Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement

 


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Les stagiaires


GAVILANES Kathya Viviana
: Métamodélisation pour la sélection de variables en grande dimension dans les modèles à effets mixtes complexes. Application en amélioration des plantes.
M2 - Université d'Evry Val d'Essonne : du au

Encadrant(s) : Maud Delattre, Marion Naveau - Equipe(s) : DynEnvie

POUPELIN Clément
: Meta-analyse exploratoire de jeux de données publics de différents écosystèmes microbiens de la chaîne alimentaire
Master 2 - Nantes Université : du au

Encadrant(s) : Christelle Hennequet-Antier, Cédric Midoux, Hélène Chiapello - Equipe(s) : Migale, StatInfOmics

JOUANAUD Yanis
: Predicting Microbial Community Interactions using Physics Informed Neural Networks.
M1 - Université Paris-Saclay : du au

Encadrant(s) : Lorenzo Sala (Dynenvie), Beatrice Laroche (Dynenvie), Hugo Gangloff (MIA Paris-Saclay), Nicolas Jouvin (MIA Paris-Saclay) - Equipe(s) : DynEnvie

SADAT Sofiane
: Generative AI and Large Language Models for biological sequence characterization
M2 - ENSIMAG : du au

Encadrant(s) : Arnaud FERRE, Guillaume KON KAM KING, Sofia LOTFI - Equipe(s) : Bibliome, StatInfOmics

POINTET Jeanne
: Champs de Markov sur réseau pour modéliser la propagation des maladies des arbres forestiers
M2 - ENSAI : du au

Encadrant(s) : Katarzyna Adamczyk, Anne Gégout-Petit - Equipe(s) : DynEnvie

BRUYERE Emeline
: Construction, caractérisation et visualisation de pangénomes bactériens à différentes échelles évolutives
M2 - Université Paris-Saclay : du au

Encadrant(s) : Guillaume Gautreau, Romane Junker, Sandra Dérozier, Hélène Chiapello - Equipe(s) : StatInfOmics

FRANCIS Juliette
: Explorations des méthodes d’intégration précoce (early integration) dans l'objectif de prédiction (ou de classification de catégories d’efficience alimentaire)
Master 2 - Université de Rennes : du au

Encadrant(s) : Yann Le Cunff, Quentin Le Graverand, Mahendra Mariadassou - Equipe(s) : StatInfOmics

DULOR Myriam
: Définir et évaluer des critères bibliographiques, linguistiques et biologiques de pertinence d’information sur les insectes vecteurs de maladies de plante dans une perspective historique
Master 2 - Université Paris-Nanterre : du au

Encadrant(s) : Claire Nédellec, Robert Bossy, Nicolas Sauvion - Equipe(s) : Bibliome