Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 


Comment le metabolisme agit sur la fertilité - Apport de l'approche par data mining

Organisme intervenant (ou équipe pour les séminaires internes)
UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements, INRAE Centre Val de Loire
Nom intervenant
Pascal Froment
Résumé

Chez l'Homme comme chez les autres mammifères, la nutrition et plus particulièrement le métabolisme énergétique influence la fonction de reproduction. Cependant les mécanismes qui sous-tendent les relations entre la nutrition, le métabolisme énergétique et la fonction de reproduction sont mal connus. Les informations de changements du statut nutritionnel et métabolique peuvent être transmis au cerveau et aux gonades à l'aide d'hormones ou de metabolites comme le glucose et les acides gras et sont resenties par les cellules à l'aide de recepteurs ou de kinases sensible aux changements de substrats. Le web est une source trés riche en information et des données/publications parfois anciennes ont deja pu identifier des voies de signalisation impliqués dans des phenomenes similaires. Pour pouvoir plus facilement cribler les proteines et voies susceptibles d'etre activées, nous avons utilisé une approche de "data mining" developpé par Migale qui nous permet d'identifier à partir de la litterature des genes qui sont impliqués dans ces interactions entre la fertilité et la reproduction. Au cours de la presentation, nous allons presenter la strategie que nous avons utilisé, et les applications que ces données ont permis de realiser ?

Lieu
Salle de réunion 142, bâtiment 210
Date du jour