Mathématiques et Informatique Appliquées
du Génome à l'Environnement

 

 

Stage Master M2 - Extraction d’Information sur les maladies transmises par vecteurs chez les plantes

Duration
5
Start date
Application deadline

Le projet porte sur l’extraction automatique de relations biologiques à partir de documents. Il ciblera en priorité trois espèces particulières de psylles (insectes piqueurs suceurs) vecteurs de bactéries responsables de maladies des arbres fruitiers. Les événements représentant les interactions biologiques entre microbe, insecte, plante et leurs lieux et dates d’observation sont dénotés dans les textes scientifiques par des formulations complexes variables qui portent fréquemment sur plusieurs phrases. L’enjeu sera d’extraire ces événements (relations n-aires) par des méthodes d’apprentissage profond (deep learning, language models) avec un nombre limité d’exemples produits manuellement et à l’aide de bases de connaissance externes. 

To know more about it
Stage IEV.pdf286.48 KB
Contact Information
Claire Nédellec, claire.nedellec@inrae.fr
Vincent Guigue, vincent.guigue@agroparistech.fr
Nicolas Sauvion, nicolas.sauvion@inrae.fr