INIZAN Olivier

Dans le domaine de la biologie, l’arrivée des nouvelles technologies de séquençage a eu pour effet d’augmenter de façon conséquente la production des données tout en abaissant les coûts liés à leur production.

GUÉRIN Cyprien

Les systèmes de culture continue en bioréacteurs restent, malgré leur intérêt, peu utilisés dans les laboratoires de microbiologie. L’objectif de ce projet de thèse est de faciliter leur mise en œuvre en proposant un nouveau système modulaire de mini-bioréacteurs pilotés par ordinateur en s’appuyant sur les opportunités offertes par l’essor des technologies de fabrication numérique et des microcontrôleurs programmables.

BOROVIKOVA Mariya

Le projet de thèse porte sur l’extraction automatique et la modélisation de connaissances à partir de données textuelles sur les facteurs déterminant l'émergence de maladies de plantes dans une perspective de prévention de risque. Parmi ces informations, la connaissance scientifique des habitats des pathogènes, de leurs hôtes, de leur vecteurs de transmission, mais aussi les phénotypes et conditions d'habitabilité est nécessaire à l'anticipation de propagation à moyen terme.

BOROVIKOVA_Mariya

Le projet de thèse porte sur l’extraction automatique et la modélisation de connaissances à partir de données textuelles sur les facteurs déterminant l'émergence de maladies de plantes dans une perspective de prévention de risque. Parmi ces informations, la connaissance scientifique des habitats des pathogènes, de leurs hôtes, de leur vecteurs de transmission, mais aussi les phénotypes et conditions d'habitabilité est nécessaire à l'anticipation de propagation à moyen terme.

JUNKER Romane

Le projet de thèse proposé s’inscrit dans une démarche interdisciplinaire et un contexte de sciences ouvertes et participatives. Il vise à concevoir et mettre en œuvre des approches bioinformatiques et numériques innovantes pour analyser, comparer, interpréter et diffuser des jeux de données de données (meta)génomiques d’écosystèmes alimentaires fermentaires.