ModLSys- ANR- ANR PRC Défi et/ou Axe : CE45 - Interfaces : mathématiques, sciences du numérique - biologie, santé (2023-2028) Titre : A multi-scale modeling framework for living systems (2nd submission) Participants : A. Goelzer, O. Inizan, E. Kuhn - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie Partenaires : IJPB (INRAE, AgroParisTech), MICS (CentraleSupelec), IPSIM (INRAE, CNRS)Coordinateur : V. Fromion (MaIAGE)
ESCAPE- ANR- ANR aapg 2021 Défi et/ou Axe : CE21 - Alimentation et systèmes alimentaires (2022-2025) Titre : Caractérisation de l'interaction ayant lieu entre le pathogène Campylobacter et le microbiote de la viande de volaille en vue d'améliorer la sécurité sanitaire du produit Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : ONIRISCoordinateur : N. Haddad (ONIRIS, SECALIM, Nantes)
COCODIV- INRAE Métaprogramme- MP Sumcrop- (2022-2024) Titre : CO-occurrence des maladies en systèmes Céréaliers : déterminants, rÔle et
gestion de la DIVersité cultivée et sauvage de la parcelle au paysage
WildPPVRes - INRAE Métaprogramme- AAP 2022 MP SuMcrop (2022-2023) Titre : Comprendre les paramètres influant sur le devenir de résistances au virus dans un environnement naturel sans pression de sélection réciproque Participants : M. Delattre, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : INRAE, BFP, BIOGECOCoordinateur : V. Decroocq (INRAE, BFP)
SESRisks- INRAE Métaprogramme- MP XRISQUES- (2023-2026) Titre : Comprendre les sources et les impacts des risques multiples associés à la
transformation agroécologique sur le fonctionnement d’un socio-écosystème agricole
MOSSAIC- ANR- ANR blanche Défi et/ou Axe : CE20 Biologie des animaux, des organismes photosynthétiques et des microorganismes (2022-2024) Titre : Deciphering the Mechanisms Of the heterogeneous Shedding of Salmonella in Chicken, and modelling the interactions between the host, the pathogen and the gut microbiota Participants : B. Laroche (WP leader), F. Deslandes - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : ISP, TOXALIM, PFIE, PRCCoordinateur : P. Velge (ISP, INRAE Tours)
DYNAMO- INRAE- AAP SPE- (2022-2025) Titre : Déterminants des dynamiques épidémiques des rouilles brune et jaune du blé à l’échelle du paysage de la Zone Atelier Plaine & Val de Sèvre Participants : K. Adamczyk, F. Carpentier - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : Resilience (Chizey), BIOGER (Grignon), BioSP (Avignon), ISA (Sophia-Antipolis), Plant Pathology (Avignon)Coordinateur : Tiphaine Vidal
BioBrickEvolver- ANR- AAPG2018 - PRC Défi et/ou Axe : Vie, Santé et Bien-être / CES - Bioéconomie : technologies (chimie, biotechnologie, procédés) spécifiques et approches système (01/2019-06/2024) Titre : Développement d'un système pour la production de biobriques par évolution dirigée dans la bactérie Bacillus subtilis. Participants : P. Nicolas, C. Guérin, P. Hoscheit, C. Larédo, G. André-Leroux, H. Chiapello, V. Fromion, A. Goelzer - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie / StatInfOmics Partenaires : INRA MaIAGE, CNRS I2BC (Equipe P. Tavares), INRA MICALIS (Equipe M. Jules), CEA Cadarache (Equipe C. Berthomieu), TWB (O. Galy)Coordinateur : P. Nicolas (INRA, MaIAGE)
PheroSensor- ANR- Investissement d'Avenir "Cultiver et protéger autrement" (2021-2025) Titre : Early detection of pest insects using pheromone receptor-based olfactory sensors Participants : K. Adamczyk, F. Deslandes, S. Labarthe (resp. WP), B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : INRA - UMR 1392 iEES ; INRA - UR 1404 MaiAGE ; CEA - LIST ; CNRS - LORIA ; ESIEE - ESYCOM ; EGCE – IRDCoordinateur : P. Lucas (INRAE - UMR 1392, iEES Paris Sorbonne Université)
