Debbah Nagi
: Développement d'un workflow Snakemake pour la détection de pseudogènes - Master 1 - Université de Paris Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Dérozier, Hélène Chiapello -
Equipe(s) : StatInfOmics

Anne-Carmen Sanchez
: Analysis of microbial diversity in metagenomic datasets - Master 2 - Sorbonne université - ( - )
Encadrant(s) : Anne-Laure Abraham, Hélène Chiapello, Pierre Nicolas -
Equipe(s) : StatInfOmics

AH-LONE Sam
: Mise en place d'une application permettant l'alignement de génomes complets bactériens - Master Biosciences, Bio-Informatique 2ème année en apprentissage - Université de ROUEN Normandie - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Dérozier, Hélène Chiapello -
Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics

BENOIST Joffrey
: Développement d'un pipeline pour la détection de pseudogènes - Master 1 - Master Bio-informatique/Bio-statistiques et Magistère de biologie, Université Paris Sud Orsay - ( - )
Encadrant(s) : C. Coluzzi, V. Loux et H. Chiapello -
Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics

TANNEUR Irène
: Contrôle du taux de mutation spontanée dans la bactérie Bacillus subtilis - 5e année - INSA Lyon - ( - )
Encadrant(s) : Pierre Nicolas (MaIAGE), Matthieu Jules (MICALIS) -
Equipe(s) : StatInfOmics

NGUYEN-PHAM Khanh-Chi
: La caractérisation moléculaire de l’interaction Mfd -Mutation frequency decline et facteur de virulence- avec sa partenaire UvrA, deux protéines bactériennes. - M1 bioinformatique - Université Paris-Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Gwenaelle Andre-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

GHOUL Amina
: Etude de la distribution de longueurs des lectures produites par les technologies de séquençage de 3ème génération - Master 1 Mathématiques et interactions - Université d'Evry Val d'Essonne - ( - )
Encadrant(s) : Jean-François Gibrat -
Equipe(s) : StatInfOmics

EL DJOUDI Yassin
: Etude des polymorphismes intraspécifiques des espèces majoritaires du microbiote intestinal à partir de génomes séquencés - L3 sciences de la vie parcours bio-informatique - Université de Poitiers - ( - )
Encadrant(s) : Anne-Laure Abraham, Hélène Chiapello, Pierre Nicolas -
Equipe(s) : StatInfOmics

HARDY Clément
: Exploration des Méthodes d'analyse de données compositionnelles pour l'étude du lien entre microbiote instestinal et santé - Master 1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Magali Berland -
Equipe(s) : StatInfOmics

SAMSON Samantha
: Identification des homologues structuraux de PknB chez S. thermophilus. Validation in vitro. - Master 1 - Université des Sciences et Techniques de Paris Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Véronqiue Monnet (MICALIS) et Gwenaëlle André-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

DE MURAT Daniel
: Etude comparative d’outils d’analyses de données de séquençage métagénomiques - Master 1 de bioinformatique - Université Paris 7 - ( - )
Encadrant(s) : Anne-Laure Abraham, Olivier Rué -
Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics

BANKOLE Alexia
: Programmation d’un outil de construction de matrices d’occurrences de gènes dans des populations de génomes microbiens - L3 en double licence Sciences de la vie et informatique - Université Paris Saclay - Université Evry - ( - )
Encadrant(s) : Hélène Chiapello, Olivier Inizan -
Equipe(s) : StatInfOmics

ALBERT Solène
: Caractérisation in silico de la structure/fonction/pathogénie de Mfd -Mutation frequency decline- chez diverses souches de B. cereus. Validation in vitro. - Master 2 - Université des Sciences et Techniques de Paris Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Nalini RamaRao (MICALIS) ; Gwenaëlle André-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

DENOEUD Alexis
: Caractérisation structurale in silico de FstA de Streptococcus thermophilus - Licence L3 - Faculté des Sciences d'Orsay - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Gwenaëlle André-LerouxGwenaëlle André-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

