Former projects

 


ACToP
- ANR- ANR blanche
Challenge and/or Axis : DEFI 1 – G ESTION SOBRE DES RESSOURCES ET ADAPTATION AU CHANGEMENT CLIMATIQUE Axe : Axe 1 : Comprendre et prévoir les évolutions de notre environnement
(2015-2019)
Title : Adaptation of a bacterial multispecies biofilm community to perturbations: a pluridisciplinary approach
Coordinator : Nelly Henry (Laboratoire Jean Perrin, CNRS UMR 8237)
Partners : Laboratoire Jean Perrin (CNRS UMR 8237), Institut MICALIS (INRA UMR1319)
MaIAGE Participants : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Team(s) : StatInfOmics

AMAIZING
- ANR- Investissement d'avenir - Initiatives d'Excellence "Biotechnologies et Bioressources" (2011-2019)
Title : Développer de nouvelles variétés de maïs pour une agriculture durable: une approche intégrée de la génomique à la sélection
Coordinator : A. Charcosset (INRA, Le Moulon)
Partners : UMR GV du Moulon, LEPSE Montpellier, UMR MIA Paris, ...
MaIAGE Participants : H. Monod, E. Kuhn - Team(s) : Dynenvie

Cecotype
- INRAE Métaprogramme- GISA- (2018-2019)
Title : Intensive genomic and phenotypic characterization of Enterococcus cecorum isolates
Coordinator : P. Serror (INRA, Micalis)
Partners : INRA Micalis, INRA ISP, INRA URA
MaIAGE Participants : V. Loux, A.-L. Abraham - Team(s) : Migale / StatInfOmics

COSAC
- ANR- productions durables (2014-2019)
Title : Évaluation et Conception de Stratégies durables de gestion des Adventices dans un contexte de Changement
Coordinator : Nathalie Colbach (INRA / EA - Dijon)
Partners : INRA 1347 Agroécologie (Dijon), INRA 1240 ECO-INNOV (Versailles), INRA 1132 LAE (Colmar), INRA 1115 PSH (Avignon), ACTA, ARVALIS, CETIOM, INVIVO AGROSOLUTIONS,
MaIAGE Participants : JP Gauchi - Team(s) : Dynenvie

Dallish
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : éfi : Société de l'information et de la communication Axe : Données, Connaissances , Données massives
(2016-2019)
Title : Data Assimilation and Lattice Light Sheet Imaging for endocytosis/exocytosis pathway modeling in the whole cell
Coordinator : C. Kervrann (INRIA Rennes)
Partners : INRIA-SERPICO, Institut Curie
MaIAGE Participants : A. Trubuil, S. Laparthe, B. Laroche - Team(s) : BioSys / Dynenvie

Domestichick
- ANR- ANR blanche (2013-2016)
Title : Génétique des populations de poules sauvages et domestiques.
Coordinator : M. Tixier-Boichard (GA)MaIAGE Participants : F. Rodolphe, M. Mariadassou - Team(s) : StatInfOmics

France Génomique
- ANR- Investissement d'avenir (2013-2019)
Title : France Génomique
Coordinator : P. Le Ber
Partners : La majorité des plateformes de séquençage et de bioinformatiques en France
MaIAGE Participants : V. Loux, V. Martin, J.-F. Gibrat, S. Schbath, V. Martin - Team(s) : Migale

GFLS
- IFB- (2016-2019)
Title : Galaxy For Life Science
Coordinator : O. Inizan (MaIAGE)
Partners : URGI, CATI Bios4Biol, Cirad, IRD, GABI
MaIAGE Participants : Olivier Inizan Valentin Marcon - Team(s) : Migale

GutMicrobiotaSpodo
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2017-2019)
Title : Description of the Gut Microbiota of a Lepidoptera pest, Spodoptera exigua
Coordinator : S. Gaudriault
Partners : INRA DGIMI (team BIBINE), INRA DGIMI (team DIDI), INRA MICALIS (team GME), INRA MICALIS (team B2L/DivY), CNRS IRBI
MaIAGE Participants : V. Loux, O. Rué - Team(s) : Migale

