Combes (GenPhySE, INRAE)
Partenaires : GenPhySE, PEGASE, MICALIS, GABI, LEMM-CEA, IE PECTOUL, UE3PParticipants MaIAGE : Valentin Loux, Mouhamadou Ba, Claire Nédellec, Robert Bossy, Louise Deléger - Equipe(s) : Bibliome / Migale
HOLOVINI - INRAE Métaprogramme - Metaprogramme Holoflux- (2023-2026)
Titre : Microbiomes at the interface of the vineyard and the cellar
at the time of the agroecological transition
Coordinateur : I. Masneuf-Pomarede (INRAE, Bordeaux)
Partenaires : UMR Oenologie (Bordeaux), UMR SPO (Montpellier), UMR SAVE (Bordeaux), UMR Biogeco (Bordeaux), UMR CBGP (Montpellier), UMR EGFV (Bordeaux), UMR Agroecologie (Dijon), UMR ISPA (Boredeaux), UE Pech Rouge (Montpellier)Participants MaIAGE : A-L. Abraham, G. Kon Kam King - Equipe(s) : StatInfOmics
IMAGO - INRAE Métaprogramme - DIGIT-BIO- (2022-2024)
Titre : Imagerie et modélisation des dynamiques spatio-temporelles de la signalisation et du trafic des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG).
Coordinateur : Frédéric JEAN-ALPHONSE (CNRS, Tours)
Partenaires : PRC (Tours), MUSCA (INRIA Saclay), SERPICO (INRIA Rennes)Participants MaIAGE : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
InSync - ANR - Appel à projets générique 2022
Défi et/ou Axe : H.14. Interfaces : mathématiques, sciences du numérique – biologie, santé (2022-2027)
Titre : Circadian clock synchronization in hepatocytes
Coordinateur : M. Chaves (Inria, Sophia-Antipolis)
Partenaires : Inria (Sophia-Antipolis), Institut de Biologie de Valrose (Nice)Participants MaIAGE : L. Tournier, M. Mezache, A. Trubuil - Equipe(s) : BioSys
MetaSimFood - ANR - ANR Blanche
Défi et/ou Axe : Axe 1.5 Alimentation et Systèmes Alimentaires (2021 - 2025)
Titre : Improving the quality, safety and sustainability of fermented vegetable food and fruit beverage using a knowledge-driven synthetic ecology and modelling approach
Coordinateur : S. Chaillou (Micalis, INRAE)
Partenaires : Micalis (INRAE Jouy-en-Josas), SayFood (INRAE Versailles), Aérial (ITAI, Illkirch), UR Oenologie (Univ. Bordeaux), STLO-CIRM (INRAE, Rennes)Participants MaIAGE : M. Mariadassou, V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
MICROBE - H2020 - HORIZON-INFRA-2022-TECH-01-01 RIA- (2023-2026)
Titre : MICRObiome Biobanking (RI) Enabler
Coordinateur : Tanja KOSTIC - Austrian Institute of Technology (AIT)
Partenaires : AIT (AUS) - DSMZ (GER) - EMBL (UK) - CABI (UK) - HMGU (GER) - MUG (AUS) - SU (FR)Participants MaIAGE : Michel-Yves Mistou - Equipe(s) : StatInfOmics
MICROMOD - Institut Convergence - INCEPTION P2I (2022-2023)
Titre : Modelling the role of microbiota in the acquisition and transmission of antibiotic resistant pathogenic bacteria
Coordinateur : E. Vergu (MaIAGE); L. Opatowski (Institut Pasteur/UVSQ)
Partenaires : Epidemiology and Modelling of Antibiotic Evasion (EMAE) Unit (Institut Pasteur)Participants MaIAGE : B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
MIDIIVEC - INRAE Métaprogramme - DIGIT-BIO (2022-2024)
Titre : Modélisation et inférence de la dynamique d’infection intravecteur à partir de données expérimentales
Coordinateur : Gaël Beaunée
Partenaires : UMR1300 Oniris-INRAE BIOEPAR, Nantes; UMR754 INRAE-Univ Lyon- EPHE IVPCParticipants MaIAGE : Françosi Deslandes, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
MITOTIC (2nd soumission) - ITMO/ Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques et perspectives thérapeutiques : Apports à l’oncologie des mathématiques et de l’informatique- (2021)
Titre : Resource Balance Analysis pour découvrir la vulnérabilité métabolique dans le cancer et identifier de nouvelles thérapies
Coordinateur : Sabine Péres
Partenaires : LRI/UPSAParticipants MaIAGE : Fromion; Dinh; Goelzer - Equipe(s) : BioSys
MOSSAIC - ANR - ANR blanche
Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des microorganismes (2022-2024)
Titre : Deciphering the Mechanisms Of the heterogeneous Shedding of Salmonella in Chicken, and modelling the interactions between the host, the pathogen and the gut microbiota
Coordinateur : P. Velge (ISP, INRAE Tours)
Partenaires : ISP, TOXALIM, PFIE, PRCParticipants MaIAGE : B. Laroche (WP leader), F. Deslandes - Equipe(s) : Dynenvie
MOT - Contrat de coopération public - public ANSES- (2023-2025)
Titre : Micro-Organism in Text : développement de méthodes de text-mining et de la base de données Omnicrobe pour l’évaluation des risques microbiologiques
Coordinateur : Estelle Chaix (ANSES, Paris)
Partenaires : UERALIM (ANSES)Participants MaIAGE : M. Ba, R. Bossy, L. Deléger, S. Dérozier, V. Loux, C. Nédellec - Equipe(s) : Bibliome / Migale / StatInfOmics
MOTHERS - INRAE Métaprogramme - AMI HOLOFLUX- (2023-2024)
Titre : MONITORING THE GUT MICROBIOTA, RESISTANCE AGAINST SALMONELLA, ANIMAL PERFORMANCE AND IMMUNE RESPONSE THROUGH AN ADULT, PATHOGEN-FREE MICROBIOTA
