Un exemple qui a motivé ce projet concerne la mortalité de pins
maritimes suite à une maladie transmise par l'Armillaire (Armillaria
ostoye), champignon pathogène présent en Forêt Landaise. Les
premières traces de l'Armillaire ont été détectées au début de XXème
siècle dans la zone côtière des Landes où les plantations de pin ont
été réalisées pour fixer la dune. Depuis, on observe une
expansion lente de la maladie à partir de sources initiales.
Les données spatio-temporelles des mortalités associées à l'Armillaire
ont été recueillies sur une parcelle forestière entre 1985 et
2004. L'enjeu principal de cet étude était d'évaluer l'impact
respectif de deux sources de contamination : source primaire (les
souches de la forêt ancienne infestée par l'Armillaire) et source
secondaire (infections provenant de nouvelles plantations).
L'objectif de stage est de proposer un modèle de dynamique de champs
de Markov pour décrire la propagation de la mortalité causée par le
champignon et de l'ajuster aux données de suivi épidémique.
Une attention particulière sera portée sur l'intégration dans ce modèle
des variables environnementales d'intérêt ainsi que sur le choix de la
structure de voisinage,en lien avec la distance de dispersion de pathogène.