ICycle
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : Défi 7: Société de l'information et de la communication. Axe : Axe 2: Théorie du contrôle
(2017-01/2020)
Title : Interconnexion et contrôle de deux oscillateurs biologiques dans des cellules mammaliennes / Interconnection and feedback control of two cyclic modules in mammalian cells
Coordinator : M. Chaves (Inria, Sophia-Antipolis)
Partners : Inria (Sophia-Antipolis), IBV (Institut de Biologie de Valrose, Nice)
MaIAGE Participants : L. Tournier, V. Fromion, A. Goelzer - Team(s) : BioSys

ITEMAIZE
- Labex BASC (2016-2019)
Title : Integrative Approaches to Investigate Maize Floral Transition Network and its Evolution
Coordinator : C. DIllmann (INRA, GQE Le Moulon)
Partners : INRA GQE Le Moulon, IJPB, LEGS
MaIAGE Participants : E. Chaix, S. Huet, E. Kuhn (resp. MaIAGE), B. Laroche, C. Nédellec, O. David, S. Plancade, M.L. Taupin - Team(s) : Bibliome / Dynenvie

List_MAPS
- H2020- ITN (10/2015-12/2019)
Title : Training and research in Listeria monocytogenes Adaptation through Proteomic and Transcriptome deep Sequencing Analysis
Coordinator : P. Piveteau (Univ. Bourgogne, Dijon)
Partners : Univ. Bourgogne (Dijon), Univ. College Cork (Ireland), KOBENHAVNS Univ., NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, Wageningen Univ (Netherland), SYDDANSK UNIV, ...
MaIAGE Participants : P. Nicolas, V. Fromion, S. Schbath - Team(s) : BioSys / StatInfOmics

OpenMinTeD
- H2020- E-INFRA- (06/2015-05/2018)
Title : Open Mining INfrastructure for TExt and Data
Coordinator : Natalia Manola (ATHENA RESEARCH AND INNOVATION CENTER IN INFORMATION COMMUNICATION & KNOWLEDGE)
Partners : ARC, UNIVERSITY OF MANCHESTER, UKP-TUDA, INRA, EMBL, Agro-Know I.K.E, LIBER, UNIVERSITEIT VAN AMSTERDAM, Open University, EPFL, CNIO, USFD, GESIS, GRNET, Frontiers
MaIAGE Participants : C. Nédellec, R. Bossy, L. Deléger - Team(s) : Bibliome

PathoBactEvol
- ANR (2013-2016)
Title : Adaptation des bactéries pathogènes à des conditions particulières
Coordinator : V. Sanchis (INRA - MICA)MaIAGE Participants : F. Rodolphe, P. Nicolas, M. Maridassou - Team(s) : StatInfOmics

PREDIGE
- INRAE Métaprogramme- SELGEN (2018-2019)
Title : Prédiction des Interactions Génotype x Environnement
Coordinator : R. Rincent (INRA Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Ferrand)
Partners : INRA Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Ferrand
MaIAGE Participants : E. Kuhn, M. Delattre - Team(s) : Dynenvie

ProtéoCArdis
- ANR- ANR blanche-
Challenge and/or Axis : Vie Santé Bien-être
(2015-2019)
Title : FONCTIONALITES DU MICROBIOTE INTESTINAL ET MALADIE CARDIOMETABOLIQUE: APPROCHE PROTEOMIQUE
Coordinator : C. Juste (INRA, Jouy-en-Josas), C. Carapito (CNRS, Strasbourg)
Partners : MICALIS-PAPPSO (Jouy-en-Josas), LSBMO (Strasbourg), MetaGenoPolis-IBS (Jouy-en-Josas), ICAN (Paris),
MaIAGE Participants : O. David, A.-L. Abraham, S. Plancade, S. Huet - Team(s) : Dynenvie / StatInfOmics

SANT'Innov
- INRAE- PSDR GO- (11/2015-11/2019)
Title : Innover dans les filières de produits animaux pour concilier écologisation et compétitivité : perspective santé animale
Coordinator : F. Beaugrand (UMR BioEpAr, INRA-Oniris Nantes)
Partners : INRA-Oniris UMR 1300 BioEpAR Nantes; 8 autres partenaires
MaIAGE Participants : E. Vergu - Team(s) : Dynenvie

TANGO
- CNIEL- (2018-2020)
Title : Impact du procédé technologique sur l’expression des potentiels bactériens en fermentation laitière : exemple du fromage.
Coordinator : H. Falentin (STLO, Rennes)
Partners : STLO (Rennes)
MaIAGE Participants : S. Labarthe, B. Laroche - Team(s) : Dynenvie