Coordinateur : F. Kempf (ISP INRAE Tours)
Partenaires : ISP, PFIE, Univ. Munich, univ AachenParticipants MaIAGE : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie
MuDiS4LS - ANR - PIA3 / Appel à manifestations d’intérêt ESR-EquipEx+- (2021-2028)
Titre : Espaces numériques mutualisés pour des données FAIR en biologie-santé
Coordinateur : J. van Helden (IFB)
Partenaires : 17 partenairesParticipants MaIAGE : V. Loux, O. Rué, D. Berry, M. Ba, H. Chiapello, C. Midoux - Equipe(s) : Migale
MutaToR - ANR - AAPG2022-
Défi et/ou Axe : CE12 Génétique, génomique et ARN (2023-2026)
Titre : Mechanisms of mutational processes involving transcription and nucleotide-excision DNA repair
Coordinateur : J. Soutourina
Partenaires : J. Soutourina (CEA-CNRS-I2BC), F. Malloggi (LIONS-CEA)Participants MaIAGE : C. Guérin, G. Kon Kam King, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
PARTHAGE - ANR - AAPG 2022 (2023-2026)
Titre : Predicting antibiotic resistance transmission within and between humans by combining mathematical modelling, genomics and epidemiology
Coordinateur : L. Opatowski (Institut Pasteur/UVSQ)
Partenaires : UMR1018 CESP (UVSQ, Inserm, Institut Pasteur), 2I Unit (INSERM/UVSQ), EERA Unit (Institut Pasteur), GRAM 2.0 EA265 (UniCaen-UniRouen)Participants MaIAGE : B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
PEPR B-BEST Galaxy-BioProd - ANR - PEPR produits Biosurcés et nouvelles biotechnologies- (09/2023)
Titre : Un portail opérationnel pour la production de produits biosourcés
Coordinateur : J-L Faulon
Partenaires : IFB (CNRS), INSA, Supelec, IFPENParticipants MaIAGE : V. Loux - Equipe(s) : Migale
PheroSensor - ANR - Investissement d'Avenir "Cultiver et protéger autrement" (2021-2025)
Titre : Early detection of pest insects using pheromone receptor-based olfactory sensors
Coordinateur : P. Lucas (INRAE - UMR 1392, iEES Paris Sorbonne Université)
Partenaires : INRA - UMR 1392 iEES ; INRA - UR 1404 MaiAGE ; CEA - LIST ; CNRS - LORIA ; ESIEE - ESYCOM ; EGCE – IRDParticipants MaIAGE : K. Adamczyk, F. Deslandes, S. Labarthe (resp. WP), B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie
PHHASt - ANR - AAPG2022-
Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des micro-organismes (2022-2026)
Titre : Phenotypic heterogeneity and host adaptation during late infection in sporulating Firmicutes
Coordinateur : L. Slamti
Partenaires : L. Slamti (MICALIS), F. Neulat-Ripoll (IRBA)Participants MaIAGE : S. Dérozier, C. Guérin, P. Nicolas - Equipe(s) : StatInfOmics
PlantRBA - INRAE Métaprogramme - MP DIGITBIO (2021-2023)
Titre : Predicting plant phenotypes under combined stress using resource
allocation-based models
Coordinateur : A. Goelzer
Partenaires : IJPB (INRAE/AgroParisTech)Participants MaIAGE : O. Inizan, V. Fromion, E. Kuhn - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie
PolliHealth - Plan Ecophyto II+ – Appel à projets national 2021 – 2022-
Défi et/ou Axe : Axe 2 – Améliorer les connaissances et les outils pour demain et encourager la recherche et l’innovation. Thème « impact sur les pollinisateurs » (2022-2025)
Titre : PolliHealth – Renforcer les connaissances sur les risques associés aux pesticides sur les pollinisateurs dans différents contextes paysagers pour concevoir des paysages de santé
Coordinateur : Sabrina Gaba (Resilience, Chizey)Participants MaIAGE : Florence Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie
Stat4Plant - ANR - PRC-
Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé (2021-2025)
Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment
Coordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPBParticipants MaIAGE : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics
TANDEM - INRAE Métaprogramme - projets-phares HOLOFLUX- (2021-2023)
Titre : TrAnfers iN Dairy systEM
Coordinateur : C. Delbès, UMR Fromage, Aurillac
Partenaires : UR OPAALE, UMR Agroécologie, UREP, UMRH, UMR MEDIS, UMRF, UR LBE, UE Herbipôle, UMR Territoires, UMR InnovationParticipants MaIAGE : M. Mariadassou, A-L. Abraham, H. Chiapello, P. Nicolas, G. Kon-Kam-King - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
TyDI - (2021-2023)
Titre : Terminology Design Interface
Coordinateur : C. Nédellec (MaIAGE), S. Aubin (DipSO)
Partenaires : BIA (Nantes), DiBiSO (université Paris-Saclay), INIST (CNRS)Participants MaIAGE : Claire Nédellec, Robert Bossy, Mouhamadou Ba - Equipe(s) : Bibliome / Migale
WildPPVRes - INRAE Métaprogramme - AAP 2022 MP SuMcrop (2022-2023)
Titre : Comprendre les paramètres influant sur le devenir de résistances au virus dans un environnement naturel sans pression de sélection réciproque
Coordinateur : V. Decroocq (INRAE, BFP)
Partenaires : INRAE, BFP, BIOGECOParticipants MaIAGE : M. Delattre, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie