Antibiotic-resistance genes in various bacteria are the focus of intense attention given the global concern around the rise of multi-resistant pathogens. These genes come in several variants, and the precise identification of variants in samples is very useful to track antibiotic-resistance gene propagation. We identify the variants of antibiotic resistance genes and their relative abundances using shotgun metagenomic data collected on multiple samples.

Stage de découverte sur  l'application des maths appli. pour traiter et modéliser le fonctionnement des cellules procaryotes (aspects dynamiques).

Dans le contexte actuel de changement climatique, l'agriculture est au cœur des préoccupations, à la fois comme l'une des causes de ce processus, mais aussi du fait des bouleversements majeurs qu'elle subira et auxquels elle devra s'adapter.