Lundi 2 décembre 2019

SĂ©minaire
Organisme intervenant (ou équipe pour les séminaires internes)
INRIA, IBIS
Nom intervenant
Aline Marguet
Titre
Héritabilité et variabilité des paramètres d'expression génique dans les populations de cellules.

Résumé

Les techniques expĂ©rimentales modernes permettent de suivre les dynamiques individuelles d'expression gĂ©nique et de quantifier leur variabilitĂ© dans des populations microbiennes isogĂ©niques. L'une des sources de cette variabilitĂ© est la stochasticitĂ© affectant l'hĂ©ritabilitĂ© des facteurs d'expression gĂ©nique lors de la division cellulaire. Les relations de parentĂ© entre les diffĂ©rentes cellules, qui peuvent ĂŞtre rĂ©cupĂ©rĂ©es grâce Ă  l'observation des cellules individuelles, constituent des informations prĂ©cieuses pour la caractĂ©risation de cette source extrinsèque de bruit dans l'expression gĂ©nique. 

Ă€ partir d'un modèle pour les mĂ©canismes de transcription et translation, je proposerai un modèle stochastique pour l'Ă©volution de la dynamique d'expression gĂ©nique dans une population de cellules et prĂ©senterai une mĂ©thode pour l'estimation de l'hĂ©ritabilitĂ© et de la variabilitĂ© des paramètres d'expression gĂ©nique Ă  partir de donnĂ©es individuelles d'expression gĂ©nique couplĂ©es aux informations de lignĂ©es. Je montrerai que notre approche fournit des estimateurs sans biais de l'hĂ©ritabilitĂ© alors que les techniques indirectes ont tendance Ă  la sous-estimer. Enfin, je prĂ©senterai l'application de notre mĂ©thode Ă  des donnĂ©es de rĂ©ponse de la levure Ă  des chocs osmotiques et les conclusions biologiques associĂ©es. Ce travail est issu d'une collaboration avec Eugenio Cinquemani et Marc Lavielle. 

Lieu
Salle de réunion 142, bâtiment 210
Date du jour