Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 


CDD Engineer

DENECKER Thomas

La mission consiste à mettre en place un service de courtage de données (“data brokering”) à l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) en partenariat avec les infrastructures nationales productrices de données (France Génomique, France Bio Imaging, MetaboHub, PROFI, ...) et les ressources internationales d’archivage de données, en particulier, l’European Nucleotide Archive (ENA) de l’European Bioinformatics Institute (EBI).

SANCHEZ Anne-Carmen

Dans l'équipe StatInfOmics, nous développons un workflow d'analyse de la diversité intra-espèce bactérienne dans des données métagénomiques de microbiote intestinal humain. Dans le cadre d'une collaboration entre MaIAGE, Métagenopolis, ISP, BOA et GABI, nous prévoyons d’appliquer notre workflow à des données de microbiote de poulet.

FENG Yajing

Analyse des erreurs et extension de la méthode CONTES pour la normalisation des entités nommées par des ontologies. Applications aux données des habitats microbiens et des phénotypes microbiens et végétaux.