XIE Hengjia
: Analyse statistique des changements métaboliques suite à une perturbation chez la chèvre - M2 - Université Paris-Descartes - ( - )
Encadrant(s) : Masoomeh Taghipoor, Sandra Plancade, Céline Domange -
Equipe(s) : StatInfOmics

DAOUDA OUMOU SALAMA Abdourahim
: Modélisation et estimation du phyllochrone du maïs. Etude des effets du génotype et de l'environnement - Master 1 - Institut de Statistique de l'Université Pierre et Marie Curie (ISUP) - ( - )
Encadrant(s) : Sylvie Huet, Sandra Plancade -
Equipe(s) : StatInfOmics

LAO Julie
: Comparaison de méthodes statistiques d'inférence de réseaux de co-occurences au sein d'écosystèmes microbiens à partir de données métagénomiques - Master Bioinformatique - Université Paris Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Sophie Schbath -
Equipe(s) : StatInfOmics

FROUIN Arthur
: Modèle de recombinaison dépendente de la distance phylogénétique - M2 Ingéniérie Statistique et Génome - UPSay - ( - )
Encadrant(s) : Pierre NICOLAS -
Equipe(s) : StatInfOmics

NGUYEN Thi-phuong-lien
: Update of GPCR automodel - Master 2 pro - Université d'Aix MArseille - ( - )
Encadrant(s) : Gwenaëlle André-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

CHAPUIS Emile
: Etude d'un jeu de données méta-protéomiques - M1 Mathématiques Appliquées - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Plancade, Sylvie Huet -
Equipe(s) : StatInfOmics

PATERNINA Janio
: Caractérisation in silico du récepteur olfactif PSGR - M1 BSSM - Génie Physiologique, Biotechnologique Informatique - Université de Poitiers - ( - )
Encadrant(s) : Gwenaëlle André-Leroux -
Equipe(s) : StatInfOmics

SHI Xiaohan
: Modélisation et estimation de l'abondance d'hippocampes sur le bassin d'Arcachon et l'étang de Thau en fonction de l'habitat - Master 2 Mathématiques appliquées - Ecole Polytechnique - ( - )
Encadrant(s) : Sylvie Huet -
Equipe(s) : StatInfOmics

PEILLET Stéphane
: Intégration d'outils et de workflows dans Galaxy : contrôle qualité et amélioration de la reproductibilité - Master 2 CI - ESME SUDRIA - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux, Franck Samson -
Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics

PRIVAT Martin
: Logiques cis-régulatrices dans le développement du cerveau moyen - Licence 3 - ENS - Lyon - ( - )
Encadrant(s) : Pierre Nicolas, Sophie Schbath -
Equipe(s) : StatInfOmics

BASTIDE Paul
: Shifted stochastic processes evolving on trees : application to models of adaptive evolution on phylogenies - Master 2: Mathématiques pour les Sciences du Vivant - Université Paris Sud - ( - )
Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Stéphane Robin -
Equipe(s) : StatInfOmics

GUARRACINO Yann
: Implémentation de workflows ngs dans un environnement galaxy - Master 1 : Biologie - Informatique - Université Paris Diderot - Paris7 - ( - )
Encadrant(s) : Sandra Derozier, Valentin Loux -
Equipe(s) : Migale, Equipe(s) : StatInfOmics

PAIN Adrien
: Typage Bactérien basé sur le pan-génome - Master 2 - Université Paris Diderot - ( - )
Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Philippe Bessières -
Equipe(s) : StatInfOmics

BLIN Camille
: Étude de la diversité génétique de souches de Lactobacillus delbrueckii et Propionibacterium Freudenreichii et lien avec leurs propriétés probiotiques - Master Biosciences - ENS Lyon - ( - )
Encadrant(s) : Mahendra Mariadassou, Philippe Bessières -
Equipe(s) : StatInfOmics