Le microbiote intestinal fournit à son hôte de nombreuses fonctions bénéfiques, incluant l’apport denutriments, la régulation du système immunitaire, ou une protection contre les pathogènes. En retour, l’hôtefaçonne l’environnement colique pour s’assurer que les bactéries fournissent ces services. Pour maintenir cesinteractions symbiotiques écosystémiques à l’échelle de l’organe, une myriade d’intéractions microscopiquesont lieu entre les bactéries, ou entre les bactéries et l’hôte. Pour décrypter ces mécanismes de régulationécosystémiques, des données à différentes échelles et de différentes résolutions doivent être articulées. Ceprojet a pour but de construire une méthodologie multidisciplinaire appropriée, qui améliore l’intégration dedonnées afin d’identifier de nouveaux mécanismes de régulation impliqués dans l’homéostasie du microbioteintestinal.