Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 

 

Lundi 20 février 2023

Séminaire
Organisme intervenant (ou équipe pour les séminaires internes)
INRAE IPS2 / UEVE, UMR 8071 LaMME
Nom intervenant
Guillem Rigaill
Titre
On the importance of having enough samples in omics
Résumé

I will discuss the importance of the number of replicates on the power and reproducibility of omics analysis and how this can affect the biological interpretation of data. I will illustrate this discussion using the differential analysis of RNA-seq data in plants. I will also present a few simulations showing that the often-decried "lack of reproducibility" is partly explained by the use of too few samples.
Joint work with Virginie Noël, Marie-Laure Martin, and Etienne Delannoy.

Lieu
Salle de réunion 142, bâtiment 210
Date du jour