cAVIAR
- Appel à projets 2018 du plan Ecoantibio 2- (2019-2022)
Titre : cAVIAR : Enterococcus cecorum : Analyse de la VIrulence et de l’AntibioRésistance
Participants : V. Loux - Equipe(s) : Migale
Partenaires : Unité Mycoplasmologie Bactériologie et Antibiorésistance (Ploufragan), Micalis (Jouy en Josas)
Coordinateur : I. Kempf (Anses, Ploufragan)

IRONMANOMICS
- INRAE Métaprogramme- MEM- (2018-2020)
Titre : Exploring omics data for evaluating microbial interactions for iron
Participants : S Labarthe, B Laroche, V Loux - Equipe(s) : Dynenvie / Migale
Partenaires : MICALIS, MGP, MaIAGE, UMRF (Aurillac), ETH Zurich
Coordinateur : MC Champomier-Verges (Micalis, Jouy)

Meta PDO cheeses
- France Génomique- (2017-2021)
Titre : Nature et rôle des moteurs biotiques dans la construction des communautés microbiennes des fromages traditionnels
Participants : A.-L. Abraham, V. Loux, M. Mariadassou, O. Rué - Equipe(s) : Migale / StatInfOmics
Partenaires : INRA GMPA, INRA URF, INRA MICALIS, Genoscope, RMT Fromages de Terroir, CNAOL , CNIEL
Coordinateur : F. Irlinger (INRA, Grignon) ; C. Delbès (INRA, Aurillac)

REDLOSSES
- ANR- ANR blanche-
Défi et/ou Axe : Sécurité alimentaire et défi démographique
(2016-2020)
Titre : Réduction des pertes alimentaires par la prédiction des altérations microbiologiques
Participants : V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale
Partenaires : INRA-SECALIM, IFIP, INRA-MICALIS, Lubem, AERIAL, ITAVI, Cooperl Innovation, LDC, ULg-DDA
Coordinateur : Monique Zagorec (INRA-SECALIM)

µFlyAdapt
- INRAE Métaprogramme- AMI 2019 Holoflux - lettre d'intention- (2020-2021)
Titre : Rôle des interactions plantes-microbiotes dans l’adaptation d’un insecte ravageur à son hôte
Participants : V. Loux, O. Rué - Equipe(s) : Migale
Partenaires : IGEPP (Rennes), GenoSol (Dijon)
Coordinateur : C. Mougel (IGEPP, Rennes)