IMAGO- INRAE Métaprogramme- DIGIT-BIO- (2022-2024) Titre : Imagerie et modélisation des dynamiques spatio-temporelles de la signalisation et du trafic des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG). Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : PRC (Tours), MUSCA (INRIA Saclay), SERPICO (INRIA Rennes)Coordinateur : Frédéric JEAN-ALPHONSE (CNRS, Tours)
EggToMeat- INRAE Métaprogramme- HOLOFLUX (2021-2023) Titre : Impact de l’environnement d’élevage sur les flux bactériens en lien avec la santé, la robustesse des animaux et la qualité des produits chez le poulet de chair Participants : B. Laroche, M. Mariadassou, V. Loux, C. Hennequet-Antier - Equipe(s) : Dynenvie / Migale / StatInfOmics Partenaires : MICALIS, GABI, BOA, PEAT, EASM, ITAVI, ISP, SECALIMCoordinateur : M. Zagorec (SECALIM, Nantes)
Stat4Plant- ANR- PRC- Défi et/ou Axe : Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé (2021-2025) Titre : Méthodes statistiques pour caractériser les interactions entre la plante et son environnement/Statistics for characterizing interactions between plant and its environment Participants : M. Delattre, G. Kon Kam King, E. Kuhn - Equipe(s) : Dynenvie / StatInfOmics Partenaires : INRAE MIAP, INRAE GQE Le Moulon, CentraleSupelec MICS, UTC Heudiasysc, IJPBCoordinateur : E. Kuhn (INRAE, MaIAGE)
MIDIIVEC- INRAE Métaprogramme- DIGIT-BIO (2022-2024) Titre : Modélisation et inférence de la dynamique d’infection intravecteur à partir de données expérimentales Participants : Françosi Deslandes, Elisabeta Vergu - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : UMR1300 Oniris-INRAE BIOEPAR, Nantes; UMR754 INRAE-Univ Lyon- EPHE IVPCCoordinateur : Gaël Beaunée
MICROMOD- Institut Convergence- INCEPTION P2I (2022-2023) Titre : Modelling the role of microbiota in the acquisition and transmission of antibiotic resistant pathogenic bacteria Participants : B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : Epidemiology and Modelling of Antibiotic Evasion (EMAE) Unit (Institut Pasteur)Coordinateur : E. Vergu (MaIAGE); L. Opatowski (Institut Pasteur/UVSQ)
MOTHERS- INRAE Métaprogramme- AMI HOLOFLUX- (2023-2024) Titre : MONITORING THE GUT MICROBIOTA, RESISTANCE AGAINST SALMONELLA, ANIMAL PERFORMANCE AND IMMUNE RESPONSE THROUGH AN ADULT, PATHOGEN-FREE MICROBIOTA Participants : B. Laroche - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : ISP, PFIE, Univ. Munich, univ AachenCoordinateur : F. Kempf (ISP INRAE Tours)
PolliHealth- Plan Ecophyto II+ – Appel à projets national 2021 – 2022- Défi et/ou Axe : Axe 2 – Améliorer les connaissances et les outils pour demain et encourager la recherche et l’innovation. Thème « impact sur les pollinisateurs » (2022-2025) Titre : PolliHealth – Renforcer les connaissances sur les risques associés aux pesticides sur les pollinisateurs dans différents contextes paysagers pour concevoir des paysages de santé Participants : Florence Carpentier - Equipe(s) : DynenvieCoordinateur : Sabrina Gaba (Resilience, Chizey)
PARTHAGE- ANR- AAPG 2022 (2023-2026) Titre : Predicting antibiotic resistance transmission within and between humans by combining mathematical modelling, genomics and epidemiology Participants : B. Laroche, E. Vergu - Equipe(s) : Dynenvie Partenaires : UMR1018 CESP (UVSQ, Inserm, Institut Pasteur), 2I Unit (INSERM/UVSQ), EERA Unit (Institut Pasteur), GRAM 2.0 EA265 (UniCaen-UniRouen)Coordinateur : L. Opatowski (Institut Pasteur/UVSQ)
PlantRBA- INRAE Métaprogramme- MP DIGITBIO (2021-2023) Titre : Predicting plant phenotypes under combined stress using resource
allocation-based models Participants : O. Inizan, V. Fromion, E. Kuhn - Equipe(s) : BioSys / Dynenvie Partenaires : IJPB (INRAE/AgroParisTech)Coordinateur : A. Goelzer